T-komplex 1 - T-complex 1

TCP1
Identifikátory
Aliasy	TCP1, CCT-alfa, CCT1, CCTa, D6S230E, TCP-1-alfa, T-komplex 1
Externí ID	OMIM: 186980 MGI: 98535 HomoloGene: 5656 Genové karty: TCP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	159,789,703 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	12,925,067 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba na bílkoviny zapojená do skládání bílkovin; • rozložená vazba na bílkoviny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné tělo; • cytosol; • centrosome; • Golgiho aparát; • pericentriolar materiál; • myelin; • organizační centrum mikrotubulů; • nukleární heterochromatin; • komplex receptoru zona pellucida; • heterochromatin; • Akrozom; • T-komplex obsahující chaperonin; • mikrotubuly; • extracelulární exosom; • cytoskelet;
Biologický proces	• sestava tubulinového komplexu; • pozitivní regulace lokalizace bílkovin do Cajalova těla; • pozitivní regulace zavedení proteinové lokalizace do telomer; • ScaRNA lokalizace do Cajalova těla; • regulace makrofágového apoptotického procesu; • stabilizace bílkovin; • pozitivní regulace udržování telomer prostřednictvím telomerázy; • transport toxinů; • skládání bílkovin; • pozitivní regulace aktivity telomerázy; • translokace peptidů nebo proteinů do cytoplazmy hostitelských buněk; • pozitivní regulace lokalizace telomerasové RNA do Cajalova těla; • vazba spermií na zona pellucida; • skládání bílkovin „de novo“; • skládání proteinů zprostředkované chaperonem; • interleukin-12 zprostředkovaná signální dráha;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6950
	21454
	ENSG00000120438
	ENSMUSG00000068039
	P17987
	P11983
	NM_030752; NM_001008897
	NM_001290712; NM_013686
	NP_001008897; NP_110379
	NP_001277641; NP_038714
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

T-komplex protein 1 podjednotka alfa je protein že u lidí je kódován TCP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje molekulární chaperon, který je členem TRiC komplex. Tento komplex se skládá ze dvou identických skládaných kruhů, z nichž každý obsahuje osm různých proteinů. Rozložené polypeptidy vstupují do centrální dutiny komplexu a jsou složeny způsobem závislým na ATP. Komplex skládá různé proteiny, včetně aktinu a tubulinu. Byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty tohoto genu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že T-komplex 1 komunikovat s PPP4C^[8]^[9] a HDAC3.^[10] CCT také přímo interaguje s LDL receptorem-1 (LOX-1) oxidovaným lektinovým typem, zatímco jeho ligandem oxidovaný lipoprotein s nízkou hustotou (OxLDL) disociuje CCT z LOX-1.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120438 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068039 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fonatsch C, Gradl G, Ragoussis J, Ziegler A (říjen 1987). "Přiřazení lokusu TCP1 k dlouhému rameni lidského chromozomu 6 hybridizací in situ". Cytogenet Cell Genet. 45 (2): 109–12. doi:10.1159/000132439. PMID 3476253.
^ Willison K, Kelly A, Dudley K, Goodfellow P, Spurr N, Groves V, Gorman P, Sheer D, Trowsdale J (listopad 1987). „Lidský homolog myšího genu pro t-komplex, TCP1, se nachází na chromozomu 6, ale není v blízkosti oblasti HLA.“. EMBO J.. 6 (7): 1967–74. doi:10.1002 / j.1460-2075.1987.tb02459.x. PMC 553584. PMID 3653076.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TCP1 t-complex 1“.
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. J. Biol. Chem. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.
^ Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932.
^ Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (prosinec 2002). „Sestavení represivního komplexu SMRT – histon-deacetyláza 3 vyžaduje kruhový komplex TCP-1“. Genes Dev. 16 (24): 3130–5. doi:10.1101 / gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735.
^ Bakthavatsalam D, Soung RH, Tweardy DJ, Chiu W, Dixon RA, Woodside DG (červen 2014). „Komplex TCP-1 obsahující chaperonin se přímo váže na cytoplazmatickou doménu receptoru LOX-1“. FEBS Lett. 588 (13): 2133–40. doi:10.1016 / j.febslet.2014.04.049. PMC 4100626. PMID 24846140.

