Syndecan-3 - Syndecan-3

SDC3
Identifikátory
Aliasy	SDC3, SDCN, SYND3, syndecan 3
Externí ID	OMIM: 186357 MGI: 1349163 HomoloGene: 7965 Genové karty: SDC3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	30,908,758 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	130,826,319 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • lysozomální lumen; • Golgiho lumen; • povrch buňky; • extracelulární matrix; • extracelulární matrix obsahující kolagen; • mikrospike;
Biologický proces	• metabolický proces glykosaminoglykanu; • metabolický proces retinoidů; • glykosaminoglykan katabolický proces; • proces biosyntézy glykosaminoglykanu; • migrace leukocytů; • migrace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9672
	20970
	ENSG00000162512
	ENSMUSG00000025743
	O75056
	Q64519
	NM_014654
	NM_011520
	NP_055469
	NP_035650
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Syndecan-3 je protein že u lidí je kódován SDC3 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162512 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025743 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Carey DJ, Evans DM, Stahl RC, Asundi VK, Conner KJ, Garbes P, Cizmeci-Smith G (květen 1992). „Molekulární klonování a charakterizace N-syndekanu, nového transmembránového proteoglykanu heparan sulfátu“. J Cell Biol. 117 (1): 191–201. doi:10.1083 / jcb.117.1.191. PMC 2289399. PMID 1556152.
^ Berndt C, Casaroli-Marano RP, Vilaro S, Reina M (srpen 2001). "Klonování a charakterizace lidského syndekanu-3". J Cell Biochem. 82 (2): 246–59. doi:10.1002 / jcb.1119. PMID 11527150.
^ „Entrez Gene: SDC3 syndecan 3“.

Další čtení

Barillari G, Gendelman R, Gallo RC, Ensoli B (1993). „Tat protein viru lidské imunodeficience typu 1, růstový faktor pro AIDS Kaposiho sarkom a vaskulární buňky aktivované cytokiny, indukuje adhezi stejných typů buněk pomocí integrinových receptorů rozpoznávajících aminokyselinovou sekvenci RGD.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (17): 7941–5. doi:10.1073 / pnas.90.17.7941. PMC 47263. PMID 7690138.
Raulo E, Chernousov MA, Carey DJ a kol. (1994). "Izolace neuronového buněčného povrchového receptoru molekuly spojené s růstem vázající se na heparin (HB-GAM). Identifikace jako N-syndekan (syndekan-3)". J. Biol. Chem. 269 (17): 12999–3004. PMID 8175719.
Černousov MA, Carey DJ (1993). „N-syndekan (syndekan 3) z mozku potkana novorozence váže základní růstový faktor fibroblastů“. J. Biol. Chem. 268 (22): 16810–4. PMID 8344959.
Albini A, Benelli R, Presta M a kol. (1996). „HIV-tat protein je heparin vázající angiogenní růstový faktor“. Onkogen. 12 (2): 289–97. PMID 8570206.
Černousov MA, Stahl RC, Carey DJ (1996). „Schwannovy buňky vylučují nový adhezivní protein podobný kolagenu, který váže N-syndekan“. J. Biol. Chem. 271 (23): 13844–53. doi:10.1074 / jbc.271.23.13844. PMID 8662884.
Nakanishi T, Kadomatsu K, Okamoto T a kol. (1997). "Exprese syndekanu-1 a -3 během embryogeneze centrálního nervového systému ve vztahu k vazbě s midkinem". J. Biochem. 121 (2): 197–205. PMID 9089390.
Rusnati M, Coltrini D, Oreste P a kol. (1997). "Interakce proteinu HIV-1 Tat s heparinem. Role struktury páteře, sulfatace a velikosti". J. Biol. Chem. 272 (17): 11313–20. doi:10.1074 / jbc.272.17.11313. PMID 9111037.
Chang HC, Samaniego F, Nair BC a kol. (1997). „HIV-1 Tat protein vystupuje z buněk sekreční cestou bez vedoucího proteinu a váže se na svou bazální oblast na proteoglykany heparansulfátu spojené s extracelulární matricí“. AIDS. 11 (12): 1421–31. doi:10.1097/00002030-199712000-00006. PMID 9342064.
Asundi VK, Carey DJ (1997). "Fosforylace rekombinantního N-syndekanového (syndekan 3) jádrového proteinu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 240 (2): 502–6. doi:10.1006 / bbrc.1997.7684. PMID 9388509.
Seki N, Ohira M, Nagase T a kol. (1998). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". DNA Res. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
Kinnunen T, Kaksonen M, Saarinen J a kol. (1998). „Kortaktin-Src kinázová signální dráha je zapojena do růstu neuritů závislých na N-syndekanu“. J. Biol. Chem. 273 (17): 10702–8. doi:10.1074 / jbc.273.17.10702. PMID 9553134.
Hsueh YP, Sheng M (1999). "Regulovaná exprese a subcelulární lokalizace syndekan heparansulfátových proteoglykanů a syndekan vázajícího proteinu CASK / LIN-2 během vývoje mozku krysy". J. Neurosci. 19 (17): 7415–25. doi:10.1523 / JNEUROSCI.19-17-07415.1999. PMID 10460248.
Rusnati M, Tulipano G, Spillmann D a kol. (1999). „Vícenásobné interakce proteinu HIV-I Tat s velikostí definovaných heparinových oligosacharidů“. J. Biol. Chem. 274 (40): 28198–205. doi:10.1074 / jbc.274.40.28198. PMID 10497173.
Tyagi M, Rusnati M, Presta M, Giacca M (2001). „Internalizace HIV-1 tat vyžaduje proteoglykany heparansulfátu na buněčném povrchu“. J. Biol. Chem. 276 (5): 3254–61. doi:10,1074 / jbc.M006701200. PMID 11024024.
Koroll M, Rathjen FG, Volkmer H (2001). „Molekula neurofascinu pro rozpoznávání neurálních buněk interaguje se synteninem-1, ale ne se synteninem-2, přičemž obě tyto látky odhalují samoasociovací aktivitu.“. J. Biol. Chem. 276 (14): 10646–54. doi:10,1074 / jbc.M010647200. PMID 11152476.
Hakansson S, Jacobs A, Caffrey M (2001). „Vazba heparinu prostřednictvím transdukční domény proteinu HIV-1 tat“. Protein Sci. 10 (10): 2138–9. doi:10.1110 / ps.23401. PMC 2374215. PMID 11567105.
Erdman R, Stahl RC, Rothblum K a kol. (2002). „Adheze Schwannových buněk k novému vazebnému místu heparan sulfátu v N-terminální doméně kolagenu alfa 4 typu V je zprostředkována syndekanem-3“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7619–25. doi:10,1074 / jbc.M111311200. PMID 11751872.
Alvarez K, Fadic R, Brandan E (2002). „Rozšířená syntéza a diferenciální lokalizace heparansulfátových proteoglykanů u Duchennovy svalové dystrofie“. J. Cell. Biochem. 85 (4): 703–13. doi:10.1002 / jcb.10184. PMID 11968010.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162512 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025743 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1556152-5] Carey DJ, Evans DM, Stahl RC, Asundi VK, Conner KJ, Garbes P, Cizmeci-Smith G (květen 1992). „Molekulární klonování a charakterizace N-syndekanu, nového transmembránového proteoglykanu heparan sulfátu“. J Cell Biol. 117 (1): 191–201. doi:10.1083 / jcb.117.1.191. PMC 2289399. PMID 1556152.

[pmid11527150-6] Berndt C, Casaroli-Marano RP, Vilaro S, Reina M (srpen 2001). "Klonování a charakterizace lidského syndekanu-3". J Cell Biochem. 82 (2): 246–59. doi:10.1002 / jcb.1119. PMID 11527150.

[entrez-7] „Entrez Gene: SDC3 syndecan 3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]