SLURP1 - SLURP1

SLURP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2MUP, 2 MUO
Identifikátory
Aliasy	SLURP1, ANUP, ARS, ArsB, LY6LS, MDM, secernovaná doména LY6 / PLAUR obsahující 1, LY6-MT
Externí ID	OMIM: 606119 MGI: 1930923 HomoloGene: 10710 Genové karty: SLURP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	142,742,406 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	74,728,034 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita cytokinů; • aktivita aktivátoru acetylcholinového receptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • extracelulární; • extracelulární oblast;
Biologický proces	• buněčná adheze; • negativní regulace množení keratinocytů; • neuromuskulární proces ovládající držení těla; • pohybové chování; • aktivace buněk; • negativní regulace buněčné proliferace; • negativní regulace buněčné migrace; • signální dráha aktivátoru urokinázy plazminogenu; • pozitivní regulace aktivity receptoru; • regulace aktivity receptoru; • regulace aktivity receptoru neurotransmiteru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	57152
	57277
	ENSG00000126233
	ENSMUSG00000022596
	P55000
	Q9Z0K7
	NM_020427
	NM_020519
	NP_065160
	NP_065265
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vylučovaný protein související s Ly-6 / uPAR 1 je protein že u lidí je kódován SLURP1 gen.^[5]^[6]^[7] Vykazuje protizánětlivé účinky, působí jako tumor supresor a antagonizuje nikotinové receptory.^[8]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny Ly6 / uPAR, ale postrádá signální sekvenci ukotvení GPI. Vylučuje se do krve^[6] a také se někdy vyskytuje ve spermatu, když je extrahováno do ženské zygoty, která se váže na a7-acetylcholinový receptor^[8]. Je prokázáno, že působí jako endogenní tumor supresor tím, že snižuje migraci a invazi buněk zprostředkováním vlastního protinádorového účinku a antagonizací pro-maligních účinků nikotinu.^[8]

Mutace v tomto genu byly spojeny s Mal de Meleda, vzácná autozomálně recesivní kožní porucha charakterizovaná zánětlivou palmoplantární hyperkeratózou. To je důsledek ztráty SLURP1, která vede k dysfunkční epiteliální diferenciaci^[9] a zvýšené vylučování zánětlivých cytokinů TNFa, IL1, IL-6 a IL-8^[10]^[11].

Tento gen se mapuje do stejné chromozomální oblasti jako několik členů rodiny glykoproteinových receptorů Ly6 / uPAR.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126233 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000022596 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fischer J, Bouadjar B, Heilig R, Huber M, Lefèvre C, Jobard F, Macari F, Bakija-Konsuo A, Ait-Belkacem F, Weissenbach J, Lathrop M, Hohl D, Prud'homme JF (duben 2001). „Mutace v genu kódujícím SLURP-1 v Mal de Meleda“. Lidská molekulární genetika. 10 (8): 875–80. doi:10,1093 / hmg / 10,8,875. PMID 11285253.
^ ^A ^b Adermann K, Wattler F, Wattler S, Heine G, Meyer M, Forssmann WG, Nehls M (duben 1999). „Strukturální a fylogenetická charakterizace lidské SLURP-1, prvního vylučovaného savčího člena proteinové nadrodiny Ly-6 / uPAR“. Věda o bílkovinách. 8 (4): 810–9. doi:10.1110 / ps.8.4.810. PMC 2144295. PMID 10211827.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SLURP1 vylučovaná doména LY6 / PLAUR obsahující 1“.
^ ^A ^b ^C Throm VM, Männle D, Giese T, Bauer AS, Gaida MM, Kopitz J, Bruckner T, Plaschke K, Grekova SP, Felix K, Hackert T, Giese NA, Strobel O (únor 2018). „Endogenní CHRNA7-ligand SLURP1 jako potenciální supresor nádoru a antinikotinový faktor u rakoviny pankreatu“. Cílový cíl. 9 (14): 11734–11751. doi:10,18632 / oncotarget.24312. PMC 5837762. PMID 29545933.
^ Favre B, Plantard L, Aeschbach L, Brakch N, Christen-Zaech S, de Viragh PA, Sergeant A, Huber M, Hohl D (únor 2007). „SLURP1 je pozdní marker epidermální diferenciace a na Mal de Meleda chybí“. The Journal of Investigative Dermatology. 127 (2): 301–8. doi:10.1038 / sj.jid.5700551. PMID 17008884.
^ Swamynathan S, Buela KA, Kinchington P, Lathrop KL, Misawa H, Hendricks RL, Swamynathan SK (prosinec 2012). „Klf4 reguluje expresi Slurp1, který funguje jako imunomodulační peptid v myší rohovce“. Investigativní oftalmologie a vizuální věda. 53 (13): 8433–46. doi:10.1167 / iovs.12-10759. PMC 4113333. PMID 23139280.
^ Chernyavsky AI, Galitovskiy V, Shchepotin IB, Grando SA (2014). „Protizánětlivé účinky nikotinergních peptidů SLURP-1 a SLURP-2 na lidské intestinální epiteliální buňky a imunocyty“. BioMed Research International. 2014: 609086. doi:10.1155/2014/609086. PMC 4024406. PMID 24877120.

Další čtení

Ridge RJ, Sloane NH (leden 1996). „Částečná N-koncová aminokyselinová sekvence antineoplastického močového proteinu (ANUP) a protinádorový účinek N-koncového nonapeptidu jedinečného cytokinu přítomného v lidských granulocytech“. Cytokin. 8 (1): 1–5. doi:10.1006 / cyto.1996.0001. PMID 8742060.
Fischer J, Bouadjar B, Heilig R, Fizames C, Prud'homme JF, Weissenbach J (1999). „Genetická vazba Meledovy choroby na chromozom 8qter“. European Journal of Human Genetics. 6 (6): 542–7. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200254. PMID 9887370.
Eckl KM, Stevens HP, Lestringant GG, Westenberger-Treumann M, Traupe H, Hinz B, Frossard PM, Stadler R, Leigh IM, Nürnberg P, Reis A, Hennies HC (leden 2003). „Mal de Meleda (MDM) způsobená mutacemi genu pro SLURP-1 u pacientů z Německa, Turecka, Palestiny a Spojených arabských emirátů“. Genetika člověka. 112 (1): 50–6. doi:10.1007 / s00439-002-0838-8. PMID 12483299. S2CID 317308.
Marrakchi S, Audebert S, Bouadjar B, Has C, Lefèvre C, Munro C, Cure S, Jobard F, Morlot S, Hohl D, Prud'homme JF, Zahaf A, Turki H, Fischer J (březen 2003). „Nové mutace v genu kódujícím secernovaný lymfocytový antigen-6 / urokinázový typ aktivátoru plazminogenového receptoru související s proteinem-1 (SLURP-1) a popis pěti rodových haplotypů u pacientů s Mal de Meleda.“ The Journal of Investigative Dermatology. 120 (3): 351–5. doi:10.1046 / j.1523-1747.2003.12062.x. PMID 12603845.
Hu G, Yildirim M, Baysal V, Yerebakan O, Yilmaz E, Inaloz HS, Martinez-Mir A, Christiano AM, Celebi JT (červen 2003). „Rekurentní mutace v genu ARS (složka B) kódující SLURP-1 v tureckých rodinách s mal de Meleda: důkaz efektu zakladatele“. The Journal of Investigative Dermatology. 120 (6): 967–9. doi:10.1046 / j.1523-1747.2003.12248.x. hdl:10261/39458. PMID 12787122.
Chimienti F, Hogg RC, Plantard L, Lehmann C, Brakch N, Fischer J, Huber M, Bertrand D, Hohl D (listopad 2003). „Identifikace SLURP-1 jako epidermálního neuromodulátoru vysvětluje klinický fenotyp Mal de Meleda“. Lidská molekulární genetika. 12 (22): 3017–24. doi:10,1093 / hmg / ddg320. PMID 14506129.
Charfeddine C, Mokni M, Ben Mousli R, Elkares R, Bouchlaka C, Boubaker S, Ghedamsi S, Baccouche D, Ben Osman A, Dellagi K, Abdelhak S (prosinec 2003). „Nová missense mutace v genu kódujícím SLURP-1 u pacientů s Mal de Meleda ze severního Tuniska“. British Journal of Dermatology. 149 (6): 1108–15. doi:10.1111 / j.1365-2133.2003.05606.x. PMID 14674887. S2CID 22999382.
Mastrangeli R, Donini S, Kelton CA, He C, Bressan A, Milazzo F, Ciolli V, Borrelli F, Martelli F, Biffoni M, Serlupi-Crescenzi O, Serani S, Micangeli E, El Tayar N, Vaccaro R, Renda T , Lisciani R, Rossi M, Papoian R (2004). „ARS složka B: strukturní charakterizace, tkáňová exprese a regulace genu a proteinu (SLURP-1) spojeného s Mal de Meleda“. European Journal of Dermatology. 13 (6): 560–70. PMID 14721776.
Mokni M, Charfeddine C, Ben Mously R, Baccouche D, Kaabi B, Ben Osman A, Dellagi K, Abdelhak S (březen 2004). "Heterozygotní projevy u ženských nosiček Mal de Meleda". Klinická genetika. 65 (3): 244–6. doi:10.1111 / j.0009-9163.2004.00224.x. PMID 14756676. S2CID 46140052.
Chao SC, Lai FJ, Yang MH, Lee JY (duben 2005). „Mal de Meleda na tchajwanštině“. Journal of the Formosan Medical Association = Taiwan Yi Zhi. 104 (4): 276–8. PMID 15909066.
Arredondo J, Chernyavsky AI, Webber RJ, Grando SA (prosinec 2005). "Biologické účinky SLURP-1 na lidské keratinocyty". The Journal of Investigative Dermatology. 125 (6): 1236–41. doi:10.1111 / j.0022-202X.2005.23973.x. PMID 16354194.
Arredondo J, Chernyavsky AI, Grando SA (říjen 2007). „Nadměrná exprese SLURP-1 a -2 zmírňuje tumorigenní účinek nitrosaminu pocházejícího z tabáku na imortalizované orální epiteliální buňky“. Biochemická farmakologie. 74 (8): 1315–9. doi:10.1016 / j.bcp.2007.06.026. PMC 2046218. PMID 17643396.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126233 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000022596 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11285253-5] Fischer J, Bouadjar B, Heilig R, Huber M, Lefèvre C, Jobard F, Macari F, Bakija-Konsuo A, Ait-Belkacem F, Weissenbach J, Lathrop M, Hohl D, Prud'homme JF (duben 2001). „Mutace v genu kódujícím SLURP-1 v Mal de Meleda“. Lidská molekulární genetika. 10 (8): 875–80. doi:10,1093 / hmg / 10,8,875. PMID 11285253.

