SH3GLB1 - SH3GLB1 - Wikipedia

SH3GLB1

Protein SH3GLB1 PDB 1x43.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
1X43

Identifikátory

SH3GLB1, Bif-1, PPP1R70, dJ612B15.2, CGI-61, doména SH3 obsahující GRB2 jako endofilin B1, doména SH3 obsahující GRB2 podobně, endofilin B1

Externí ID

OMIM: 609287 MGI: 1859730 HomoloGene: 9337 Genové karty: SH3GLB1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 1 (lidský)^[1]

Kapela	1p22.3	Start	86,704,570 bp^[1]
Kapela	1p22.3	Konec	86,748,184 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 3 (myš)^[2]

Kapela	3 \| 3 H2	Start	144,683,678 bp^[2]
Kapela	3 \| 3 H2	Konec	144,720,335 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu • GO: 0001948 vazba na proteiny • identická vazba na protein • vazba lipidů • kadherinová vazba
Buněčná složka	• cytoplazma • Golgiho aparát • membrána • Golgiho membrána • mitochondriální vnější membrána • autofagosomová membrána • střední část těla • mitochondrie • extracelulární exosom • cytoplazmatický váček • cytosol
Biologický proces	• buněčná odpověď na hladovění glukózy • regulace cytokineze • regulace stability proteinu • pozitivní regulace sestavy autofagozomu • pozitivní regulace autofagie • pozitivní regulace cílení proteinů na mitochondrie • buněčná odpověď na hladovění aminokyselin • receptorový katabolický proces • autofagie • oligomerizace proteinu • štěpení membrány • pozitivní regulace oligomerizace proteinů • pozitivní regulace membránové tubulace • autofagická buněčná smrt • regulace makroautofagie • lokalizace proteinu na vakuolární membránu • apoptotický proces
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


51100


54673


ENSG00000097033


ENSMUSG00000037062


Q9Y371


Q9JK48

RefSeq (mRNA)


NM_001206651 NM_001206652 NM_001206653 NM_016009

NM_001282037 NM_001282042 NM_019464 NM_001379170 NM_001379171
NM_001379172 NM_001379173 NM_001379174

RefSeq (protein)


NP_001193580 NP_001193581 NP_001193582 NP_057093

NP_001268966 NP_001268971 NP_062337 NP_001366099 NP_001366100
NP_001366101 NP_001366102 NP_001366103

Místo (UCSC)

Chr 1: 86,7 - 86,75 Mb

Chr 3: 144,68 - 144,72 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Endofilin-B1 je protein že u lidí je kódován SH3GLB1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

SH3GLB1 bylo prokázáno komunikovat s SH3GLB2^[5] a X protein asociovaný s Bcl-2.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000097033 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037062 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Pierrat B, Simonen M, Cueto M, Mestan J, Ferrigno P, Heim J (únor 2001). „SH3GLB, nová rodina proteinů souvisejících s endofiliny s doménou SH3“. Genomika. 71 (2): 222–34. doi:10,1006 / geno.2000.6378. PMID 11161816.
^ ^A ^b Cuddeback SM, Yamaguchi H, Komatsu K, Miyashita T, Yamada M, Wu C, Singh S, Wang HG (červen 2001). "Molekulární klonování a charakterizace Bif-1. Nový protein obsahující 3 domény homologie Src, který se asociuje s Bax". J Biol Chem. 276 (23): 20559–65. doi:10,1074 / jbc.M101527200. PMID 11259440.
^ „Entrez Gene: SH3GLB1 SH3 doména GRB2 podobný endofilin B1“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Seki N, Ohira M, Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Nakajima D, Nomura N, Ohara O (1998). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". DNA Res. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
Howard L, Nelson KK, Maciewicz RA, Blobel CP (1999). „Interakce metaloproteázy dezintegruje MDC9 a MDC15 se dvěma proteiny obsahujícími doménu SH3, endofilinem I a SH3PX1“. J. Biol. Chem. 274 (44): 31693–9. doi:10.1074 / jbc.274.44.31693. PMID 10531379.
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Modregger J, Schmidt AA, Ritter B, Huttner WB, Plomann M (2003). „Charakterizace endofilinu B1b, mozkové specifické membránové acyltransferázy kyseliny lysofosfatidové s vlastnostmi odlišnými od endofilinu A1“. J. Biol. Chem. 278 (6): 4160–7. doi:10,1074 / jbc.M208568200. PMID 12456676.
Lee SY, Wenk MR, Kim Y, Nairn AC, De Camilli P (2004). "Regulace synaptojaninu 1 cyklin-dependentní kinázou 5 na synapsích". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (2): 546–51. doi:10.1073 / pnas.0307813100. PMC 327184. PMID 14704270.
Karbowski M, Jeong SY, Youle RJ (2004). „Endofilin B1 je nutný pro udržení mitochondriální morfologie“. J. Cell Biol. 166 (7): 1027–39. doi:10.1083 / jcb.200407046. PMC 2172012. PMID 15452144.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Takahashi Y, Karbowski M, Yamaguchi H, Kazi A, Wu J, Sebti SM, Youle RJ, Wang HG (2005). „Ztráta Bif-1 potlačuje konformační změny Bax / Bak a mitochondriální apoptózu“. Mol. Buňka. Biol. 25 (21): 9369–82. doi:10.1128 / MCB.25.21.9369-9382.2005. PMC 1265816. PMID 16227588.
Masuda M, Takeda S, Sone M, Ohki T, Mori H, Kamioka Y, Mochizuki N (2006). „Doména endofilin BAR řídí zakřivení membrány dvěma nově identifikovanými mechanismy založenými na struktuře“. EMBO J.. 25 (12): 2889–97. doi:10.1038 / sj.emboj.7601176. PMC 1500852. PMID 16763557.
Lee JW, Jeong EG, Soung YH, Nam SW, Lee JY, Yoo NJ, Lee SH (2006). "Snížená exprese tumor-supresorového Bax-interagujícího faktoru 1 (Bif-1), aktivátoru Bax, v karcinomech žaludku". Patologie. 38 (4): 312–5. doi:10.1080/00313020600820880. PMID 16916719.

Galerie PDB
1x43: Struktura řešení domény SH3 endofilinu B1 (Sh3g1b1)

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.