SLU7 - SLU7

SLU7
Identifikátory
Aliasy	SLU7, 9G8, hSlu7, SLU7 homolog, spojovací faktor
Externí ID	OMIM: 605974 MGI: 2385598 HomoloGene: 4690 Genové karty: SLU7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	160,421,711 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	43,447,981 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba 3'-místa sestřihu pre-mRNA; • druhá aktivita spliceosomální transesterifikace; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • vazba iontů zinku;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderná skvrna; • katalytický krok 2 spliceosom; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • malý nukleární ribonukleoproteinový komplex; • spliceosomální komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• buněčná reakce na teplo; • Sestřih RNA prostřednictvím transesterifikačních reakcí; • Zpracování mRNA; • rozpoznávání mRNA 3'-místa sestřihu; • Sestřih RNA; • transport intracelulárních proteinů; • alternativní sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Export RNA z jádra; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • export mRNA z jádra; • Zpracování mRNA 3'-end; • ukončení transkripce RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10569
	193116
	ENSG00000164609
	ENSMUSG00000020409
	O95391
	Q8BHJ9
	NM_006425
	NM_148673; NM_198936
NP_006416; NP_001351446; NP_001351447; NP_001351449; NP_001351450;
	NP_001351451; NP_001351452
	NP_683514; NP_945174
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor pre-mRNA sestřihu SLU7 je protein že u lidí je kódován SLU7 gen.^[5]^[6]^[7]

Pre-mRNA spojování probíhá ve dvou po sobě jdoucích transesterifikace kroky. Protein kódovaný tímto genem je a spojovací faktor který byl shledán nezbytným během druhého katalytického kroku procesu sestřihu pre-mRNA. Spojuje se s spliceosome a obsahuje zinkové koleno motiv který se nachází v jiných spojovacích faktorech a podílí se na protein-nukleové kyselině a interakce protein-protein.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164609 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020409 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chua K, Reed R (květen 1999). „Lidský krok II spojovací faktor hSlu7 funguje při restrukturalizaci spliceosomu mezi katalytickými kroky spojování“. Genes Dev. 13 (7): 841–50. doi:10,1101 / gad.13.7.841. PMC 316594. PMID 10197984.
^ Shomron N, Alberstein M, Reznik M, Ast G (březen 2005). „Stres mění subcelulární distribuci hSlu7 a tím moduluje alternativní sestřih“. J Cell Sci. 118 (Pt 6): 1151–9. doi:10.1242 / jcs.01720. PMID 15728250.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SLU7 SLU7 homolog spojovacího faktoru (S. cerevisiae)“.

Další čtení

Alberstein M, Amit M, Vaknin K a kol. (2008). „Regulace transkripce faktoru sestřihu RNA hSlu7 pomocí Elk-1 a Sp1 ovlivňuje alternativní sestřih“. RNA. 13 (11): 1988–99. doi:10,1261 / rna.492907. PMC 2040095. PMID 17804646.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Shomron N, Reznik M, Ast G (2005). „Splicing factor hSlu7 obsahuje jedinečnou funkční doménu potřebnou k udržení proteinu v jádře“. Mol. Biol. Buňka. 15 (8): 3782–95. doi:10,1091 / mbc.E04-02-0152. PMC 491837. PMID 15181151.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Chua K, Reed R (2001). „Předřazená AG určuje, zda je navazující AG vybrána během katalytického kroku II spojování“. Mol. Buňka. Biol. 21 (5): 1509–14. doi:10.1128 / MCB.21.5.1509-1514.2001. PMC 86697. PMID 11238888.
Chua K, Reed R (2000). "Faktor RNA sestřihu hSlu7 je vyžadován pro správnou volbu 3 'místa sestřihu". Příroda. 402 (6758): 207–10. doi:10.1038/46086. PMID 10647016. S2CID 4428185.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164609 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020409 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10197984-5] Chua K, Reed R (květen 1999). „Lidský krok II spojovací faktor hSlu7 funguje při restrukturalizaci spliceosomu mezi katalytickými kroky spojování“. Genes Dev. 13 (7): 841–50. doi:10,1101 / gad.13.7.841. PMC 316594. PMID 10197984.

[pmid15728250-6] Shomron N, Alberstein M, Reznik M, Ast G (březen 2005). „Stres mění subcelulární distribuci hSlu7 a tím moduluje alternativní sestřih“. J Cell Sci. 118 (Pt 6): 1151–9. doi:10.1242 / jcs.01720. PMID 15728250.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SLU7 SLU7 homolog spojovacího faktoru (S. cerevisiae)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]