STAP1 - STAP1

STAP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X1F, 3MAZ
Identifikátory
Aliasy	STAP1, BRDG1, STAP-1, člen rodiny adaptéru převádějícího signál 1
Externí ID	OMIM: 604298 MGI: 1926193 HomoloGene: 8103 Genové karty: STAP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	67,607,337 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	86,106,125 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na receptor faktoru stimulujícího kolonie makrofágů; • aktivita adaptéru transmembránový receptor protein tyrosinkináza; • vazba zbytku fosfotyrosinu; • vazba na receptorovou tyrosinkinázu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba fosfolipidů; • vazba protein kinázy; • aktivita signalizačního adaptéru;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mitochondrie; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• pozitivní regulace signální dráhy receptoru B buněk; • pozitivní regulace fagocytózy, pohlcení; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • negativní regulace sestavení volánku; • pozitivní regulace cytotoxicity zprostředkované mikrogliálními buňkami; • pozitivní regulace aktivity membránových proteinových tyrosinkináz; • negativní regulace migrace mikrogliálních buněk; • pozitivní regulace genové exprese; • pozitivní regulace aktivace mikrogliálních buněk; • negativní regulace fosforylace; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • negativní regulace signální dráhy faktoru stimulujícího kolonie makrofágů; • pozitivní regulace reorganizace aktinového cytoskeletu; • negativní regulace chemotaxe makrofágů; • reakce na bakterii;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26228
	56792
	ENSG00000035720
	ENSMUSG00000029254
	Q9ULZ2
	Q9JM90
	NM_012108; NM_001317769
	NM_019992; NM_001310639
	NP_001304698; NP_036240
	NP_001297568; NP_064376
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteinový adaptér transdukující signál 1 je protein že u lidí je kódován STAP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem funguje jako dokovací protein působící za Tec tyrosin kinázou v signalizaci receptoru antigenu B buněk. Protein je přímo fosforylován Tec in vitro, kde se účastní a Pozitivní zpětná vazba smyčka, zvyšující aktivitu Tec. Myší ortolog, protein 1 adaptéru kmenových buněk, sdílí 83% identitu se svým lidským protějškem.^[7]

Interakce

STAP1 bylo prokázáno komunikovat s C19orf2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000035720 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029254 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ohya K, Kajigaya S, Kitanaka A, Yoshida K, Miyazato A, Yamashita Y, Yamanaka T, Ikeda U, Shimada K, Ozawa K, Mano H (listopad 1999). „Molekulární klonování dokovacího proteinu, BRDG1, který působí downstream od Tec tyrosinkinázy“. Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (21): 11976–81. doi:10.1073 / pnas.96.21.11976. PMC 18397. PMID 10518561.
^ Masuhara M, Nagao K, Nishikawa M, Sasaki M, Yoshimura A, Osawa M (březen 2000). "Molekulární klonování myšího STAP-1, adaptivního proteinu specifického pro kmenové buňky obsahujícího domény PH a SH2". Biochem Biophys Res Commun. 268 (3): 697–703. doi:10,1006 / bbrc.2000.2223. PMID 10679268.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BRDG1 BCR downstream signalizace 1“.
^ Gstaiger M, Luke B, Hess D, Oakeley EJ, Wirbelauer C, Blondel M, Vigneron M, Peter M, Krek W (listopad 2003). "Řízení transkripčních programů citlivých na živiny nekonvenčním prefoldinovým URI". Věda. 302 (5648): 1208–12. doi:10.1126 / science.1088401. PMID 14615539. S2CID 26836888.

Další čtení

Kurosaki T (1999). "Genetická analýza signalizace receptoru antigenu B buněk". Annu. Rev. Immunol. 17 (1): 555–92. doi:10,1146 / annurev.immunol.17.1.555. PMID 10358768.
Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). "Vytvoření knihoven exprese proteinů v celém genomu pomocí náhodné aktivace genové exprese". Nat. Biotechnol. 19 (5): 440–5. doi:10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
Yokohari K, Yamashita Y, Okada S, Ohya K, Oda S, Hatano M, Mano H, Hirasawa H, Tokuhisa T (2002). "Interakce BRDG1 závislá na izoformě s Tec kinázou". Biochem. Biophys. Res. Commun. 289 (2): 414–20. doi:10.1006 / bbrc.2001.6008. PMID 11716489.
Minoguchi M, Minoguchi S, Aki D, Joo A, Yamamoto T, Yumioka T, Matsuda T, Yoshimura A (2003). „STAP-2 / BKS, adaptér / dokovací protein, moduluje aktivaci STAT3 v reakci akutní fáze prostřednictvím svého motivu YXXQ“. J. Biol. Chem. 278 (13): 11182–9. doi:10,1074 / jbc.M211230200. PMID 12540842.
Ma J, Dempsey AA, Stamatiou D, Marshall KW, Liew CC (2007). "Identifikace vzorců exprese genu leukocytů spojená s hladinami lipidů v plazmě u lidských subjektů". Ateroskleróza. 191 (1): 63–72. doi:10.1016 / j.atheroskleróza.2006.05.032. PMID 16806233.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000035720 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029254 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10518561-5] Ohya K, Kajigaya S, Kitanaka A, Yoshida K, Miyazato A, Yamashita Y, Yamanaka T, Ikeda U, Shimada K, Ozawa K, Mano H (listopad 1999). „Molekulární klonování dokovacího proteinu, BRDG1, který působí downstream od Tec tyrosinkinázy“. Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (21): 11976–81. doi:10.1073 / pnas.96.21.11976. PMC 18397. PMID 10518561.

[pmid10679268-6] Masuhara M, Nagao K, Nishikawa M, Sasaki M, Yoshimura A, Osawa M (březen 2000). "Molekulární klonování myšího STAP-1, adaptivního proteinu specifického pro kmenové buňky obsahujícího domény PH a SH2". Biochem Biophys Res Commun. 268 (3): 697–703. doi:10,1006 / bbrc.2000.2223. PMID 10679268.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: BRDG1 BCR downstream signalizace 1“.

[pmid14615539-8] Gstaiger M, Luke B, Hess D, Oakeley EJ, Wirbelauer C, Blondel M, Vigneron M, Peter M, Krek W (listopad 2003). "Řízení transkripčních programů citlivých na živiny nekonvenčním prefoldinovým URI". Věda. 302 (5648): 1208–12. doi:10.1126 / science.1088401. PMID 14615539. S2CID 26836888.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]