SYBR Green I - SYBR Green I - Wikipedia
![]() | |
Jména | |
---|---|
Název IUPAC N ', N'-dimetyl-N- [4 - [(E) - (3-methyl-1,3-benzothiazol-2-yliden) methyl] -l-fenylchinolin-l-ium-2-yl] -N-propylpropan-1,3-diamin | |
Identifikátory | |
3D model (JSmol ) | |
ChEMBL | |
PubChem CID | |
Řídicí panel CompTox (EPA) | |
| |
Vlastnosti | |
C32H37N4S+ | |
Molární hmotnost | 509.73 G /mol |
Rozpustnost | Normálně dodáván solvatovaný v dimethylsulfoxid |
Pokud není uvedeno jinak, jsou uvedeny údaje o materiálech v nich standardní stav (při 25 ° C [77 ° F], 100 kPa). | |
![]() ![]() ![]() | |
Reference Infoboxu | |
SYBR Green I (SG) je asymetrický kyaninové barvivo[1] používá se jako nukleová kyselina skvrna v molekulární biologie. Rodina barviv SYBR je vyráběna společností Molecular Probes Inc., nyní ve vlastnictví Thermo Fisher Scientific. SYBR Green I se váže DNA. Výsledný komplex DNA-barvivo nejlépe absorbuje modré světlo 497 nanometrů (λmax = 497 nm) a vyzařuje zelené světlo (λmax = 520 nm). Barvení se přednostně váže na dvouvláknovou DNA, ale obarví jednovláknovou (ss) DNA s nižším výkonem. SYBR Green může také barvit RNA s nižším výkonem než ssDNA.


Použití
SYBR Green nachází uplatnění v několika oblastech biochemie a molekulární biologie. Používá se jako barvivo pro kvantifikaci dvouvláknové DNA v některých metodách kvantitativní PCR.[2] Používá se také k vizualizaci DNA v Gelová elektroforéza. K barvení lze použít vyšší koncentrace SYBR Green agarózové gely za účelem vizualizace přítomné DNA. Kromě značení čistých nukleových kyselin lze SYBR Green také použít pro značení DNA v buňkách průtoková cytometrie a fluorescenční mikroskopie. V těchto případech RNáza může být vyžadováno ošetření ke snížení pozadí z RNA v buňkách.
Bezpečnost
SYBR Green I je prodáván jako náhrada za ethidiumbromid, potenciální člověk mutagen, protože je bezpečnější pracovat i bez komplexních problémů s likvidací odpadu ethidia. Nicméně jakékoli malá molekula schopné vázat DNA s vysokou afinitou karcinogen, včetně SYBR Green.
Ve studii využívající Amesův test, který měří schopnost chemických látek vyvolat mutace, nebyl při stanovení při stejné koncentraci zjištěn jasný vzorec relativních mutagenit ethaniumbromidu a SYBR green I.[3] Ethidiumbromid byl při vyšších koncentracích mutagennější.
Podobná cyaninová barviva
- PicoGreen (PG)
- SYBR Safe
- SYBR zlato
- Thiazol oranžová (NA)
- Oxazol žlutá (YO)
- Safe-Green
- Chai Green
Viz také
Poznámky a odkazy
- ^ Zip H; Brunner H; Bernhagen J; Vitzthum F (2004). „Vyšetřování interkalace DNA a povrchové vazby pomocí SYBR Green I, stanovení její struktury a metodologické důsledky“. Výzkum nukleových kyselin. 32 (12): e103. doi:10.1093 / nar / gnh101. PMC 484200. PMID 15249599.
- ^ Mackay IM; Arden KE; Nitsche A (březen 2002). „PCR v reálném čase ve virologii“. Nucleic Acids Res. 30 (6): 1292–305. doi:10.1093 / nar / 30.6.1292. PMC 101343. PMID 11884626.
- ^ Singer VL; Lawlor TE; Yue S (únor 1999). „Srovnání mutagenity gelu na bázi nukleové kyseliny SYBR Green I a mutagenity ethidiumbromidu v testu reverzní mutace mikroorganismu Salmonella / savce (Amesův test)“. Mutační výzkum. 439 (1): 37–47. doi:10.1016 / s1383-5718 (98) 00172-7. PMID 10029672.