Další čtení

Horwich AL, Willison KR (1993). "Složení proteinů v buňce: funkce dvou rodin molekulárního chaperonu, hsp 60 a TF55-TCP1". Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 339 (1289): 313–25, diskuse 325–6. doi:10.1098 / rstb.1993.0030. PMID 8098536.
Burston SG, Clarke AR (1997). "Molekulární chaperony: fyzikální a mechanické vlastnosti". Eseje Biochem. 29: 125–36. PMID 9189717.
Blanché H, Wright LG, Vergnaud G, de Gouyon B, Lauthier V, Silver LM, Dausset J, Cann HM, Spielman RS (1992). „Genetické mapování tří lidských homologů genů myšího t-komplexu lokalizuje TCP10 až 6q27, 15 cM distálně od TCP1 a PLG“. Genomika. 12 (4): 826–8. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90317-L. PMID 1572657.
Dawson SJ, White LA (1992). „Léčba endokarditidy Haemophilus aphrophilus ciprofloxacinem“. J. Infect. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Yaffe MB, Farr GW, Miklos D, Horwich AL, Sternlicht ML, Sternlicht H (1992). „Komplex TCP1 je molekulární chaperon v biogenezi tubulinu“. Příroda. 358 (6383): 245–8. Bibcode:1992 Natur.358..245Y. doi:10.1038 / 358245a0. PMID 1630491. S2CID 4287521.
Lewis VA, Hynes GM, Zheng D, Saibil H, Willison K (1992). „T-komplex polypeptid-1 je podjednotkou heteromerní částice v eukaryotickém cytosolu“. Příroda. 358 (6383): 249–52. Bibcode:1992 Natur.358..249L. doi:10.1038 / 358249a0. PMID 1630492. S2CID 4306360.
Ursic D, Culbertson MR (1991). „Homolog kvasinek s myší Tcp-1 ovlivňuje procesy zprostředkované mikrotubuly“. Mol. Buňka. Biol. 11 (5): 2629–40. doi:10,1128 / mcb.11.5.2629. PMC 360032. PMID 1901944.
Kirchhoff C, Willison K (1990). „Nukleotidová a aminokyselinová sekvence TCP1 odvozeného z lidských varlat“. Nucleic Acids Res. 18 (14): 4247. doi:10.1093 / nar / 18.14.4247. PMC 331189. PMID 2377466.
Roobol A, Holmes FE, Hayes NV, Baines AJ, Carden MJ (1995). „Cytoplazmatické chaperoninové komplexy vstupují do neuritů vyvíjejících se in vitro a liší se složením podjednotek v jednotlivých buňkách“. J. Cell Sci. 108 (4): 1477–88. PMID 7615668.
Ashworth A (1994). „Dva geny acetyl-CoA acetyltransferázy umístěné v oblasti t-komplexu myšího chromozomu 17 částečně překrývají geny Tcp-1 a Tcp-1x“. Genomika. 18 (2): 195–8. doi:10.1006 / geno.1993.1454. PMID 7904580.
Miklos D, Caplan S, Mertens D, Hynes G, Pitluk Z, Kashi Y, Harrison-Lavoie K, Stevenson S, Brown C, Barrell B (1994). „Primární struktura a funkce druhého podstatného člena heterooligomerního kvasinkového komplexu TCP1 chaperonin, TCP1 beta“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (7): 2743–7. Bibcode:1994PNAS ... 91,2743 mil. doi:10.1073 / pnas.91.7.2743. PMC 43446. PMID 7908441.
Chen X, Sullivan DS, Huffaker TC (1994). „Pro funkci mikrotubulů a aktinů in vivo jsou vyžadovány dva kvasinkové geny podobné TCP-1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (19): 9111–5. Bibcode:1994PNAS ... 91.9111C. doi:10.1073 / pnas.91.19.9111. PMC 44757. PMID 7916460.
Kubota H, Hynes G, Carne A, Ashworth A, Willison K (1994). "Identifikace šesti genů souvisejících s Tcp-1 kódujících divergentní podjednotky chaperoninu obsahujícího TCP-1". Curr. Biol. 4 (2): 89–99. doi:10.1016 / S0960-9822 (94) 00024-2. PMID 7953530. S2CID 31300131.
Frydman J, Hartl FU (1996). „Principy skládání proteinů s podporou chaperonu: rozdíly mezi mechanismy in vitro a in vivo“. Věda. 272 (5267): 1497–502. Bibcode:1996Sci ... 272.1497F. doi:10.1126 / science.272.5267.1497. PMID 8633246. S2CID 22363826.
Moudjou M, Bordes N, Paintrand M, Bornens M (1996). „gama-tubulin v savčích buňkách: centrosomální a cytosolická forma“. J. Cell Sci. 109 (4): 875–87. PMID 8718679.
Morrison K, Papapetrou C, Attwood J, Hol F, Lynch SA, Sampath A, Hamel B, Burn J, Sowden J, Stott D, Mariman E, Edwards YH (1997). „Genetické mapování lidského homologu (T) myšího T (Brachyury) a hledání asociace alely mezi lidským T a spina bifida“. Hučení. Mol. Genet. 5 (5): 669–74. doi:10,1093 / hmg / 5,5,669. PMID 8733136.
Masuno M, Fukao T, Song XQ, Yamaguchi S, Orii T, Kondo N, Imaizumi K, Kuroki Y (1997). „Přiřazení genu lidského cytosolického acetoacetyl-koenzymu A thiolázy (ACAT2) k chromozomu 6q25.3-q26“. Genomika. 36 (1): 217–8. doi:10.1006 / geno.1996.0452. PMID 8812443.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120438 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068039 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid3476253-5] Fonatsch C, Gradl G, Ragoussis J, Ziegler A (říjen 1987). "Přiřazení lokusu TCP1 k dlouhému rameni lidského chromozomu 6 hybridizací in situ". Cytogenet Cell Genet. 45 (2): 109–12. doi:10.1159/000132439. PMID 3476253.

[pmid3653076-6] Willison K, Kelly A, Dudley K, Goodfellow P, Spurr N, Groves V, Gorman P, Sheer D, Trowsdale J (listopad 1987). „Lidský homolog myšího genu pro t-komplex, TCP1, se nachází na chromozomu 6, ale není v blízkosti oblasti HLA.“. EMBO J.. 6 (7): 1967–74. doi:10.1002 / j.1460-2075.1987.tb02459.x. PMC 553584. PMID 3653076.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TCP1 t-complex 1“.

[pmid18715871-8] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. J. Biol. Chem. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.

[pmid16085932-9] Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932.

[pmid12502735-10] Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (prosinec 2002). „Sestavení represivního komplexu SMRT – histon-deacetyláza 3 vyžaduje kruhový komplex TCP-1“. Genes Dev. 16 (24): 3130–5. doi:10.1101 / gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735.

[pmid24846140-11] Bakthavatsalam D, Soung RH, Tweardy DJ, Chiu W, Dixon RA, Woodside DG (červen 2014). „Komplex TCP-1 obsahující chaperonin se přímo váže na cytoplazmatickou doménu receptoru LOX-1“. FEBS Lett. 588 (13): 2133–40. doi:10.1016 / j.febslet.2014.04.049. PMC 4100626. PMID 24846140.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]