SURF4 - SURF4

SURF4
Identifikátory
Aliasy	SURF4, ERV29, přebytek 4
Externí ID	OMIM: 185660 MGI: 98445 HomoloGene: 6052 Genové karty: SURF4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	133,376,166 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	26,933,928 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Golgiho aparát; • endoplazmatické retikulum - Golgiho meziprostorová membrána; • endoplazmatické retikulum; • membrána; • endoplazmatické retikulum - Golgiho meziprostor; • transportní váček; • membrána endoplazmatického retikula; • Golgiho membrána; • buněčná membrána; • azurofilní granulovaná membrána; • cytosol;
Biologický proces	• časný endosom Golgiho transportu; • pozitivní regulace organizace organel; • výstup bílkovin z endoplazmatického retikula; • Golgiho organizace; • retrográdní transport zprostředkovaný vezikuly, Golgi do ER; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6836
	20932
	ENSG00000148248; ENSG00000280951
	ENSMUSG00000014867
	O15260
	Q64310
NM_001280788; NM_001280789; NM_001280790; NM_001280791; NM_001280792;
	NM_001280793; NM_033161
	NM_011512
NP_001267717; NP_001267718; NP_001267719; NP_001267720; NP_001267721;
	NP_001267722; NP_149351
	NP_035642
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Surfeit locus protein 4 je protein že u lidí je kódován SURF4 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen se nachází v přemíra genový klastr, který je složen z velmi úzce propojených housekeepingových genů, které nesdílejí podobnost sekvencí. Kódovaný protein je konzervovaný integrální membránový protein obsahující více domnělých transmembránových oblastí. V eukaryotických buňkách je transport bílkovin mezi endoplazmatickým retikulem a Golgiho oddíly částečně zprostředkován vezikulárními obalovými proteiny (COP) nepokrytými klatrinem. Specifická funkce tohoto proteinu nebyla stanovena, ale jeho kvasnicový homolog je přímo vyžadován pro zabalení glykosylovaného pro-alfa-faktoru do vezikul COPII. Tento gen používá více polyadenylačních míst, což vede k variaci délky transkriptu. Byla navržena existence alternativně sestřižených variant transkriptu, ale jejich platnost nebyla stanovena.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000280951 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148248, ENSG00000280951 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014867 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yon J, Jones T, Garson K, Sheer D, Fried M (červen 1993). „Organizace a ochrana lidského klastru Surfeit genů a jeho lokalizace telomerická do c-abl a může protoonkogeny v chromozomovém pásmu 9q34.1. Hum Mol Genet. 2 (3): 237–40. doi:10,1093 / hmg / 2,3.237. PMID 8499913.
^ Reeves JE, Fried M (srpen 1995). „Surf-4 gen kóduje nový 30 kDa integrální membránový protein“. Mol Membr Biol. 12 (2): 201–8. doi:10.3109/09687689509027508. PMID 7540914.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SURF4 surfeit 4“.

Další čtení

Duhig T, Ruhrberg C, Mor O, Fried M (1999). „Místo lidského přežití“. Genomika. 52 (1): 72–8. doi:10.1006 / geno.1998.5372. PMID 9740673.
Hu RM, Han ZG, Song HD a kol. (2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (17): 9543–8. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Breuza L, Halbeisen R, Jenö P a kol. (2004). „Proteomika membrán endoplazmatického retikula - Golgiho meziprostoru (ERGIC) z buněk HepG2 ošetřených brefeldinem A identifikuje ERGIC-32, nový cyklický protein, který interaguje s lidským Erv46“. J. Biol. Chem. 279 (45): 47242–53. doi:10,1074 / jbc.M406644200. PMID 15308636.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000280951 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148248, ENSG00000280951 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000014867 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8499913-5] Yon J, Jones T, Garson K, Sheer D, Fried M (červen 1993). „Organizace a ochrana lidského klastru Surfeit genů a jeho lokalizace telomerická do c-abl a může protoonkogeny v chromozomovém pásmu 9q34.1. Hum Mol Genet. 2 (3): 237–40. doi:10,1093 / hmg / 2,3.237. PMID 8499913.

[pmid7540914-6] Reeves JE, Fried M (srpen 1995). „Surf-4 gen kóduje nový 30 kDa integrální membránový protein“. Mol Membr Biol. 12 (2): 201–8. doi:10.3109/09687689509027508. PMID 7540914.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SURF4 surfeit 4“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]