SOX17 - SOX17

SOX17
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2YUL, 4A3N
Identifikátory
Aliasy	SOX17, VUR3, SRY-box 17, SRY-box transkripční faktor 17
Externí ID	OMIM: 610928 MGI: 107543 HomoloGene: 7948 Genové karty: SOX17
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	54,460,892 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	4,497,354 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • vazba beta-katenin; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• vývoj ledvinového systému; • vývoj endodermu; • regulace embryonálního vývoje; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace proteinového katabolického procesu; • specifikace osudu kmenových buněk; • pozitivní regulace vývoje tkáně kosterního svalstva; • embryonální morfogeneze předního střeva; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II zapojeného do definitivní specifikace osudu endodermální buňky; • vývoj embryonálních orgánů; • morfogeneze endodermálního zažívacího traktu; • negativní regulace specifikace osudu mezodermálních buněk; • vnitřní buněčná hmota buněčná morfogeneze; • negativní regulace signální dráhy Wnt; • stabilizace bílkovin; • tvorba endokardu; • morfogeneze výtokového traktu; • signální transdukce zapojená do regulace genové exprese; • stanovení osudu endodermální buňky; • transkripce mRNA z promotoru RNA polymerázy II; • regulace specifikace osudu mezodermálních buněk; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Wnt signální cesta; • diferenciace endokardiálních buněk; • regulace specifikace osudu srdečních buněk; • transkripce, chráněná DNA; • diferenciace kmenových buněk; • vývoj embryonální srdeční trubice; • vaskulogeneze; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • srdeční smyčky; • stanovení osudu srdečních buněk; • společný vývoj žlučovodů; • negativní regulace signální dráhy Wnt zapojené do vývoje srdce; • rostrocaudální neurální trubice; • pozitivní regulace genové exprese; • kardiogenní morfogeneze desek; • tvorba srdce; • morfogeneze embryonální srdeční trubice; • negativní regulace buněčného růstu; • destabilizace bílkovin; • angiogeneze; • spermatogeneze; • pozitivní regulace buněčné diferenciace; • regulace dělení kmenových buněk; • gastrulace; • vývoj žlučníku; • kanonická signální cesta Wnt; • regulace diferenciace buněk; • buněčná migrace spojená s gastrulací; • tvorba endodermu; • regulace proliferace kmenových buněk; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na faktor inhibující leukémii; • diferenciace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	64321
	20671
	ENSG00000164736
	ENSMUSG00000025902
	Q9H6I2
	Q61473
	NM_022454
	NM_001289464; NM_001289465; NM_001289466; NM_001289467; NM_011441
	NP_071899
	NP_001276393; NP_001276394; NP_001276395; NP_001276396; NP_035571
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

SRY box 17 je protein že u lidí je kódován SOX17 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny transkripčních faktorů SOX (SRY-příbuzný HMG-box) podílejících se na regulaci embryonálního vývoje a na stanovení buněčného osudu. Kódovaný protein může působit jako transkripční regulátor po vytvoření proteinového komplexu s jinými proteiny.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164736 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025902 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: SRY-box 17". Citováno 2017-09-07.

Další čtení

Zhang W, Glöckner SC, Guo M, Machida EO, Wang DH, Easwaran H, Van Neste L, Herman JG, Schuebel KE, Watkins DN, Ahuja N, Baylin SB (2008). „Epigenetická inaktivace kanonického antagonisty Wnt SRY-box obsahující gen 17 u kolorektálního karcinomu“. Cancer Res. 68 (8): 2764–72. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6349. PMC 2823123. PMID 18413743.
Patterson ES, Addis RC, Shamblott MJ, Gearhart JD (2008). "SOX17 přímo aktivuje transkripci Zfp202 během diferenciace endodermu in vitro". Physiol. Genomika. 34 (3): 277–84. doi:10.1152 / physiolgenomics.90236.2008. PMID 18523156.
Ferrell RE, Kimak MA, Lawrence EC, Finegold DN (2008). "Analýza kandidátních genů u primárního lymfedému". Lymphat Res Biol. 6 (2): 69–76. doi:10.1089 / lrb.2007.1022. PMID 18564921.
Séguin CA, Draper JS, Nagy A, Rossant J (2008). „Stanovení progenitorů endodermu expresí transkripčního faktoru SOX v lidských embryonálních kmenových buňkách“. Buňková kmenová buňka. 3 (2): 182–95. doi:10.1016 / j.stem.2008.06.018. PMID 18682240.
Semb H (2008). „Rozšiřitelné endodermální progenitory: nové nástroje pro zkoumání endodermu a jeho derivátů“. Buňková kmenová buňka. 3 (4): 355–6. doi:10.1016 / j.stem.2008.09.010. PMID 18940723.
Fu DY, Wang ZM, Li-Chen, Wang BL, Shen ZZ, Huang W, Shao ZM (2010). „Sox17, kanonický antagonista Wnt, je epigeneticky inaktivován methylací promotoru u lidské rakoviny prsu“. Breast Cancer Res. Zacházet. 119 (3): 601–12. doi:10.1007 / s10549-009-0339-8. PMID 19301122. S2CID 8614063.
Nonaka D (2009). „Diferenciální exprese SOX2 a SOX17 v nádorech zárodečných buněk varlat“. Dopoledne. J. Clin. Pathol. 131 (5): 731–6. doi:10.1309 / AJCP7MNCNBCRN8NO. PMID 19369635.
Du YC, Oshima H, Oguma K, Kitamura T, Itadani H, Fujimura T, Piao YS, Yoshimoto T, Minamoto T, Kotani H, Taketo MM, Oshima M (2009). "Indukce a down-regulace Sox17 a její možné role v průběhu gastrointestinální tumorigeneze". Gastroenterologie. 137 (4): 1346–57. doi:10.1053 / j.gastro.2009.06.041. PMID 19549530.
Stefanovic S, Abboud N, Désilets S, Nury D, Cowan C, Pucéat M (2009). „Souhra 4. října se Sox2 a Sox17: molekulární přechod z pluripotence kmenových buněk ke specifikaci srdečního osudu“. J. Cell Biol. 186 (5): 665–73. doi:10.1083 / jcb.200901040. PMC 2742180. PMID 19736317.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164736 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025902 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: SRY-box 17". Citováno 2017-09-07.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]