Streptomycetaceae - Streptomycetaceae
| Streptomycetaceae | |
|---|---|
 | |
| Kultura snímků z Streptomyces druh | |
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | Aktinobakterie |
| Objednat: | |
| Podřád: | Streptomycineae Rainey et al. 1997 |
| Rodina: | Streptomycetaceae Waksman & Henrici 1943 |
| Rody[je nutné ověření ] | |
The Streptomycetaceae plocha rodina z Aktinobakterie, tvořící monotypický podřád Streptomycineae. Zahrnuje důležitý rod Streptomyces. To byl původní zdroj mnoha antibiotika, jmenovitě streptomycin, první antibiotikum proti tuberkulóza.
Genomika
Sekvenční zarovnání aktinobakteriální genomy vedly k identifikaci tří konzervované podpisové indely které jsou jedinečné pro řád Streptomycetales. Enzym PBGD obsahuje inzerci čtyř aminokyselin, která je přítomna ve všech Streptomyces druhy a Kitasatospora setae, ale ne jiné Actinobacteria. Podobně je inzerce jedné aminokyseliny přítomna v konzervované oblasti adenylát kináza a nachází se ve všech Streptomyces druhy a K. setae, ale nenachází se v žádných jiných aktinobakteriích. Bylo také identifikováno pět konzervativních podpisových proteinů, které jsou přítomny v různých sekvencích Streptomyces druhů, ale ne v K. setae; jako úplný genom K. setae dosud nebyl sekvenován, mohou být tyto proteiny přítomny v K. setae. Kromě toho bylo identifikováno 11 konzervovaných podpisových proteinů, které se nacházejí ve všech sekvenovaných Streptomyces druhy a K. setae. Předpokládá se, že tyto proteiny jsou jedinečné pro řád Streptomycetales molekulární markery které lze použít k odlišení této skupiny od zbytku aktinobakterií. Fylogenetické stromy naznačují, že pořadí Catenulisporales úzce souvisí s řádem Streptomycetales. Tento závěr je podporován indelem konzervovaným podpisem jedné aminokyseliny, který se jedinečně vyskytuje u všech druhů Streptomycetales a Catenulisporales acidiphilia, jediný druh Catenulisporales, jehož kompletní genom byl sekvenován. Kromě toho byly identifikovány tři konzervované podpisové proteiny, které se nacházejí ve všech druzích Streptomycetales a C. acidiphilia. Konzervovaný podpisový indel i konzervované podpisové proteiny poskytují důkaz, že řády Streptomycetales a Catenulisporales spolu úzce souvisejí.[1]
Reference
- ^ Gao, B .; Gupta, R. S. (2012). „Fylogenetický rámec a molekulární podpisy pro hlavní kmeny kmenových aktinobakterií“. Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 76 (1): 66–112. doi:10.1128 / MMBR.05011-11. PMC 3294427. PMID 22390973.