SPOP - SPOP
- Disambiguation: Pro animovanou sérii viz She-Ra: Princess of Power.
- Pro singapurskou pěveckou soutěž viz SPOP Sing!
Speckle-type POZ protein je protein že u lidí je kódován SPOP gen.[5][6][7]
Tento gen kóduje a protein které mohou modulovat transkripční represivní aktivity proteinu 6 spojeného se smrtí (DAXX ), který interaguje s histon deacetyláza, jádro histony a další proteiny spojené s histonem. U myší se kódovaný protein váže na domnělý leucinový zip doména makroH2A1.2, varianta H2A histonu, která je obohacena o inaktivované X chromozomy. Bylo prokázáno, že doména BTB / POZ tohoto proteinu v jiných proteinech zprostředkovává transkripční represi a interaguje se složkami komplexů histon-deacetylázy s korepresorem. Alternativní sestřih Výsledkem tohoto genu je více variant transkriptu kódujících stejný protein.[7]
Klinický význam
Mutace v SPOP vést k typu nádoru prostaty, o kterém se předpokládá, že je zapojen asi u 15% všech rakoviny prostaty.[8][9]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000121067 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000057522 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Nagai Y, Kojima T, Muro Y, Hachiya T, Nishizawa Y, Wakabayashi T, Hagiwara M (listopad 1997). „Identifikace nového proteinu jaderného skvrnitého typu, SPOP“. FEBS Dopisy. 418 (1–2): 23–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 01340-9. PMID 9414087. S2CID 32204506.
- ^ Zapata JM, Pawlowski K, Haas E, Ware CF, Godzik A, Reed JC (červen 2001). „Různorodá rodina proteinů obsahující domény faktoru souvisejícího s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 24242–52. doi:10,1074 / jbc.M100354200. PMID 11279055.
- ^ A b „Entrez Gene: SPOP tečkovaný protein POZ“.
- ^ Heidi Evans (20. května 2012). „Vědci objevují nový typ rakoviny prostaty - objev může vést k léčbě šité na míru“. New York Daily News. Citováno 20. května 2012.
- ^ Barbieri CE, Baca SC, Lawrence MS, Demichelis F, Blattner M, Theurillat JP, White TA, Stojanov P, Van Allen E, Stransky N, Nickerson E, Chae SS, Boysen G, Auclair D, Onofrio RC, Park K, Kitabayashi N, MacDonald TY, Sheikh K, Vuong T, Guiducci C, Cibulskis K, Sivachenko A, Carter SL, Saksena G, Voet D, Hussain WM, Ramos AH, Winckler W, Redman MC, Ardlie K, Tewari AK, Mosquera JM, Rupp N, Wild PJ, Moch H, Morrissey C, Nelson PS, Kantoff PW, Gabriel SB, Golub TR, Meyerson M, Lander ES, Getz G, Rubin MA, Garraway LA (červen 2012). „Exome sekvenování identifikuje opakující se mutace SPOP, FOXA1 a MED12 u rakoviny prostaty“. Genetika přírody. 44 (6): 685–9. doi:10,1038 / ng.2279. PMC 3673022. PMID 22610119.
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Wu J, Song Y, Bakker AB, Bauer S, Spies T, Lanier LL, Phillips JH (červenec 1999). "Aktivující imunoreceptorový komplex tvořený NKG2D a DAP10". Věda. 285 (5428): 730–2. doi:10.1126 / science.285.5428.730. PMID 10426994.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Zapata JM, Pawlowski K, Haas E, Ware CF, Godzik A, Reed JC (červen 2001). „Různorodá rodina proteinů obsahující domény faktoru souvisejícího s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 24242–52. doi:10,1074 / jbc.M100354200. PMID 11279055.
- Takahashi I, Kameoka Y, Hashimoto K (srpen 2002). "MacroH2A1.2 váže jaderný protein Spop". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1591 (1–3): 63–8. doi:10.1016 / S0167-4889 (02) 00249-5. PMID 12183056.
- Gilfillan S, Ho EL, Cella M, Yokoyama WM, Colonna M (prosinec 2002). „NKG2D získává dva odlišné adaptéry pro aktivaci a kostimulaci NK buněk“. Přírodní imunologie. 3 (12): 1150–5. doi:10.1038 / ni857. PMID 12426564. S2CID 5859797.
- Diefenbach A, Tomasello E, Lucas M, Jamieson AM, Hsia JK, Vivier E, Raulet DH (prosinec 2002). „Selektivní asociace se signálními proteiny určují stimulační versus kostimulační aktivitu NKG2D.“ Přírodní imunologie. 3 (12): 1142–9. doi:10.1038 / ni858. PMID 12426565. S2CID 14901451.
- Billadeau DD, Upshaw JL, Schoon RA, Dick CJ, Leibson PJ (červen 2003). „NKG2D-DAP10 spouští zabíjení zprostředkované lidskými NK buňkami regulační cestou nezávislou na Syk“. Přírodní imunologie. 4 (6): 557–64. doi:10.1038 / ni929. PMID 12740575. S2CID 7699074.
- Liu A, Desai BM, Stoffers DA (květen 2004). „Identifikace PCIF1, proteinu domény POZ, který inhibuje transkripční aktivitu PDX-1 (MODY4)“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (10): 4372–83. doi:10.1128 / MCB.24.10.4372-4383.2004. PMC 400448. PMID 15121856.
- La M, Kim K, Park J, Won J, Lee JH, Fu YM, Meadows GG, Joe CO (červenec 2004). „Daxxem zprostředkovaná transkripční represe genu MMP1 je reverzována pomocí SPOP“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 320 (3): 760–5. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.06.022. PMID 15240113.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E, Nusinow DA, Panning B, Marahrens Y, van Lohuizen M (květen 2005). „Stabilní inaktivace chromozomu X zahrnuje komplex PRC1 Polycomb a vyžaduje histon MACROH2A1 a ligand ubikvitin E3 CULLIN3 / SPOP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (21): 7635–40. doi:10.1073 / pnas.0408918102. PMC 1140410. PMID 15897469.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |