Sulfolobus turreted icosahedral virus 1 - Sulfolobus turreted icosahedral virus 1

Sulfolobus turreted icosahedral virus 1
Emd-5584.jpg
4,5 Å struktura Ikosahedrální virus s turbulentním sírem 1 určeno cryoEM. EMDB vstup EMD-1569, PDB vstup 3j31.[1]
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Varidnaviria
Království:Bamfordvirae
Kmen:Preplasmiviricota
Třída:Tectiliviricetes
Objednat:Belfryvirales
Rodina:Turriviridae
Rod:Alphaturrivirus
Druh:
Sulfolobus turreted icosahedral virus 1

Sulfolobus turreted icosahedral virus 1 (dříve Sulfolobus turreted icosahedral virus) je druh viru, který infikuje archeona Sulfolobus solfataricus.[2][3][4]

Dějiny

Tento virus byl izolován z horkého pramene v termální oblasti Rabbit Creek, která se nachází v oblasti Gejzírská pánev Midway z Yellowstonský národní park.[5]

Virologie

Je to icosahedrally symetrický virus s jedinečným triangulační číslo (T) z 31. Na 12 pětinásobných symetrických polohách dvacetistěnu vyčnívají "věže", které sahají 13 nanometrů (nm) nad kapsid povrch. Věže mají průměr průměr 24 nm. Střed každé věže obsahuje ~ 3 nm kanál. Funkce tohoto kanálu není známa, ale může poskytovat přístup mezi vnitřkem a vnějškem virionu. Zdá se, že na každém konci kanálu je hustota, což naznačuje, že kanál může být blokován, a naznačuje možnou regulační roli spojenou s touto hustotou.

Existuje pět strukturních proteinů: hlavní protein o hmotnosti 37 kiloDaltonů (kDa) a několik vedlejších proteinů s odhadovanou hmotností 75, 25, 12,5 a 10 kDa. Hlavní kapsidový protein je převážně β-fólie.

Genom je kruhová dvouvláknová DNA o délce 17 663 kilobází s 36 otevřenými čtecími rámečky. Genom má G + C obsah 36%.

Na rozdíl od jiných virů, které buď lýzují, nebo budují ze svých hostitelů, tento virus indukuje na povrchu hostitele, ze kterého buduje, jedinečnou strukturu podobnou pyramidě.

Reference

  1. ^ Veesler, D .; Ng, T.-S .; Sendamarai, A. K .; Eilers, B. J .; Lawrence, C. M .; Lok, S.-M .; Young, M. J .; Johnson, J. E .; Fu, C. -Y. (2013). „Atomová struktura 75 MDa extremofilního turbulentního ikosahedrálního viru Sulfolobus stanovena kryoEM a rentgenovou krystalografií“. Sborník Národní akademie věd. 110 (14): 5504–5509. doi:10.1073 / pnas.1300601110. PMC  3619359. PMID  23520050.
  2. ^ Návrhy ICTV 2013.002a-gB a kol. „Vytvořit rodinu Turriviridae, zahrnující nový rod, Alphaturrivirusa dva nové druhy “, Mark Young a kol.
  3. ^ Taxonomie virů: vydání 2014, Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Přístup na linku 25. listopadu 2015.
  4. ^ Happonen, L. J .; Redder, P; Peng, X; Reigstad, L. J .; Prangishvili, D; Butcher, S. J. (2010). „Rodinné vztahy u hypertermních a acidofilních virů archaeal“. Journal of Virology. 84 (9): 4747–4754. doi:10.1128 / JVI.02156-09. PMC  2863766. PMID  20164227..
  5. ^ Rice, G. (2004). „Struktura termofilního archaálního viru ukazuje dvouvláknový typ virové kapsidy DNA, který pokrývá všechny oblasti života“. Sborník Národní akademie věd. 101 (20): 7716–7720. doi:10.1073 / pnas.0401773101. PMC  419672. PMID  15123802.