SEMA5A - SEMA5A

SEMA5A
Identifikátory
Aliasy	SEMA5A, SEMAF, semF, semaforin 5A
Externí ID	OMIM: 609297 MGI: 107556 HomoloGene: 2949 Genové karty: SEMA5A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	9,546,075 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	32,696,341 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba proteoglykanu na chondroitin sulfát; • vazba proteoglykanu heparan sulfát; • syndekanová vazba; • vazba semaforinových receptorů; • vazba neuropilinu; • chemorepellentní aktivita;
Buněčná složka	• membrána; • buněčná membrána; • extracelulární exosom; • integrální součást membrány; • extracelulární;
Biologický proces	• negativní regulace apoptotického procesu endotelových buněk; • negativní regulace buněčné adheze; • diferenciace buněk; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy B.; • pozitivní regulace proliferace endoteliálních buněk; • pozitivní regulace chemotaxe endotelových buněk; • signalizace buňka-buňka; • pozitivní regulace prodloužení axonu podílející se na vedení axonu; • proliferace endoteliálních buněk krevních cév zapojených do klíčení angiogeneze; • vývoj nervového systému; • pozitivní regulace angiogeneze; • vývoj mnohobuněčných organismů; • vývoj diencephalonu; • buněčná adheze; • shlukování signálů; • buněčná chemotaxe; • pozitivní chemotaxe; • axonální fasciculace; • pozitivní regulace depolymerace aktinových vláken; • negativní regulace prodloužení axonu podílející se na vedení axonu; • negativní chemotaxe; • migrace buněk neurální lišty; • pozitivní regulace buněčné migrace; • semaforin-plexinová signální dráha; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • prodloužení axonu; • vedení projekce neuronů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9037
	20356
	ENSG00000112902
	ENSMUSG00000022231
	Q13591
	Q62217; Q3UPZ0
	NM_003966
	NM_009154
	NP_003957
	NP_033180
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Semaforin-5A je protein že u lidí je kódován SEMA5A gen.^[5]^[6]^[7]

Členové rodiny semaforinových proteinů, jako je SEMA5A, jsou zapojeni do axonální vedení v době neurální vývoj (Adams et al., 1996). [Dodává OMIM]^[7]

Semaforin 5A také hraje roli v autismus, snížení schopnosti neurony k vytvoření spojení s jinými neurony v určitých oblastech mozku (Mosca-Boidron et al 2016).

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112902 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022231 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Adams RH, Betz H, Puschel AW (únor 1997). „Nová třída myších semaforinů s homologií k trombospondinu je odlišně exprimována během rané embryogeneze“. Mech Dev. 57 (1): 33–45. doi:10.1016/0925-4773(96)00525-4. PMID 8817451. S2CID 17827262.
^ Simmons AD, Puschel AW, McPherson JD, Overhauser J, Lovett M (březen 1998). "Molekulární klonování a mapování lidského semaforinu F z intervalu kandidátů na Cri-du-chat". Biochem Biophys Res Commun. 242 (3): 685–91. doi:10.1006 / bbrc.1997.8027. PMID 9464278.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SEMA5A sema doména, sedm opakování trombospondinu (typu 1 a typu 1), transmembránová doména (TM) a krátká cytoplazmatická doména, (semaforin) 5A“.

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Simmons AD, Overhauser J, Lovett M (1997). „Izolace cDNA z kritické oblasti Cri-du-chat přímým skríninkem cDNA knihovny specifické pro chromozom 5“. Genome Res. 7 (2): 118–27. doi:10,1101 / gr. 7.2.118. PMID 9049630.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Artigiani S, Conrotto P, Fazzari P a kol. (2005). „Plexin-B3 je funkční receptor pro semaforin 5A“. EMBO Rep. 5 (7): 710–4. doi:10.1038 / sj.embor.7400189. PMC 1299100. PMID 15218527.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Schmutz J, Martin J, Terry A a kol. (2004). „Sekvence DNA a srovnávací analýza lidského chromozomu 5“. Příroda. 431 (7006): 268–74. doi:10.1038 / nature02919. PMID 15372022.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Melin M, Carlsson B, Anckarsater H a kol. (2007). „Ústavní downregulace exprese SEMA5A u autismu“. Neuropsychobiologie. 54 (1): 64–9. doi:10.1159/000096040. PMC 2553518. PMID 17028446.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112902 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022231 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8817451-5] Adams RH, Betz H, Puschel AW (únor 1997). „Nová třída myších semaforinů s homologií k trombospondinu je odlišně exprimována během rané embryogeneze“. Mech Dev. 57 (1): 33–45. doi:10.1016/0925-4773(96)00525-4. PMID 8817451. S2CID 17827262.

[pmid9464278-6] Simmons AD, Puschel AW, McPherson JD, Overhauser J, Lovett M (březen 1998). "Molekulární klonování a mapování lidského semaforinu F z intervalu kandidátů na Cri-du-chat". Biochem Biophys Res Commun. 242 (3): 685–91. doi:10.1006 / bbrc.1997.8027. PMID 9464278.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SEMA5A sema doména, sedm opakování trombospondinu (typu 1 a typu 1), transmembránová doména (TM) a krátká cytoplazmatická doména, (semaforin) 5A“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]