SYNJ2 - SYNJ2 - Wikipedia

SYNJ2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1UFW
Identifikátory
Aliasy	SYNJ2, INPP5H, synaptojanin 2
Externí ID	OMIM: 609410 MGI: 1201671 HomoloGene: 117703 Genové karty: SYNJ2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	158,099,176 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	6,044,290 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita hydrolázy esteru fosforečné; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • Vazba RNA; • vazba nukleové kyseliny; • aktivita fosfatidylinositol-3,5-bisfosfátu 5-fosfatázy; • aktivita fosfatidylinositolfosfátu 4-fosfatázy; • aktivita fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát 5-fosfatázy; • aktivita fosfatidylinositol-3-fosfatázy; • aktivita fosfatidylinositol-3,5-bisfosfát 3-fosfatázy; • aktivita fosfatidylinositolfosfátu 5-fosfatázy; • aktivita inositol-polyfosfátu 5-fosfatázy; • Vazba domény SH3; • Vazba domény PDZ; • aktivita fosfatidylinositol-4-fosfátfosfatázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membránový vor; • axon; • cytosol; • buněčná membrána; • buněčná projekce; • cytoskelet; • membrána; • cytoplazmatický mikrotubul; • vnější složka mitochondriální vnější membrány; • volánová membrána; • axonový konec; • perinukleární oblast cytoplazmy; • presynapse;
Biologický proces	• proces biosyntézy fosfatidylinositolu; • fosfatidylinositol defosforylace; • biosyntetický proces fosfatidylinositol-3-fosfátu; • membránová organizace; • vývoj mozku; • defosforylace inositolfosfátu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8871
	20975
	ENSG00000078269
	ENSMUSG00000023805
	O15056
	Q9D2G5
	NM_001178088; NM_003898
NM_001113351; NM_001113352; NM_001113353; NM_001290698; NM_011523;
	NM_001357665; NM_001357667
	NP_001171559; NP_003889
NP_001106822; NP_001106823; NP_001106824; NP_001277627; NP_035653;
	NP_001344594; NP_001344596
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Synaptojanin 2 je protein že u lidí je kódován pomocí SYNJ2 gen.^[5]

Funkce

Gen je členem skupiny inositol-polyfosfát 5-fosfatáza rodina. Kódovaný protein interaguje s C3 souvisejícím s ras botulotoxin substrát 1, který způsobuje translokaci kódovaného proteinu do plazmatická membrána kde inhibuje Clathrin -zprostředkovaný endocytóza. Výsledkem alternativního sestřihu je více varianty přepisu. [poskytl RefSeq, květen 2010].

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000078269 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023805 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: Synaptojanin 2“.

Další čtení

Luciano M, Lopez LM, de Moor MH, Harris SE, Davies G, Nutile T, Krueger RF, Esko T, Schlessinger D, Toshiko T, Derringer JL, Realo A, Hansell NK, Pergadia ML, Pesonen AK, Sanna S, Terracciano A, Madden PA, Penninx B, Spinhoven P, Hartman CA, Oostra BA, Janssens AC, Eriksson JG, Starr JM, Cannas A, Ferrucci L, Metspalu A, Wright MJ, Heath AC, van Duijn CM, Bierut LJ, Raikkonen K , Martin NG, Ciullo M, Rujescu D, Boomsma DI, Deary IJ (březen 2012). „Geny kandidující na dlouhověkost a jejich souvislost s osobnostními rysy u starších osob“. American Journal of Medical Genetics. Část B, Neuropsychiatrická genetika. 159B (2): 192–200. doi:10,1002 / ajmg.b.32013. PMC 3583011. PMID 22213687.
Verweij KJ, Vinkhuyzen AA, Benyamin B, Lynskey MT, Quaye L, Agrawal A, Gordon SD, Montgomery GW, Madden PA, Heath AC, Spector TD, Martin NG, Medland SE (září 2013). „Genetická etiologie iniciace užívání konopí: metaanalýza asociačních studií v celém genomu a odhad dědičnosti založený na SNP“. Biologie závislostí. 18 (5): 846–50. doi:10.1111 / j.1369-1600.2012.00478.x. PMC 3548058. PMID 22823124.
Modregger J, Schmidt AA, Ritter B, Huttner WB, Plomann M (únor 2003). „Charakterizace endofilinu B1b, mozkové specifické membránové acyltransferázy kyseliny lysofosfatidové s vlastnostmi odlišnými od endofilinu A1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (6): 4160–7. doi:10,1074 / jbc.M208568200. PMID 12456676.
Spaenij-Dekking EH, Van Delft J, Van Der Meijden E, Hiemstra HS, Falkenburg JH, Koning F, Drijfhout JW, Kluin-Nelemans JC (prosinec 2003). „Synaptojanin 2 je rozpoznáván T-buňkami specifickými pro leukemii vlasových buněk omezenou na HLA třídy II“. Leukémie. 17 (12): 2467–73. doi:10.1038 / sj.leu.2403174. PMID 14562116.
Chuang Y, Xu X, Kwiatkowska A, Tsapraillis G, Hwang H, Petritis K, Flynn D, Symons M (2012). "Regulace aktivity synaptojanin 2 5'-fosfatázy pomocí Src". Buněčná adheze a migrace. 6 (6): 518–25. doi:10,4161 / cam.22139. PMC 3547897. PMID 23076136.
Wong KA, Wilson J, Russo A, Wang L, Okur MN, Wang X, Martin NP, Scappini E, Carnegie GK, O'Bryan JP (2012). „Rodina lešení Intertersectin (ITSN) funguje jako molekulární rozbočovače v sítích pro interakci proteinů“. PLOS ONE. 7 (4): e36023. Bibcode:2012PLoSO ... 736023W. doi:10.1371 / journal.pone.0036023. PMC 3338775. PMID 22558309.
Jiao S, Hsu L, Berndt S, Bézieau S, Brenner H, Buchanan D, Caan BJ, Campbell PT, Carlson CS, Casey G, Chan AT, Chang-Claude J, Chanock S, Conti DV, Curtis KR, Duggan D, Gallinger S, Gruber SB, Harrison TA, Hayes RB, Henderson BE, Hoffmeister M, Hopper JL, Hudson TJ, Hutter CM, Jackson RD, Jenkins MA, Kantor ED, Kolonel LN, Küry S, Le Marchand L, Lemire M, Newcomb PA, Potter JD, Qu C, Rosse SA, Schoen RE, Schumacher FR, Seminara D, Slattery ML, Ulrich CM, Zanke BW, Peters U (2012). „Hledání genomových interakcí u kolorektálního karcinomu v celém genomu“. PLOS ONE. 7 (12): e52535. Bibcode:2012PLoSO ... 752535J. doi:10.1371 / journal.pone.0052535. PMC 3530500. PMID 23300701.
Warnatz HJ, Schmidt D, Manke T, Piccini I, Sultan M, Borodina T, Balzereit D, Wruck W, Soldatov A, Vingron M, Lehrach H, Yaspo ML (červenec 2011). „Cílové geny BTB a CNC homologie 1 (BACH1) se podílejí na reakci na oxidační stres a na kontrole buněčného cyklu.“. The Journal of Biological Chemistry. 286 (26): 23521–32. doi:10.1074 / jbc.M111.220178. PMC 3123115. PMID 21555518.
Chuang YY, Tran NL, Rusk N, Nakada M, Berens ME, Symons M (listopad 2004). „Role synaptojaninu 2 při migraci a invazi gliomových buněk“. Výzkum rakoviny. 64 (22): 8271–5. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-2097. PMID 15548694.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000078269 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023805 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: Synaptojanin 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]