TCIM - TCIM

TCIM
Identifikátory
Aliasy	TCIM, TC-1, TC1, C8orf4, otevřený čtecí rámec 4 chromozomu 8, regulátor transkripce a imunitní reakce
Externí ID	OMIM: 607702 MGI: 1916318 HomoloGene: 10590 Genové karty: TCIM
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	40,155,310 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	24,438,984 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vrubová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderná skvrna; • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • buněčná membrána; • intracelulární;
Biologický proces	• regulace fázového přechodu G1 / S buněčného cyklu; • aktivace endoteliálních buněk zapojená do imunitní odpovědi; • buněčná reakce na teplo; • regulace transkripce templátu DNA v reakci na stres; • regulace hemopoézy; • negativní regulace signální dráhy Notch; • apoptotický proces; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy A.; • negativní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace aktivity proteinkinázy C.; • pozitivní regulace signalizace NIK / NF-kappaB;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56892
	69068
	ENSG00000176907
	ENSMUSG00000056313
	Q9NR00
	Q9D915
	NM_020130
	NM_026931
	NP_064515
	NP_081207
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

TCIM je protein že u lidí je kódován TCIM gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje malý, monomerní, převážně nestrukturovaný protein (106 aminokyseliny, 12,3 kDa, izoelektrický bod 9.39).^[7] Je to pozitivní regulátor Wnt / beta-katenin signální dráha. Tento protein interaguje s represorem transkripce zprostředkované beta-kateninem v jaderných skvrnách. Předpokládá se, že kompetitivně blokuje interakce represoru s beta-kateninem, což vede k up-regulaci cílových genů beta-kateninu.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176907 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056313 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chua EL, Young L, Wu WM, Turtle JR, Dong Q (listopad 2000). „Klonování TC-1 (C8orf4), nového genu, u kterého bylo zjištěno, že je nadměrně exprimován u rakoviny štítné žlázy“. Genomika. 69 (3): 342–7. doi:10,1006 / geno.2000.6348. PMID 11056052.
^ ^A ^b „Entrez Gene: C8orf4 chromozom 8 otevřený čtecí rámec 4“.
^ Kozlowski LP (říjen 2016). „IPC - Isoelectric Point Calculator“. Biology Direct. 11 (1): 55. doi:10.1186 / s13062-016-0159-9. PMC 5075173. PMID 27769290.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Sunde M, McGrath KC, Young L, Matthews JM, Chua EL, Mackay JP, Death AK (duben 2004). „TC-1 je nový tumorigenní a nativně narušený protein spojený s rakovinou štítné žlázy“. Výzkum rakoviny. 64 (8): 2766–73. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-2093. PMID 15087392.
Friedman JB, Brunschwig EB, Platzer P, Wilson K, Markowitz SD (srpen 2004). „C8orf4 je transkript indukovaný transformujícím růstovým faktorem B downregulovaný u metastatického karcinomu tlustého střeva“. International Journal of Cancer. 111 (1): 72–5. doi:10.1002 / ijc.20235. PMID 15185345. S2CID 19983783.
Jung Y, Bang S, Choi K, Kim E, Kim Y, Kim J, Park J, Koo H, Moon RT, Song K, Lee I (leden 2006). „TC1 (C8orf4) zvyšuje dráhu Wnt / beta-katenin zmírněním antagonistické aktivity Chibbyho“. Výzkum rakoviny. 66 (2): 723–8. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-3124. PMID 16424001.
Kim B, Koo H, Yang S, Bang S, Jung Y, Kim Y, Kim J, Park J, Moon RT, Song K, Lee I (červen 2006). „TC1 (C8orf4) koreluje s cílovými geny Wnt / beta-katenin a agresivním biologickým chováním u rakoviny žaludku“. Klinický výzkum rakoviny. 12 (11 Pt 1): 3541–8. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2440. PMID 16740781.
Yang ZQ, Streicher KL, Ray ME, Abrams J, Ethier SP (prosinec 2006). „Několik interagujících onkogenů na amplikonu 8p11-p12 u lidské rakoviny prsu“. Výzkum rakoviny. 66 (24): 11632–43. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2946. PMID 17178857.
Yang ZQ, Moffa AB, Haddad R, Streicher KL, Ethier SP (září 2007). „Transformační vlastnosti TC-1 u lidské rakoviny prsu: interakce s FGFR2 a signálními cestami beta-kateninu“. International Journal of Cancer. 121 (6): 1265–73. doi:10.1002 / ijc.22831. PMID 17520678. S2CID 25292320.
Park J, Jung Y, Kim J, Kim KY, Ahn SG, Song K, Lee I (srpen 2007). „TC1 (C8orf4) je nadregulován buněčným stresem a zprostředkovává reakci na tepelný šok“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 360 (2): 447–52. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.06.077. PMID 17603013.

externí odkazy

Člověk C8orf4 umístění genomu a C8orf4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176907 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000056313 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11056052-5] Chua EL, Young L, Wu WM, Turtle JR, Dong Q (listopad 2000). „Klonování TC-1 (C8orf4), nového genu, u kterého bylo zjištěno, že je nadměrně exprimován u rakoviny štítné žlázy“. Genomika. 69 (3): 342–7. doi:10,1006 / geno.2000.6348. PMID 11056052.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: C8orf4 chromozom 8 otevřený čtecí rámec 4“.

[Kozlowski-7] Kozlowski LP (říjen 2016). „IPC - Isoelectric Point Calculator“. Biology Direct. 11 (1): 55. doi:10.1186 / s13062-016-0159-9. PMC 5075173. PMID 27769290.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]