SR1 RNA - SR1 RNA - Wikipedia

V molekulární biologii se SR1 RNA je malá RNA (sRNA) produkovaná druhy Bacil a úzce souvisí bakterie.[1] Jedná se o dvojí funkci RNA který funguje jako a protein -kódující RNA a jako regulační sRNA.

SR1 RNA se podílí na regulaci arginin katabolismus. SR1 RNA se váže na komplementární úseky ahrC mRNA (také známý jako argR a inhibuje překlad.[2][3] AhrC endodes an argininový represor protein, který potlačuje syntézu argininu biosyntetický enzymy a aktivuje arginin katabolický enzymy prostřednictvím regulace rocABC a rocDEF operony.[4][5][6]

Kromě toho, že působí jako sRNA, SR1 také kóduje malý peptid, SR1P. SR1P se váže na glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenáza (GapA) a stabilizuje mRNA operonů gapA.[7]

Exprese SR1 je regulována CcpA a CcpN.[8][9]

Viz také

Reference

  1. ^ Gimpel M, Preis H, Barth E, Gramzow L, Brantl S (13. října 2012). „SR1 - malá RNA se dvěma pozoruhodně zachovanými funkcemi“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (22): 11659–11672. doi:10.1093 / nar / gks895. PMC  3526287. PMID  23034808.
  2. ^ Heidrich N, Moll I, Brantl S (2007). „In vitro analýza interakce mezi malou RNA SR1 a jejím primárním cílem ahrC mRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 35 (13): 4331–4346. doi:10,1093 / nar / gkm439. PMC  1935000. PMID  17576690.
  3. ^ Heidrich N, Chinali A, Gerth U, Brantl S (říjen 2006). „Malá nepřeložená RNA SR1 z genomu Bacillus subtilis se podílí na regulaci katabolismu argininu“. Molekulární mikrobiologie. 62 (2): 520–536. doi:10.1111 / j.1365-2958.2006.05384.x. PMID  17020585.
  4. ^ North AK, Smith MC, Baumberg S (1. srpna 1989). „Nukleotidová sekvence regulačního genu argininu Bacillus subtilis a homologie jeho produktu s represorem argininu Escherichia coli“. Gen. 80 (1): 29–38. doi:10.1016/0378-1119(89)90247-3. PMID  2507400.
  5. ^ Czaplewski LG, North AK, Smith MC, Baumberg S, Stockley PG (leden 1992). "Čištění a počáteční charakterizace AhrC: regulátor genů metabolismu argininu v Bacillus subtilis". Mol. Microbiol. 6 (2): 267–275. doi:10.1111 / j.1365-2958.1992.tb02008.x. PMID  1312212.
  6. ^ Dennis CA, Glykos NM, Parsons MR, Phillips SE (březen 2002). "Struktura AhrC, proteinu represoru / aktivátoru argininu z Bacillus subtilis". Acta Crystallographica oddíl D. 58 (Pt 3): 421–430. doi:10.1107 / s0907444901021692. PMID  11856827.
  7. ^ Gimpel M, Heidrich N, Mäder U, Krügel H, Brantl S (květen 2010). „SRNA s dvojí funkcí z B. subtilis: SR1 působí jako peptid kódující mRNA na operonu gapA“ (PDF). Molekulární mikrobiologie. 76 (4): 990–1009. doi:10.1111 / j.1365-2958.2010.07158.x. PMID  20444087.
  8. ^ Licht A, Preis S, Brantl S (říjen 2005). "Implikace CcpN v regulaci nové nepřekládané RNA (SR1) v Bacillus subtilis". Molekulární mikrobiologie. 58 (1): 189–206. doi:10.1111 / j.1365-2958.2005.04810.x. PMID  16164558.
  9. ^ Licht A, Brantl S (říjen 2009). „Transkripční represor CcpN z Bacillus subtilis používá různé represivní mechanismy u různých promotorů“. Journal of Biological Chemistry. 284 (44): 30032–30038. doi:10.1074 / jbc.M109.033076. PMC  2781557. PMID  19726675.