SPN1 - SPN1

SNUPN
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1XK5, 2P8Q, 2Q5D, 2QNA, 3GB8, 3GJX, 3LWW, 3NBY, 3NBZ, 3NC0
Identifikátory
Aliasy	SNUPN, KPNBL, RNUT1, Snurportin1, snurportin 1
Externí ID	OMIM: 607902 MGI: 1913319 HomoloGene: 4166 Genové karty: SNUPN
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	75,626,469 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	56,983,206 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba víčka RNA; • Vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita signálního receptoru jaderného importu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • jaderný pór; • buněčné jádro; • intracelulární;
Biologický proces	• import snRNA do jádra; • import bílkovin do jádra; • sestava spliceosomal snRNP; • jaderný dovoz;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10073
	66069
	ENSG00000169371
	ENSMUSG00000055334
	O95149
	Q80W37
	NM_005701; NM_001042581; NM_001042588
	NM_178374
	NP_001036046; NP_001036053; NP_005692
	NP_848461
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Snurportin 1 je protein že u lidí je kódován SNUPN gen.^[5]^[6]

Jaderný import spliceosomálních snRNP U1, U2, U4 a U5 závisí na přítomnosti komplexního signálu lokalizace jader. Ten se skládá z 5'-2,2,7-terminální trimethylguanosinové (m3G) struktury víčka U snRNA a hlavní doména Sm. Protein kódovaný tímto genem interaguje specificky s m3G-cap a funguje jako snRNP-specifický jaderný importní receptor. Alternativně byly pro tento gen identifikovány sestřižené varianty transkriptu kódující stejný protein.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169371 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055334 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Huber J, Cronshagen U, Kadokura M, Marshallsay C, Wada T, Sekine M, Luhrmann R (září 1998). „Snurportin1, specifický jaderný importní receptor specifický pro m3G-cap s novou strukturou domény“. EMBO J.. 17 (14): 4114–26. doi:10.1093 / emboj / 17.14.4114. PMC 1170744. PMID 9670026.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SNUPN snurportin 1“.

Další čtení

Paraskeva E, Izaurralde E, Bischoff FR a kol. (1999). „Recyklace snurportinu 1 zprostředkovaná CRM1 do cytoplazmy“. J. Cell Biol. 145 (2): 255–64. doi:10.1083 / jcb.145.2.255. PMC 2133107. PMID 10209022.
Narayanan U, Ospina JK, Frey MR a kol. (2003). „SMN, protein spinální svalové atrofie, tvoří preimportní snRNP komplex se snurportinem 1 a importinem beta“. Hučení. Mol. Genet. 11 (15): 1785–95. doi:10,1093 / hmg / 11,15,1785. PMC 1630493. PMID 12095920.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Strasser A, Dickmanns A, Lührmann R, Ficner R (2005). „Strukturální základ pro jaderný dovoz spliceosomálních UsnRNP zprostředkovaných m3G-cap od snurportin1“. EMBO J.. 24 (13): 2235–43. doi:10.1038 / sj.emboj.7600701. PMC 1173142. PMID 15920472.
Ospina JK, Gonsalvez GB, Bednenko J a kol. (2006). „Rozhovor mezi subdoménami snurportin1“. Mol. Biol. Buňka. 16 (10): 4660–71. doi:10,1091 / mbc.E05-04-0316. PMC 1237072. PMID 16030253.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070.

externí odkazy

SNUPN umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
SNUPN podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169371 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055334 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9670026-5] Huber J, Cronshagen U, Kadokura M, Marshallsay C, Wada T, Sekine M, Luhrmann R (září 1998). „Snurportin1, specifický jaderný importní receptor specifický pro m3G-cap s novou strukturou domény“. EMBO J.. 17 (14): 4114–26. doi:10.1093 / emboj / 17.14.4114. PMC 1170744. PMID 9670026.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: SNUPN snurportin 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]