SHPRH - SHPRH

SHPRH
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2M85, 4QN1
Identifikátory
Aliasy	SHPRH, bA545I5.2, SNF2 histonový linker PHD RING helikáza
Externí ID	OMIM: 608048 MGI: 1917581 HomoloGene: 6489 Genové karty: SHPRH
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	145,964,423 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	11,217,595 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• nukleosom; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• shromáždění nukleosomů; • polyubikvitinace bílkovin; • Oprava DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • ubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	257218
	268281
	ENSG00000146414
	ENSMUSG00000090112
	Q149N8
	Q7TPQ3
	NM_001042683; NM_173082; NM_001370327; NM_001370328
	NM_001077707; NM_001284354; NM_172937
	NP_001036148; NP_775105; NP_001357256; NP_001357257
	NP_001071175; NP_001271283; NP_766525
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza SHPRH je enzym že u lidí je kódován SHPRH gen.^[5]^[6]

Funkce

SHPRH je všudypřítomně exprimovaný protein, který obsahuje charakteristiky motivů několika proteinů pro opravu DNA, transkripčních faktorů a helikáz. [Dodává OMIM]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000146414 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000090112 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sood R, Makalowska I, Galdzicki M, Hu P, Eddings E, Robbins CM, Moses T, Namkoong J, Chen S, Trent JM (srpen 2003). „Klonování a charakterizace nového genu, SHPRH, kódujícího konzervativní putativní protein s doménami SNF2 / helikáza a PHD-prst z oblasti 6q24“. Genomika. 82 (2): 153–61. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00121-6. PMID 12837266.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SHPRH SNF2 histonový linker PHD RING helikáza“.

Další čtení

Motegi A, Sood R, Moinova H, Markowitz SD, Liu PP, Myung K (prosinec 2006). „Lidský SHPRH potlačuje genomovou nestabilitu prostřednictvím polyubikvitinace proliferujícího buněčného jaderného antigenu“. The Journal of Cell Biology. 175 (5): 703–8. doi:10.1083 / jcb.200606145. PMC 2064669. PMID 17130289.
Unk I, Hajdú I, Fátyol K, Szakál B, Blastyák A, Bermudez V, Hurwitz J, Prakash L, Prakash S, Haracska L (listopad 2006). „Lidský SHPRH je ubikvitinová ligáza pro polyubiquitylaci proliferujícího buněčného jaderného antigenu závislou na Mms2-Ubc13“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (48): 18107–12. Bibcode:2006PNAS..10318107U. doi:10.1073 / pnas.0608595103. PMC 1838714. PMID 17108083.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (srpen 2004) . „Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace“ (PDF). Aktuální biologie. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (září 1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000146414 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000090112 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12837266-5] Sood R, Makalowska I, Galdzicki M, Hu P, Eddings E, Robbins CM, Moses T, Namkoong J, Chen S, Trent JM (srpen 2003). „Klonování a charakterizace nového genu, SHPRH, kódujícího konzervativní putativní protein s doménami SNF2 / helikáza a PHD-prst z oblasti 6q24“. Genomika. 82 (2): 153–61. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00121-6. PMID 12837266.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: SHPRH SNF2 histonový linker PHD RING helikáza“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]