Simbiosys - Simbiosys

SimBioSys
Typ	Dceřiná společnost
Průmysl	Humanitní vědy
Založený	2001
Hlavní sídlo	Toronto, NA, Kanada, Toronto, Ontario, Kanada
Klíčoví lidé	Zsolt Zsoldos, Chief Technology Officer
Rodič	John Wiley & Sons
webová stránka	vědní řešení.wiley.com

SimBioSys (zkratka pro Simulované biomolekulární systémy) je torontská chemická softwarová společnost zaměřená na strukturu objev drog a retrosyntetická analýza nástroje. Vybudovalo si silnou pověst^{[Citace je zapotřebí ]} jako jeden z předních vývojářů flexibilní dokování aplikace, virtuální projekce metody a návrh organické syntézy podporované počítačem.

V roce 2014 společnost SimBioSys získala John Wiley & Sons jako součást jejich výzkumné divize.^[1]

Oblasti expertizy

Založena skupinou počítačových vědců a chemiků^{[Citace je zapotřebí ]}, SimBioSys kombinuje sofistikované vyhledávací algoritmy, strojové učení techniky a informatika přístupy s chemickými znalostmi a modelováním.^{[Citace je zapotřebí ]}

produkty

eHiTS ^[2] - Na základě fragmentu flexibilní dokování software. eHiTS používá vyčerpávající a systematický vyhledávací algoritmus, který je navržen k nalezení globální minimální energetické pozice ligandy ve vazebných kapsách proteinů. Aplikace využívá proprietární SimBioSys bodovací funkce.^[3] V roce 2008 společnost přenesla svůj dokovací software na Sony PlayStation 3 a další platformy Cell Broadband Engine, aby dosáhla vyšších rychlostí prověřování. To vyvolalo obrovský zájem zejména u výzkumných pracovníků Klastr PlayStation 3 technologie.
LASO ^[4] - Na základě podobnosti virtuální projekce nástroj, který využívá prvky skórovací funkce eHiTS k identifikaci bioaktivních molekul ve velkých knihovnách sloučenin.
ARChem ^[5] - A retrosyntetická analýza nástroj, který hledá možné syntetické cesty z komerčně dostupných výchozích materiálů k cílovým molekulám.
CheVi^{[Citace je zapotřebí ]} - SimBioSys 3D software pro molekulární vizualizaci.

Společnosti ARChem a CIRX (Fiz Chemie) byly vytvořeny tak, aby vytvořily Wiley ChemPlanner, který je nyní výhradně licencován společností Wiley Science Solutions to Chemical Abstracts Service.

Partnerství

Společnost SimBioSys udržovala marketingové partnerství se společností KeyModule a distribuovala hlavní designový nástroj britské společnosti SPROUT a další produkty.

Viz také

Reference

^ Collins, Allison. „John Wiley pokračuje ve smlouvě, kupuje SimBioSys“. Fúze a akvizice, nejnovější zprávy. Citováno 2014-09-06.
^ Zsoldos, Zsolt; et al. (Červenec 2007). „eHiTS: Nový rychlý, vyčerpávající flexibilní systém dokování flexibilního ligandu“. Journal of Molecular Graphics and Modeling. 26 (1): 198–212. doi:10.1016 / j.jmgm.2006.06.002. PMID 16860582.
^ Englebienne, Pablo; Moitessier, Nicolas (červen 2009). „Dokování ligandů do flexibilních a solvatovaných makromolekul. 4. Jsou pro tuto třídu proteinů přesné oblíbené bodovací funkce přesné?“. Journal of Chemical Information and Modeling. 49: 1568–1580. doi:10.1021 / ci8004308. PMID 19445499.
^ Reid, Darryl; et al. "LASSO - aktivita ligandu podle pořadí podobnosti povrchu: nový nástroj pro virtuální screening založený na ligandu". Journal of Computer-Aided Molecular Design. 22: 479–487. doi:10.1007 / s10822-007-9164-5.
^ James. „Návrhář tras: Nástroj pro retrosyntetickou analýzu využívající automatické generování pravidel retrosyntézy“. Journal of Chemical Information and Modeling. 49: 593–602. doi:10.1021 / ci800228y.

Výsledky srovnávací studie obohacení Merck pro software pro molekulární dokování na Archiv. Dnes (archivováno 2013-01-15)

[1] Collins, Allison. „John Wiley pokračuje ve smlouvě, kupuje SimBioSys“. Fúze a akvizice, nejnovější zprávy. Citováno 2014-09-06.

[2] Zsoldos, Zsolt; et al. (Červenec 2007). „eHiTS: Nový rychlý, vyčerpávající flexibilní systém dokování flexibilního ligandu“. Journal of Molecular Graphics and Modeling. 26 (1): 198–212. doi:10.1016 / j.jmgm.2006.06.002. PMID 16860582.

[3] Englebienne, Pablo; Moitessier, Nicolas (červen 2009). „Dokování ligandů do flexibilních a solvatovaných makromolekul. 4. Jsou pro tuto třídu proteinů přesné oblíbené bodovací funkce přesné?“. Journal of Chemical Information and Modeling. 49: 1568–1580. doi:10.1021 / ci8004308. PMID 19445499.

[4] Reid, Darryl; et al. "LASSO - aktivita ligandu podle pořadí podobnosti povrchu: nový nástroj pro virtuální screening založený na ligandu". Journal of Computer-Aided Molecular Design. 22: 479–487. doi:10.1007 / s10822-007-9164-5.

[5] James. „Návrhář tras: Nástroj pro retrosyntetickou analýzu využívající automatické generování pravidel retrosyntézy“. Journal of Chemical Information and Modeling. 49: 593–602. doi:10.1021 / ci800228y.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]