Salmonella enterica subsp. enterica - Salmonella enterica subsp. enterica

Salmonella enterica subsp. enterica
Salmonella enterica serovar typhimurium 01.jpg
Salmonella Kolonie Typhimurium na a Hektoenův enterický agar
Vědecká klasifikace Upravit
Doména:Bakterie
Kmen:Proteobakterie
Třída:Gammaproteobakterie
Objednat:Enterobacterales
Rodina:Enterobacteriaceae
Rod:Salmonella
Druh:
S. enterica
Poddruh:
S. e. subsp. enterica
Trojčlenné jméno
Salmonella enterica subsp. enterica

Salmonella enterica subsp. enterica je poddruh Salmonella enterica, ve tvaru tyče, bičované, aerobní, Gramnegativní bakterie. Mnoho patogenních serovary z S. enterica druhy jsou v tom poddruh, včetně odpovědného za tyfus.[1]

Serovary

S. enterica subsp. enterica obsahuje velké množství sérovarů, které mohou infikovat širokou škálu bakterií obratlovců hostitelé. Jednotliví členové se pohybují od vysoce přizpůsobeného hostiteli (jen jsou schopni infikovat úzký rozsah druhů) až po zobrazení širokého hostitelského rozsahu. V současné době se k rozlišení rozlišuje řada technik sérotypy. Patří mezi ně hledání přítomnosti nebo nepřítomnosti antigeny, fágové psaní, molekulární otisky prstů a biotypizace, kde jsou serovary rozlišeny podle toho, které živiny jsou schopny fermentovat. Možným faktorem při určování rozsahu hostitele konkrétních sérovarů je fágem zprostředkované získání malého počtu genetických prvků, které umožňují infekci konkrétního hostitele.[2] Dále se předpokládá, že sérovary, které infikují úzký rozsah druhů, se lišily od předků se širokým rozsahem hostitelů a od té doby se specializovaly a ztratily schopnost infikovat některé hostitele.[3]

Výběr sérovarů se známými hostiteli. Vzhledem k tomu, že existuje více než 2500 sérovarů Salmonella enterica subsp. enterica, tento seznam je neúplný.

SerovarHostitelské druhy
Salmonella CholeraesuisSvině
Salmonella DublinDobytek
Salmonella EnteritidisLidé, hlodavci, hrabaví
Salmonella GallinarumHrabaví
Salmonella HadarLidé, hrabaví, králíci
Salmonella HeidelbergLidé, hrabaví, prasata[4]
Salmonella InfantisLidé, drůbež
Salmonella ParatyphiLidé
Salmonella TyphiLidé
Salmonella TyphimuriumLidé, dobytek, prasata, ovce, koně, hlodavci, hrabaví

Studie údajů z 37 zemí shromážděná v letech 2001 až 2007 zjistila, že nejběžnějším sérovarem z Salmonella izolován z lidských případů byl Enteritidis, nalezený v průměru v 43,5% případů, následovaný Typhimuriem (17,1% případů), Newport (3,5%), Infantis (1,8%), Virchow (1,5%), Hadar (1,5%) a Agona (0,8%).[5]

Jeden kmen Salmonella který se nedávno objevil ve Spojených státech Salmonella javiana. „K propuknutí došlo v roce 2002, mezi účastníky transplantačních her v USA došlo k 141 případům. Ze 141 případů šlo většinou o příjemce transplantátu (34%) nebo o osoby užívající imunosupresivní terapii (32%).“ . Je jich stále více Salmonella sérotypy, které jsou rezistentní vůči více léčivům (MDR), který byl identifikován Národním monitorovacím systémem antimikrobiální rezistence CDC.[6] "Salmonella javiana způsobuje 4% netypodial Salmonella infekce ve Spojených státech každý rok. “[7]

V listopadu 2016 představil nový kmen značně rezistentní vůči lékům (XDR) Salmonella enterica serovar Typhi se objevil v Pákistánu, především z měst Hyderabad a Karáčí.[8] Odolné vůči více lékům kmeny jsou přítomny od konce 70. let v Africe a Asii.[9] Tyto kmeny XDR jsou rezistentní vůči všem možnostem antibiotické léčby: chloramfenikol, ampicilin, trimethoprim-sulfamethoxazol, fluorochinolony a cefalosporiny třetí generace. Záchvaty trvají od roku 2016.[10]

Metabolismus

Genetické důkazy naznačují, že sérovary lze rozdělit do dvou skupin - jedné, která způsobuje enterickou infekci a má široký repertoár metabolických schopností, a druhé, která obvykle způsobuje invazivní infekce, často u úzkého okruhu hostitelů, a vykazuje degradaci anaerobních metabolických drah. . Předpokládá se, že tyto metabolické schopnosti jsou důležité pro získávání živin v náročném a na živiny omezeném prostředí zánětu.[11]

Nomenklatura

Serovary mohou být označeny úplně nebo ve zkrácené formě.[12] Krátká forma uvádí rod, Salmonella, za nímž následuje sérovar s velkými a malými písmeny. Úplné označení pro Salmonella Typhi je Salmonella enterica subsp. enterica, serovar Typhi.[13] Každý sérovar může mít také mnoho kmenů, což umožňuje rychlé zvýšení celkového počtu antigenně variabilní bakterie.[14]

