ST6GALNAC4 - ST6GALNAC4

ST6GALNAC4
Identifikátory
Aliasy	ST6GALNAC4, IV, SIAT3-C, SIAT3C, SIAT7-D, SIAT7D, ST6GALNACIV, ST6GalNAc, ST6 N-acetylgalaktosaminid alfa-2,6-sialyltransferáza 4
Externí ID	OMIM: 606378 MGI: 1341894 HomoloGene: 7939 Genové karty: ST6GALNAC4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	127,917,041 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	32,599,698 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita transferázy, přenos glykosylových skupin; • aktivita sialyltransferázy; • (aktivita alfa-N-acetylneuraminyl-2,3-beta-galaktosyl-1,3) -N-acetyl-galaktosaminidu 6-alfa-sialyltransferázy; • aktivita alfa-N-acetylgalaktosaminidu alfa-2,6-sialyltransferázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Golgiho aparát; • membrána; • Golgiho membrána;
Biologický proces	• Zpracování O-glykanu; • glykosylace proteinů; • oligosacharidový metabolický proces; • glykolipidový metabolický proces; • sialylace; • glykosylace spojená s N proteinem pomocí asparaginu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	27090
	20448
	ENSG00000136840
	ENSMUSG00000079442
	Q9H4F1
	Q9R2B6
	NM_014403; NM_175039; NM_175040
	NM_001276425; NM_011373
	NP_778204; NP_778205
	NP_001263354; NP_035503
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

ST6 (alfa-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galaktosyl-1,3) -N-acetylgalaktosaminid alfa-2,6-sialyltransferáza 4, také známý jako sialyltransferáza 3C (SIAT3-C) nebo sialyltransferáza 7D (SIAT7-D) je a sialyltransferáza enzym že u lidí je kódován ST6GALNAC4 gen.^[5]

Funkce

ST6GALNAC4 je membránový protein typu II, který katalyzuje přenos kyselina sialová od CMP-kyseliny sialové po galaktóza - obsahující substráty. Kódovaný protein preferuje jako substráty glykoproteiny spíše než glykolipidy a vykazuje omezenou substrátovou specificitu, přičemž využívá pouze trisacharidovou sekvenci Neu5Ac-alfa-2,3-Gal-beta-1,3-GalNAc. Kromě toho se podílí na syntéze ganglioside GD1A z GM1B. Enzym se normálně nachází v Golgiho aparát ale lze je proteolyticky zpracovat na rozpustnou formu. Tento protein je členem rodiny glykosyltransferáz 29. Přepis pro tento gen byly nalezeny varianty kódující různé izoformy.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136840 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079442 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrezův gen: ST6GALNAC4 ST6 (alfa-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galaktosyl-1,3) -N-acetylgalaktosaminid alfa-2,6-sialyltransferáza 4".

Další čtení

Lanfranchi G, Muraro T, Caldara F a kol. (1996). "Identifikace 4370 exprimovaných sekvenčních značek z 3'-koncové specifické cDNA knihovny lidského kosterního svalu sekvenováním DNA a hybridizací filtru". Genome Res. 6 (1): 35–42. doi:10,1101 / gr. 6.1.35. PMID 8681137.
Lee YC, Kaufmann M, Kitazume-Kawaguchi S, et al. (1999). "Molekulární klonování a funkční exprese dvou členů myší NeuAcalpha2,3Galbeta1,3GalNAc rodiny GalNAcalpha2,6-sialyltransferázy, ST6GalNAc III a IV". J. Biol. Chem. 274 (17): 11958–67. doi:10.1074 / jbc.274.17.11958. PMID 10207017.
Gilley J, Fried M (1999). „Rozsáhlé rozdíly v pořadí genů v regionech konzervované synteny mezi genomy Fugu a člověkem: důsledky pro vývoj chromozomů a klonování genů onemocnění“. Hučení. Mol. Genet. 8 (7): 1313–20. doi:10,1093 / hmg / 8.7.1313. PMID 10369878.
Harduin-Lepers A, Stokes DC, Steelant WF a kol. (2001). "Klonování, exprese a genová organizace lidského Neu5Ac alfa 2-3Gal beta 1-3GalNAc alfa 2,6-sialyltransferáza: hST6GalNAcIV". Biochem. J. 352 Pt 1: 37–48. PMC 1221430. PMID 11062056.
Moody AM, North SJ, Reinhold B a kol. (2003). "Uzávěr kyseliny sialové z CD8beta jádra 1-O-glykany řídí interakci třídy I s thymocyty-hlavním histokompatibilním komplexem". J. Biol. Chem. 278 (9): 7240–6. doi:10,1074 / jbc.M210468200. PMID 12459555.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kim SW, Kang NY, Lee SH a kol. (2003). "Genomická struktura a analýza promotoru lidského genu NeuAc alfa2,3Gal beta1,3GalNAc alfa2,6-sialyltransferáza (hST6GalNAc IV)". Gen. 305 (1): 113–20. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 01234-9. PMID 12594047.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kang NY, Park YD, Choi HJ a kol. (2005). "Regulační prvky podílející se na transkripci lidského genu NeuAcalpha2,3Galbeta1,3GalNAcalpha2,6-sialyltransferáza (hST6GalNAc IV)". Mol. Buňky. 18 (2): 157–62. PMID 15528990.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136840 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079442 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrezův gen: ST6GALNAC4 ST6 (alfa-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galaktosyl-1,3) -N-acetylgalaktosaminid alfa-2,6-sialyltransferáza 4".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]