TNRC6B - TNRC6B

TNRC6B
Identifikátory
Aliasy	TNRC6B, trinukleotidová repetice obsahující 6B, trinukleotidová repetice obsahující adaptér 6B
Externí ID	OMIM: 610740 MGI: 2443730 HomoloGene: 66194 Genové karty: TNRC6B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	40,335,808 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	80,941,085 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • P-tělo; • nukleoplazma;
Biologický proces	• umlčení posttranskripčního genu pomocí RNA; • pozitivní regulace zkrácení ocasu mRNA poly (A) transkripce nukleární energie; • regulace překladu; • pozitivní regulace jaderně transkribovaného katabolického procesu mRNA, rozpad závislý na deadenylaci; • umlčování genů pomocí RNA; • miRNA zprostředkovaná inhibice translace; • Signální dráha Wnt, dráha modulující vápník; • regulace diferenciace megakaryocytů; • pozitivní regulace genové exprese; • negativní regulace genové exprese; • umlčení genů miRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23112
	213988
	ENSG00000100354
	ENSMUSG00000047888
	Q9UPQ9
	Q8BKI2
	NM_015088; NM_001024843; NM_001162501
	NM_144812; NM_177124
	NP_001020014; NP_001155973; NP_055903
	NP_659061; NP_796098
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Trinukleotidový repetice obsahující gen 6B protein je protein že u lidí je kódován TNRC6B gen.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že TNRC6B komunikovat s EIF2C2.^[6] Je také známo, že se sdružuje s argonaute proteiny a ukázalo se, že je vyžadován pro miRNA - umlčování genů řízené v HeLa buňky.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100354 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047888 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrezův gen: trinukleotidová repetice TNRC6B obsahující 6B“.
^ Till S, Lejeune E, Thermann R, Bortfeld M, Hothorn M, Enderle D, Heinrich C, Hentze MW, Ladurner AG (říjen 2007). „Konzervovaný motiv v proteinech interagujících s Argonaute zprostředkovává funkční interakce prostřednictvím domény PIWI Argonaute“. Nat. Struct. Mol. Biol. 14 (10): 897–903. doi:10.1038 / nsmb1302. PMID 17891150.
^ Meister G, Landthaler M, Peters L, Chen PY, Urlaub H, Lührmann R, Tuschl T (prosinec 2005). "Identifikace nových proteinů spojených s argonaute". Curr. Biol. 15 (23): 2149–55. doi:10.1016 / j.cub.2005.10.048. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-E763-B. PMID 16289642.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Gubin AN, Njoroge JM, Bouffard GG, Miller JL (1999). "Genová exprese v proliferujících lidských erytroidních buňkách" (PDF). Genomika. 59 (2): 168–77. doi:10.1006 / geno.1999.5855. PMID 10409428.
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (3): 197–205. doi:10.1093 / dnares / 6.3.197. PMID 10470851.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA a kol. (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Schneider MD, Najand N, Chaker S a kol. (2006). „Gawky je součástí cytoplazmatických těl pro zpracování mRNA potřebných pro časný vývoj Drosophila“. J. Cell Biol. 174 (3): 349–58. doi:10.1083 / jcb.200512103. PMC 2064231. PMID 16880270.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100354 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047888 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrezův gen: trinukleotidová repetice TNRC6B obsahující 6B“.

[pmid17891150-6] Till S, Lejeune E, Thermann R, Bortfeld M, Hothorn M, Enderle D, Heinrich C, Hentze MW, Ladurner AG (říjen 2007). „Konzervovaný motiv v proteinech interagujících s Argonaute zprostředkovává funkční interakce prostřednictvím domény PIWI Argonaute“. Nat. Struct. Mol. Biol. 14 (10): 897–903. doi:10.1038 / nsmb1302. PMID 17891150.

[pmid16289642-7] Meister G, Landthaler M, Peters L, Chen PY, Urlaub H, Lührmann R, Tuschl T (prosinec 2005). "Identifikace nových proteinů spojených s argonaute". Curr. Biol. 15 (23): 2149–55. doi:10.1016 / j.cub.2005.10.048. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-E763-B. PMID 16289642.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]