SMEK2 - SMEK2

PPP4R3B
Identifikátory
Aliasy	PPP4R3B, FLFL2, PP4R3B, PSY2, smk1, SMEK2, regulační podjednotka proteinové fosfatázy 4
Externí ID	OMIM: 610352 MGI: 2144474 HomoloGene: 68886 Genové karty: PPP4R3B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	55,618,880 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	29,220,797 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • centrosome; • komplex protein fosfatáza 4; • cytoskelet; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • organizační centrum mikrotubulů; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• regulace metabolismu lipidů; • defosforylace bílkovin; • pozitivní regulace glukoneogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	57223
	104570
	ENSG00000275052
	ENSMUSG00000020463
	Q5MIZ7
	Q922R5
	NM_001122964; NM_001282850; NM_020463
	NM_134034
	NP_001116436; NP_001269779; NP_065196
NP_598795; NP_001350287; NP_001350288; NP_001350289; NP_001350290;
	NP_001350291
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Regulační podjednotka serin / threonin-protein fosfatáza 4 3B je enzym že u lidí je kódován SMEK2 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že SMEK2 komunikovat s PPP4C.^[8]^[9]^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275052 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020463 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“ (PDF). Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.
^ Chowdhury D, Xu X, Zhong X, Ahmed F, Zhong J, Liao J, Dykxhoorn DM, Weinstock DM, Pfeifer GP, Lieberman J (červenec 2008). „Komplex PP4-fosfatáza defosforyluje gama-H2AX generovaný během replikace DNA“. Molekulární buňka. 31 (1): 33–46. doi:10.1016 / j.molcel.2008.05.016. PMC 3242369. PMID 18614045.
^ „Entrez Gene: SMEK2 SMEK homolog 2, potlačující mek1 (Dictyostelium)“.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.

Další čtení

Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (únor 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Kittler R, Putz G, Pelletier L, Poser I, Heninger AK, Drechsel D, Fischer S, Konstantinova I, Habermann B, Grabner H, Yaspo ML, Himmelbauer H, Korn B, Neugebauer K, Pisabarro MT, Buchholz F (prosinec 2004 ). „Screening siRNA připravený endoribonukleázou v lidských buňkách identifikuje geny nezbytné pro dělení buněk“. Příroda. 432 (7020): 1036–40. doi:10.1038 / nature03159. PMID 15616564. S2CID 4372785.
Mendoza MC, Du F, Iranfar N, Tang N, Ma H, Loomis WF, Firtel RA (září 2005). „Ztráta SMEK, nového, konzervovaného proteinu, potlačuje polaritu nulových buněk MEK1, chemotaxi a defekty genové exprese“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (17): 7839–53. doi:10.1128 / MCB.25.17.7839-7853.2005. PMC 1190274. PMID 16107728.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (říjen 2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Přírodní biotechnologie. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275052 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020463 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid16085932-5] A ^b Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“ (PDF). Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.

[pmid18614045-6] Chowdhury D, Xu X, Zhong X, Ahmed F, Zhong J, Liao J, Dykxhoorn DM, Weinstock DM, Pfeifer GP, Lieberman J (červenec 2008). „Komplex PP4-fosfatáza defosforyluje gama-H2AX generovaný během replikace DNA“. Molekulární buňka. 31 (1): 33–46. doi:10.1016 / j.molcel.2008.05.016. PMC 3242369. PMID 18614045.

[entrez-7] „Entrez Gene: SMEK2 SMEK homolog 2, potlačující mek1 (Dictyostelium)“.

[pmid17353931-8] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid18715871-9] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]