SMG5 - SMG5

SMG5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2HWY
Identifikátory
Aliasy	SMG5, EST1B, LPTS-RP1, LPTSRP1, SMG-5, faktor rozpadu mRNA zprostředkovaný nesmyslem, faktor rozpadu mRNA zprostředkovaný nesmyslem SMG5
Externí ID	OMIM: 610962 MGI: 2447364 HomoloGene: 9095 Genové karty: SMG5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	156,282,825 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	88,362,338 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba proteinové fosfatázy 2A; • vazba histon-deacetylázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba telomerické DNA; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita ribonukleázy; • vazba ribonukleoproteinového komplexu; • vazba telomerázy RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčné jádro; • komplex telomerázy a holoenzymu;
Biologický proces	• regulace defosforylace; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, nesmysl zprostředkovaný rozpad; • export mRNA z jádra; • regulace údržby telomer; • regulace údržby telomer prostřednictvím telomerázy; • regulace stability RNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou; • údržba telomer prostřednictvím telomerázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23381
	229512
	ENSG00000198952
	ENSMUSG00000001415
	Q9UPR3
	Q6ZPY2
	NM_015327; NM_001323614; NM_001323615; NM_001323616; NM_001323617
	NM_173188; NM_178246
	NP_001310543; NP_001310544; NP_001310545; NP_001310546; NP_056142
	NP_839977
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein SMG5 je protein že u lidí je kódován SMG5 gen.^[5]^[6]^[7] Tento protein obsahuje a PIN doména který se zdá, že mutoval zbytky v aktivním místě.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198952 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001415 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Reichenbach P, Hoss M, Azzalin CM, Nabholz M, Bucher P, Lingner J (duben 2003). "Lidský homolog kvasinek Est1 se asociuje s telomerázou a uvolňuje konce chromozomů, když je nadměrně exprimován". Curr Biol. 13 (7): 568–74. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00173-8. PMID 12676087.
^ Snow BE, Erdmann N, Cruickshank J, Goldman H, Gill RM, Robinson MO, Harrington L (duben 2003). "Funkční ochrana telomerázového proteinu Est1p u lidí". Curr Biol. 13 (8): 698–704. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00210-0. PMID 12699629.
^ "Entrezův gen: SMG5 homolog Smg-5, nesmysl zprostředkovaný faktor rozpadu mRNA (C. elegans)".
^ Glavan F, Behm-Ansmant I, Izaurralde E, Conti E (listopad 2006). „Struktury PIN domén SMG6 a SMG5 odhalují nukleázu v komplexu dohledu mRNA“. EMBO J.. 25 (21): 5117–25. doi:10.1038 / sj.emboj.7601377. PMC 1630413. PMID 17053788.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K a kol. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (3): 197–205. doi:10.1093 / dnares / 6.3.197. PMID 10470851.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ohnishi T, Yamashita A, Kashima I a kol. (2004). „Fosforylace hUPF1 indukuje tvorbu mRNA sledovacích komplexů obsahujících hSMG-5 a hSMG-7“. Mol. Buňka. 12 (5): 1187–200. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00443-X. PMID 14636577.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Unterholzner L, Izaurralde E (2005). „SMG7 působí jako molekulární vazba mezi sledováním mRNA a rozpadem mRNA“. Mol. Buňka. 16 (4): 587–96. doi:10.1016 / j.molcel.2004.10.013. PMID 15546618.
Fukuhara N, Ebert J, Unterholzner L a kol. (2005). „SMG7 je adaptér podobný 14-3-3 v nesmyslně zprostředkované cestě rozpadu mRNA“. Mol. Buňka. 17 (4): 537–47. doi:10.1016 / j.molcel.2005.01.010. PMID 15721257.
Azzalin CM, Lingner J (2006). „Faktor sledování lidské RNA UPF1 je vyžadován pro progresi fáze S a stabilitu genomu.“ Curr. Biol. 16 (4): 433–9. doi:10.1016 / j.cub.2006.01.018. PMID 16488880.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Lee H, Sengupta N, Villagra A a kol. (2006). „Histon deacetyláza 8 chrání lidský stále kratší protein telomer 1B (hEST1B) před degradací zprostředkovanou ubikvitinem“. Mol. Buňka. Biol. 26 (14): 5259–69. doi:10.1128 / MCB.01971-05. PMC 1592721. PMID 16809764.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198952 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001415 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12676087-5] Reichenbach P, Hoss M, Azzalin CM, Nabholz M, Bucher P, Lingner J (duben 2003). "Lidský homolog kvasinek Est1 se asociuje s telomerázou a uvolňuje konce chromozomů, když je nadměrně exprimován". Curr Biol. 13 (7): 568–74. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00173-8. PMID 12676087.

[pmid12699629-6] Snow BE, Erdmann N, Cruickshank J, Goldman H, Gill RM, Robinson MO, Harrington L (duben 2003). "Funkční ochrana telomerázového proteinu Est1p u lidí". Curr Biol. 13 (8): 698–704. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00210-0. PMID 12699629.

[entrez-7] "Entrezův gen: SMG5 homolog Smg-5, nesmysl zprostředkovaný faktor rozpadu mRNA (C. elegans)".

[pmid17053788-8] Glavan F, Behm-Ansmant I, Izaurralde E, Conti E (listopad 2006). „Struktury PIN domén SMG6 a SMG5 odhalují nukleázu v komplexu dohledu mRNA“. EMBO J.. 25 (21): 5117–25. doi:10.1038 / sj.emboj.7601377. PMC 1630413. PMID 17053788.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]