SF3A2 - SF3A2

SF3A2
Identifikátory
Aliasy	SF3A2, PRP11, PRPF11, SAP62, SF3a66, spojovací faktor 3a podjednotka 2
Externí ID	OMIM: 600796 HomoloGene: 136815 Genové karty: SF3A2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	2,248,655 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• jaderná skvrna; • katalytický krok 2 spliceosom; • spliceosomální komplex; • malý nukleární ribonukleoproteinový komplex; • Prespliceosom typu U2; • buněčné jádro; • U2 snRNP; • nukleoplazma; • Prekatalytický spliceosom typu U2;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Zpracování mRNA; • rozpoznávání mRNA 3'-místa sestřihu; • Sestřih RNA; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů; • sestava spliceozomálního komplexu; • Sestava prespliceosomů typu U2;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8175
	n / a
	ENSG00000104897
	n / a
	Q15428
	n / a
	NM_007165
	n / a
	NP_009096
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Faktor sestřihu 3A podjednotka 2 je protein že u lidí je kódován SF3A2 gen.^[3]^[4]^[5]

Funkce

Tento gen kóduje podjednotku 2 proteinového komplexu sestřihu faktoru 3a. Heterotrimer sestřihového faktoru 3a zahrnuje podjednotky 1, 2 a 3 a je nezbytný pro in vitro konverzi 15S U2 snRNP na aktivní 17S částici, která provádí sestřih pre-mRNA. Podjednotka 2 interaguje s podjednotkou 1 prostřednictvím svého amino-konce, zatímco doména jediného zinkového prstu podjednotky 2 hraje roli při jeho vazbě na 15S U2 snRNP. Podjednotka 2 může také fungovat nezávisle na své sestřihové funkci RNA jako protein vázající mikrotubuly.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že SF3A2 komunikovat s DDX46.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104897 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bennett M, Reed R (říjen 1993). "Korespondence mezi savčí spliceosomovou složkou a základním faktorem sestřihu kvasinek". Věda. 262 (5130): 105–8. doi:10.1126 / science.8211113. PMID 8211113.
^ Dresser DW, Hacker A, Lovell-Badge R, Guerrier D (září 1995). „Geny pro protein spliceosomu (SAP62) a anti-Müllerianův hormon (AMH) sousedí“. Lidská molekulární genetika. 4 (9): 1613–8. doi:10,1093 / hmg / 4.9.1613. PMID 8541848.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SF3A2 sestřihový faktor 3a, podjednotka 2, 66 kDa“.
^ Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (září 2002). „Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box“. Časopis EMBO. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.

Další čtení

Chiara MD, Champion-Arnaud P, Buvoli M, Nadal-Ginard B, Reed R (červenec 1994). „Specifické interakce protein-protein mezi základními proteiny asociovanými se spliceosomy savců SAP 61 a SAP 114“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (14): 6403–7. doi:10.1073 / pnas.91.14.6403. PMC 44210. PMID 8022796.
Rain JC, Tartakoff AM, Krämer A, Legrain P (červen 1996). „Esenciální domény faktoru sestřihu PRP21 jsou zapojeny do vazby na proteiny PRP9 a PRP11 a jsou konzervovány evolucí“. RNA. 2 (6): 535–50. PMC 1369393. PMID 8718683.
Hong W, Bennett M, Xiao Y, Feld Kramer R, Wang C, Reed R (leden 1997). "Sdružení U2 snRNP se spliceozomálním komplexem E". Výzkum nukleových kyselin. 25 (2): 354–61. doi:10.1093 / nar / 25.2.354. PMC 146436. PMID 9016565.
Moraitou M, Patrinou-Georgoula M, Guialis A (květen 1998). "Strukturní / funkční vlastnosti savčí vícesložkové struktury obsahující všechny hlavní spliceosomální malé nukleární ribonukleoproteinové částice". The Biochemical Journal. 332 (1): 135–44. doi:10.1042 / bj3320135. PMC 1219461. PMID 9576861.
Yan D, Perriman R, Igel H, Howe KJ, Neville M, Ares M (září 1998). „CUS2, kvasinkový homolog lidského Tat-SF1, zachraňuje funkci nesprávně složeného U2 neobvyklým motivem rozpoznávání RNA“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (9): 5000–9. doi:10,1128 / mcb.18.9.5000. PMC 109085. PMID 9710584.
Neubauer G, král A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (září 1998). „Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v databázi EST umožňuje charakterizaci komplexu víceproteinových spliceosomů“. Genetika přírody. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.
Krämer A, Grüter P, Gröning K, Kastner B (červen 1999). „Kombinované biochemické a elektronové mikroskopické analýzy odhalují architekturu savčího U2 snRNP“. The Journal of Cell Biology. 145 (7): 1355–68. doi:10.1083 / jcb.145.7.1355. PMC 2133165. PMID 10385517.
Das R, Zhou Z, Reed R (květen 2000). "Funkční asociace U2 snRNP s ATP nezávislým spliceozomálním komplexem E". Molekulární buňka. 5 (5): 779–87. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80318-4. PMID 10882114.
Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (srpen 2001). „Nový protein snRNP U2 a U11 / U12, který se asociuje s místem pobočky pre-mRNA“. Časopis EMBO. 20 (16): 4536–46. doi:10.1093 / emboj / 20.16.4536. PMC 125580. PMID 11500380.
Nesic D, Krämer A (říjen 2001). „Domény v lidských spojovacích faktorech SF3a60 a SF3a66 potřebné pro vazbu na SF3a120, sestavení 17S U2 snRNP a tvorbu prespliceosomu“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (19): 6406–17. doi:10.1128 / MCB.21.19.6406-6417.2001. PMC 99788. PMID 11533230.
Dresser DW, Jamin SP, Atkins CJ, Guerrier D (říjen 2001). „Exprimovaný gen podobný GNRP sdílí obousměrný promotor s SF3A2 (SAP62) bezprostředně před AMH.“ Gen. 277 (1–2): 163–73. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00690-4. PMID 11602354.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (duben 2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (září 2002). „Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box“. Časopis EMBO. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.
Takenaka K, Nakagawa H, Miyamoto S, Miki H (srpen 2004). „Faktor sestřihu pre-mRNA SF3a66 funguje jako protein vázající a vázající mikrotubuly“. The Biochemical Journal. 382 (Pt 1): 223–30. doi:10.1042 / BJ20040521. PMC 1133934. PMID 15142036.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Nesic D, Tanackovic G, Krämer A (září 2004). „Role Cajalových orgánů v závěrečných krocích biogeneze U2 snRNP“. Journal of Cell Science. 117 (Pt 19): 4423–33. doi:10.1242 / jcs.01308. PMID 15316075.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104897 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8211113-3] Bennett M, Reed R (říjen 1993). "Korespondence mezi savčí spliceosomovou složkou a základním faktorem sestřihu kvasinek". Věda. 262 (5130): 105–8. doi:10.1126 / science.8211113. PMID 8211113.

[pmid8541848-4] Dresser DW, Hacker A, Lovell-Badge R, Guerrier D (září 1995). „Geny pro protein spliceosomu (SAP62) a anti-Müllerianův hormon (AMH) sousedí“. Lidská molekulární genetika. 4 (9): 1613–8. doi:10,1093 / hmg / 4.9.1613. PMID 8541848.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: SF3A2 sestřihový faktor 3a, podjednotka 2, 66 kDa“.

[pmid12234937-6] Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (září 2002). „Charakterizace nových proteinů SF3b a 17S U2 snRNP, včetně humánního homologu Prp5p a proteinu SF3b DEAD-box“. Časopis EMBO. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]