THOC1 - THOC1

THOC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1WXP
Identifikátory
Aliasy	THOC1, HPR1, P84, P84N5, komplex THO 1
Externí ID	OMIM: 606930 MGI: 1919668 HomoloGene: 38012 Genové karty: THOC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 18 (lidský)
Konec	268,050 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 18 (myš)
Konec	9,995,489 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • transkripční exportní komplex; • jaderná matice; • mezibuněčný most; • THO komplex; • THO složitá součást transkripčního exportního komplexu; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• regulace rekombinace DNA; • transport mRNA; • Zpracování RNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace kontrolního bodu poškození DNA; • Zpracování mRNA; • regulace transkripce templátované DNA, prodloužení; • export virové mRNA z jádra hostitelské buňky; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce s templátem DNA, prodloužení; • negativní regulace přechodu izotypů na izotypy IgA; • Sestřih RNA; • zpracování replikační vidlice; • signální transdukce; • apoptotický proces; • Export RNA z jádra; • export mRNA z jádra; • Zpracování mRNA 3'-end;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9984
	225160
	ENSG00000079134
	ENSMUSG00000024287
	Q96FV9
	Q8R3N6
	NM_005131
	NM_153552
	NP_005122
	NP_705780
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

THO komplexní podjednotka 1 je protein že u lidí je kódován THOC1 gen.^[5]^[6]

HPR1 je součástí komplexu TREX (transkripce / export), který zahrnuje TEX1 (MIM 606929), THO2 (MIM 300395), ALY (MIM 604171) a UAP56 (MIM 606390). [Dodáváno společností OMIM]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že THOC1 komunikovat s Protein retinoblastomu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000079134 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024287 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Strasser K, Masuda S, Mason P, Pfannstiel J, Oppizzi M, Rodriguez-Navarro S, Rondon AG, Aguilera A, Struhl K, Reed R, Hurt E (květen 2002). „TREX je konzervovaná složitá vazebná transkripce s exportem messengerové RNA“. Příroda. 417 (6886): 304–8. Bibcode:2002 Natur.417..304S. doi:10.1038 / příroda746. PMID 11979277. S2CID 1112194.
^ ^A ^b „Entrez Gene: THOC1 THO komplex 1“.
^ Durfee, T; Mancini MA; Jones D; Elledge S J; Lee W H (listopad 1994). „Amino-koncová oblast produktu genu pro retinoblastom váže nový protein nukleární matrice, který se společně lokalizuje do center pro zpracování RNA“. J. Cell Biol. 127 (3): 609–22. doi:10.1083 / jcb.127.3.609. ISSN 0021-9525. PMC 2120229. PMID 7525595.

Další čtení

Durfee T, Mancini MA, Jones D a kol. (1994). „Amino-koncová oblast produktu genu pro retinoblastom váže nový protein nukleární matrice, který se společně lokalizuje do center pro zpracování RNA“. J. Cell Biol. 127 (3): 609–22. doi:10.1083 / jcb.127.3.609. PMC 2120229. PMID 7525595.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Dennehey BK, Gutches DG, McConkey EH, Krauter KS (2004). „Inverze, duplikace a změny v genovém kontextu jsou spojeny s vývojem lidského chromozomu 18“. Genomika. 83 (3): 493–501. doi:10.1016 / j.ygeno.2003.08.017. PMID 14962675.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gasparri F, Sola F, Locatelli G, Muzio M (2004). „Protein smrtící domény p84N5, ale ne krátká izoforma p84N5, je regulován buněčným cyklem a přepravuje se mezi jádrem a cytoplazmou.“ FEBS Lett. 574 (1–3): 13–9. doi:10.1016 / j.febslet.2004.07.074. PMID 15358532. S2CID 43023236.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Li Y, Wang X, Zhang X, Goodrich DW (2005). „Lidský hHpr1 / p84 / Thoc1 reguluje transkripční prodloužení a fyzicky spojuje RNA polymerázu II a faktory zpracování RNA“. Mol. Buňka. Biol. 25 (10): 4023–33. doi:10.1128 / MCB.25.10.4023-4033.2005. PMC 1087710. PMID 15870275.
Masuda S, Das R, Cheng H a kol. (2005). „Nábor lidského komplexu TREX do mRNA během sestřihu“. Genes Dev. 19 (13): 1512–7. doi:10.1101 / gad.1302205. PMC 1172058. PMID 15998806.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Li Y, Lin AW, Zhang X a kol. (2007). „Rakovinné buňky a normální buňky se liší ve svých požadavcích na Thoc1“. Cancer Res. 67 (14): 6657–64. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-3234. PMC 2804983. PMID 17638875.
Garner E, Martinon F, Tschopp J a kol. (2007). „Buňky s defektní cestou p53-p21-pRb jsou citlivé na apoptózu indukovanou p84N5 prostřednictvím kaspázy-6“. Cancer Res. 67 (16): 7631–7. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-0334. PMID 17699767.

Tento článek o gen na lidský chromozom 18 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000079134 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024287 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11979277-5] Strasser K, Masuda S, Mason P, Pfannstiel J, Oppizzi M, Rodriguez-Navarro S, Rondon AG, Aguilera A, Struhl K, Reed R, Hurt E (květen 2002). „TREX je konzervovaná složitá vazebná transkripce s exportem messengerové RNA“. Příroda. 417 (6886): 304–8. Bibcode:2002 Natur.417..304S. doi:10.1038 / příroda746. PMID 11979277. S2CID 1112194.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: THOC1 THO komplex 1“.

[pmid7525595-7] Durfee, T; Mancini MA; Jones D; Elledge S J; Lee W H (listopad 1994). „Amino-koncová oblast produktu genu pro retinoblastom váže nový protein nukleární matrice, který se společně lokalizuje do center pro zpracování RNA“. J. Cell Biol. 127 (3): 609–22. doi:10.1083 / jcb.127.3.609. ISSN 0021-9525. PMC 2120229. PMID 7525595.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]