SWAP70 - SWAP70

SWAP70

Protein SWAP70 PDB 2dn6.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2DN6

Identifikátory

SWAP70, SWAP-70, HSPC321, přepínání SWAP podjednotky B-buněk 70kDa, přepínání SWAP podjednotky B-buněk 70, přepínání podjednotky komplexu B-buněk přepínání podjednotky B buněk

Externí ID

OMIM: 604762 MGI: 1298390 HomoloGene: 7557 Genové karty: SWAP70

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 11 (lidský)^[1]

Kapela	11p15.4	Start	9,664,077 bp^[1]
Kapela	11p15.4	Konec	9,752,993 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 7 (myš)^[2]

Kapela	7 E3 \| 7 57,7 cM	Start	110,221,711 bp^[2]
Kapela	7 E3 \| 7 57,7 cM	Konec	110,283,506 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA • vazba iontů vápníku • GO: 0001948 vazba na proteiny • ATP vazba • kadherinová vazba
Buněčná složka	• buněčná projekce • membrána • buněčná membrána • cytoskelet • buněčné jádro • lamellipodium • cytoplazma
Biologický proces	• pozitivní regulace koncentrace cytosolických iontů vápníku • pozitivní regulace chemotaxe žírných buněk • negativní regulace peptidyl-serinové defosforylace • negativní regulace depolymerace aktinových vláken • sestava svazku aktinových vláken • regulace lokalizace proteinů • regulace polymerace nebo depolymerace aktinu • rekombinace DNA somatických buněk • přepínání izotypů • pozitivní regulace sestavy svazku aktinových vláken • negativní regulace buněčné adheze zprostředkované integrinem
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


23075


20947


ENSG00000133789


ENSMUSG00000031015


Q9UH65


Q6A028

RefSeq (mRNA)


NM_001297714 NM_015055


NM_009302

RefSeq (protein)


NP_001284643 NP_055870


NP_033328

Místo (UCSC)

Chr 11: 9,66 - 9,75 Mb

Chr 7: 110,22 - 110,28 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Protein spojený s přepínačem 70 je protein že u lidí a jiných savců je kódován SWAP70 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000133789 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031015 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.
^ Masat L, Caldwell J, Armstrong R, Khoshnevisan H, Jessberger R, Herndier B, Wabl M, Ferrick D (duben 2000). „Sdružení SWAP-70 s komplexem receptoru antigenu B buněk“. Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (5): 2180–4. doi:10.1073 / pnas.040374497. PMC 15774. PMID 10681448.
^ „Entrez Gene: SWAP70 protein SWAP-70“.
^ Pearce G, Angeli V, Randolph GJ, Junt T, von Andrian U, Schnittler HJ, Jessberger R (srpen 2006). „Signální protein SWAP-70 je vyžadován pro efektivní navádění B buněk do lymfoidních orgánů.“ Nat. Immunol. 7 (8): 827–34. doi:10.1038 / ni1365. PMID 16845395. S2CID 30891179.

Další čtení

Borggrefe T, Wabl M, Akhmedov AT, Jessberger R (1998). „Komplex rekombinace DNA specifický pro B-buňky“. J. Biol. Chem. 273 (27): 17025–35. doi:10.1074 / jbc.273.27.17025. PMID 9642267.
Rapalus L, Minegishi Y, Lavoie A a kol. (2002). „Analýza SWAP-70 jako kandidátského genu pro non-X-vázaný hyper IgM syndrom a běžnou variabilní imunodeficienci“. Clin. Immunol. 101 (3): 270–5. doi:10.1006 / klima 2001.5116. PMID 11726218.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hilpelä P, Oberbanscheidt P, Hahne P a kol. (2004). „SWAP-70 identifikuje přechodnou podmnožinu aktinových vláken v pohyblivých buňkách“. Mol. Biol. Buňka. 14 (8): 3242–53. doi:10,1091 / mbc.E03-01-0043. PMC 181564. PMID 12925760.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Ihara S, Oka T, Fukui Y (2006). „Pro ruffling membrány je vyžadována přímá vazba SWAP-70 na nesvalový aktin“. J. Cell Sci. 119 (Pt 3): 500–7. doi:10.1242 / jcs.02767. PMID 16418221.
Kimbara N, Dohi N, Miyamoto M a kol. (2006). "Diagnostická povrchová exprese SWAP-70 na T-buňkách infikovaných HIV-1". Microbiol. Immunol. 50 (3): 235–42. doi:10.1111 / j.1348-0421.2006.tb03790.x. PMID 16547421. S2CID 85037572.
Liu J, Li D, Cao B a kol. (2007). "Exprese a lokalizace SWAP-70 v lidském fetomaternálním rozhraní a placentě během tubálního těhotenství a normální placentace". J. Histochem. Cytochem. 55 (7): 701–8. doi:10.1369 / jhc.6A7151.2007. PMID 17371938.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.