TBCD - TBCD

TBCD
Identifikátory
Aliasy	TBCD, SSD-1, tfcD, tubulinový skládací kofaktor D, PEBAT
Externí ID	OMIM: 604649 MGI: 1919686 HomoloGene: 4368 Genové karty: TBCD
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	82,945,914 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	121,617,164 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• chaperonová vazba; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba beta-tubulinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • boční plazmatická membrána; • membrána; • dvoubuněčný těsný spoj; • adherens křižovatka; • buněčná membrána; • buněčné spojení; • mikrotubuly; • centrosome; • organizační centrum mikrotubulů; • cytoskelet;
Biologický proces	• negativní regulace adheze buněk k substrátu; • negativní regulace polymerace mikrotubulů; • sestava spojky adherens; • skládání bílkovin; • sestava dvoubunkového těsného spojení; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • skládací dráha po chaperoninu tubulinu; • GO: 0007067 mitotický buněčný cyklus; • buněčná morfogeneze podílející se na diferenciaci neuronů; • sestava tubulinového komplexu; • organizace mikrotubulů cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6904
	108903
	ENSG00000278759; ENSG00000141556
	ENSMUSG00000039230
	Q9BTW9
	Q8BYA0
	NM_001033052; NM_005993
	NM_029878
	NP_005984
	NP_084154
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chulinon specifický pro tubulin D je protein že u lidí je kódován TBCD gen.^[5]

Funkce

Kofaktor D je jedním ze čtyř proteinů (kofaktory A, D, E a C) zapojených do dráhy vedoucí ke správně složenému beta-tubulinu ze skládacích meziproduktů. Předpokládá se, že kofaktory A a D hrají roli při zachycování a stabilizaci beta-tubulinových meziproduktů v kvazi-nativním potvrzení. Kofaktor E se váže na komplex kofaktoru D / beta-tubulin; interakce s kofaktorem C pak způsobí uvolnění beta-tubulinových polypeptidů, které jsou vázány na nativní stav.^[5]

Interakce

TBCD bylo prokázáno komunikovat s ARL2.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000141556 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000278759, ENSG00000141556 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039230 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TBCD tubulin skládací kofaktor D".
^ Shern JF, Sharer JD, Pallas DC, Bartolini F, Cowan NJ, Reed MS, Pohl J, Kahn RA (říjen 2003). „Cytosolický Arl2 je v komplexu s kofaktorem D a proteinovou fosfatázou 2A“. J. Biol. Chem. 278 (42): 40829–36. doi:10,1074 / jbc.M308678200. PMID 12912990.
^ Bhamidipati A, Lewis SA, Cowan NJ (květen 2000). „Protein podobný ADP ribosylačnímu faktoru 2 (Arl2) reguluje interakci kofaktoru D skládajícího se s tubulinem s nativním tubulinem“. J. Cell Biol. 149 (5): 1087–96. doi:10.1083 / jcb.149.5.1087. PMC 2174823. PMID 10831612.

Další čtení

Lewis SA, Tian G, Vainberg IE, Cowan NJ (1996). "Chaperoninem zprostředkované skládání aktinu a tubulinu". J. Cell Biol. 132 (1–2): 1–4. doi:10.1083 / jcb.132.1.1. PMC 2120700. PMID 8567715.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Tian G, Huang Y, Rommelaere H, Vandekerckhove J, Ampe C, Cowan NJ (1996). "Cesta vedoucí ke správně složenému beta-tubulinu". Buňka. 86 (2): 287–96. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80100-2. PMID 8706133. S2CID 18359371.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Tian G, Lewis SA, Feierbach B, Stearns T, Rommelaere H, Ampe C, Cowan NJ (1997). „Tubulinové podjednotky existují v aktivovaném konformačním stavu generovaném a udržovaném proteinovými kofaktory“. J. Cell Biol. 138 (4): 821–32. doi:10.1083 / jcb.138.4.821. PMC 2138046. PMID 9265649.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
Martín L, Fanarraga ML, Aloria K, Zabala JC (2000). „Tubulinový skládací kofaktor D je protein destabilizující mikrotubuly“. FEBS Lett. 470 (1): 93–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01293-X. PMID 10722852. S2CID 35012741.
Bhamidipati A, Lewis SA, Cowan NJ (2000). „ADP protein podobný ribosylačnímu faktoru 2 (Arl2) reguluje interakci kofaktoru D skládajícího se s tubulinem s nativním tubulinem“. J. Cell Biol. 149 (5): 1087–96. doi:10.1083 / jcb.149.5.1087. PMC 2174823. PMID 10831612.
Schubert A, Cattaruzza M, Hecker M, Darmer D, Holtz J, Morawietz H (2001). "Smyková stresově závislá regulace lidského beta-tubulinového skládacího kofaktoru D genu". Circ. Res. 87 (12): 1188–94. doi:10.1161 / 01.res.87.12.1188. PMID 11110777.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). „Vyjádřená analýza sekvenčních značek lidského RPE / choroidu pro projekt NEIBank: více než 6000 neredundantních transkriptů, nových genů a variant sestřihu“. Mol. Vis. 8: 205–20. PMID 12107410.
Shern JF, Sharer JD, Pallas DC, Bartolini F, Cowan NJ, Reed MS, Pohl J, Kahn RA (2003). „Cytosolický Arl2 je v komplexu s kofaktorem D a proteinovou fosfatázou 2A“. J. Biol. Chem. 278 (42): 40829–36. doi:10,1074 / jbc.M308678200. PMID 12912990.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000141556 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000278759, ENSG00000141556 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039230 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: TBCD tubulin skládací kofaktor D".

[pmid12912990-6] Shern JF, Sharer JD, Pallas DC, Bartolini F, Cowan NJ, Reed MS, Pohl J, Kahn RA (říjen 2003). „Cytosolický Arl2 je v komplexu s kofaktorem D a proteinovou fosfatázou 2A“. J. Biol. Chem. 278 (42): 40829–36. doi:10,1074 / jbc.M308678200. PMID 12912990.

[pmid10831612-7] Bhamidipati A, Lewis SA, Cowan NJ (květen 2000). „Protein podobný ADP ribosylačnímu faktoru 2 (Arl2) reguluje interakci kofaktoru D skládajícího se s tubulinem s nativním tubulinem“. J. Cell Biol. 149 (5): 1087–96. doi:10.1083 / jcb.149.5.1087. PMC 2174823. PMID 10831612.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]