[pmid10211827-6] A ^b Adermann K, Wattler F, Wattler S, Heine G, Meyer M, Forssmann WG, Nehls M (duben 1999). „Strukturální a fylogenetická charakterizace lidské SLURP-1, prvního vylučovaného savčího člena proteinové nadrodiny Ly-6 / uPAR“. Věda o bílkovinách. 8 (4): 810–9. doi:10.1110 / ps.8.4.810. PMC 2144295. PMID 10211827.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SLURP1 vylučovaná doména LY6 / PLAUR obsahující 1“.

[:0-8] A ^b ^C Throm VM, Männle D, Giese T, Bauer AS, Gaida MM, Kopitz J, Bruckner T, Plaschke K, Grekova SP, Felix K, Hackert T, Giese NA, Strobel O (únor 2018). „Endogenní CHRNA7-ligand SLURP1 jako potenciální supresor nádoru a antinikotinový faktor u rakoviny pankreatu“. Cílový cíl. 9 (14): 11734–11751. doi:10,18632 / oncotarget.24312. PMC 5837762. PMID 29545933.

[9] Favre B, Plantard L, Aeschbach L, Brakch N, Christen-Zaech S, de Viragh PA, Sergeant A, Huber M, Hohl D (únor 2007). „SLURP1 je pozdní marker epidermální diferenciace a na Mal de Meleda chybí“. The Journal of Investigative Dermatology. 127 (2): 301–8. doi:10.1038 / sj.jid.5700551. PMID 17008884.

[10] Swamynathan S, Buela KA, Kinchington P, Lathrop KL, Misawa H, Hendricks RL, Swamynathan SK (prosinec 2012). „Klf4 reguluje expresi Slurp1, který funguje jako imunomodulační peptid v myší rohovce“. Investigativní oftalmologie a vizuální věda. 53 (13): 8433–46. doi:10.1167 / iovs.12-10759. PMC 4113333. PMID 23139280.

[11] Chernyavsky AI, Galitovskiy V, Shchepotin IB, Grando SA (2014). „Protizánětlivé účinky nikotinergních peptidů SLURP-1 a SLURP-2 na lidské intestinální epiteliální buňky a imunocyty“. BioMed Research International. 2014: 609086. doi:10.1155/2014/609086. PMC 4024406. PMID 24877120.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]