Epidemiologie

Hlavní článek: Salmonelóza

Invazivní kmeny netefoidních salmonel, jako je např Salmonella Typhimurium ST313 byly nedávno označeny jako látky způsobující nové choroby v Africe. Klíčové imunitní deficity hostitele spojené s HIV, malárií a podvýživou přispěly k širokému šíření této nemoci a potřebě používat drahé antimikrobiální léky v nejchudších zdravotnických službách na světě.[15] Ale také bakteriální faktory, jako je upregulovaná aktivita genu virulence pgtE, kvůli polymorfismus jednoho nukleotidu (SNP) ve své promotorové oblasti má velký dopad na patogenezi tohoto konkrétního Salmonella typ sekvence.[16]

Reference

  1. ^ Murray PR, Rosenthal KS, Pfaller MA (2009). Lékařská mikrobiologie (6. vydání). Philadelphia, PA: Mosby Elsevier. p. 307.
  2. ^ Sternlicht M, Staaby J, Sullivan I (prosinec 1975). „Pořadí narození, věk matky a mentální retardace“. Mentální retardace. 13 (6): 3–6. doi:10.1128 / IAI.70.5.2249-2255.2002. PMC  127920. PMID  11953356.
  3. ^ Langridge GC, Fookes M, Connor TR, Feltwell T, Feasey N, Parsons BN, Seth-Smith HM, Barquist L, Stedman A, Humphrey T, Wigley P, Peters SE, Maskell DJ, Corander J, Chabalgoity JA, Barrow P, Parkhill J, Dougan G, Thomson NR (leden 2015). „Vzory evoluce genomu, které doprovázely adaptaci hostitele u Salmonella“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (3): 863–8. Bibcode:2015PNAS..112..863L. doi:10.1073 / pnas.1416707112. PMC  4311825. PMID  25535353.
  4. ^ „Snapshots of Salmonella Serotypes“ (PDF). Centra pro kontrolu a prevenci nemocí. CDC.
  5. ^ Hendriksen RS, Vieira AR, Karlsmose S, Lo Fo Wong DM, Jensen AB, Wegener HC, Aarestrup FM (srpen 2011). „Globální monitorování distribuce sérovaru Salmonella od Světové zdravotnické organizace Global Foodborne Infections Network Country Data Bank: výsledky laboratoří zajišťujících kvalitu od roku 2001 do roku 2007“. Potravinářské patogeny a nemoci. 8 (8): 887–900. doi:10.1089 / fpd.2010.0787. PMID  21492021.
  6. ^ Goldrick, Barbara (březen 2003). „Vznikající infekce: nemoci přenášené potravinami“. The American Journal of Nursing. 103 (3): 105–106. doi:10.1097/00000446-200303000-00043. JSTOR  29745004. PMID  12635640.
  7. ^ Elward A, Grim A, Schroeder P, Kieffer P, Sellenriek P, Ferrett R, Adams HC, Phillips V, Bartow R, Mays D, Lawrence S, Seed P, Holzmann-Pazgal G, polský L, Leet T, Fraser V ( Června 2006). „Vypuknutí infekce Salmonella javiana v dětské nemocnici“. Kontrola infekce a nemocniční epidemiologie. 27 (6): 586–92. doi:10.1086/506483. JSTOR  10.1086/506483. PMID  16755478.
  8. ^ „Vypuknutí tyfusu v Pákistánu souvisí s bakteriemi rezistentními vůči drogám“. Scientist Magazine®. Citováno 2018-09-03.
  9. ^ Klemm, Elizabeth J .; Shakoor, Sadia; Page, Andrew J .; Qamar, Farah Naz; Soudce Kim; Saeed, Dania K .; Wong, Vanessa K .; Dallman, Timothy J .; Nair, Satheesh (2018-02-20). „Vznik vysoce rezistentního klonu Salmonella enterica Serovar Typhi, který obsahuje promiskuitní plazmid kódující rezistenci na fluorochinolony a cefalosporiny třetí generace“. mBio. 9 (1). doi:10,1128 / mBio.00105-18. ISSN  2150-7511. PMC  5821095. PMID  29463654.
  10. ^ "Extrémně odolná proti břišnímu tyfusu v Pákistánu - výstraha - úroveň 2, praktická preventivní opatření - oznámení o zdraví cestování | Zdraví cestujících | CDC". wwwnc.cdc.gov. Citováno 2018-09-03.
  11. ^ Nuccio SP, Bäumler AJ (březen 2014). „Srovnávací analýza genomů Salmonella identifikuje metabolickou síť pro eskalaci růstu v zaníceném střevě“. mBio. 5 (2): e00929–14. doi:10,1128 / mBio.00929-14. PMC  3967523. PMID  24643865.
  12. ^ „Názvosloví Salmonella“. 19. března 2005. Archivovány od originál dne 2006-04-15.
  13. ^ „Vědecká nomenklatura“. Vznikající infekční onemocnění. Centra pro kontrolu a prevenci nemocí. Citováno 17. února 2020.
  14. ^ "Salmonella spp. Srovnávací řazení". Archivovány od originál dne 14.11.2007.
  15. ^ Feasey NA, Dougan G, Kingsley RA, Heyderman RS, Gordon MA (červen 2012). „Invazivní netofoidní choroba salmonel: objevující se a zanedbávaná tropická nemoc v Africe“. Lanceta. 379 (9835): 2489–99. doi:10.1016 / s0140-6736 (11) 61752-2. PMC  3402672. PMID  22587967.
  16. ^ Hammarlöf DL, Kröger C, Owen SV, Canals R, Lacharme-Lora L, Wenner N, Schager AE, Wells TJ, Henderson IR, Wigley P, Hokamp K, Feasey NA, Gordon MA, Hinton JC (březen 2018). "Salmonella". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 115 (11): E2614 – E2623. doi:10.1073 / pnas.1714718115. PMC  5856525. PMID  29487214.