SEMA3F - SEMA3F

SEMA3F
Identifikátory
Aliasy	SEMA3F, SEMA-IV, SEMA4, SEMAK, semaforin 3F
Externí ID	OMIM: 601124 MGI: 1096347 HomoloGene: 20885 Genové karty: SEMA3F
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	50,189,075 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	107,710,475 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• chemorepellentní aktivita; • vazba neuropilinu; • vazba semaforinových receptorů;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární; • glutamátergická synapse; • integrální součást plazmatické membrány;
Biologický proces	• vývoj sympatického ganglia; • migrace buněk nervového hřebenu ventrálního kmene; • semaforin-plexinová signální dráha zapojená do vedení projekce neuronů; • negativní chemotaxe; • semaforin-plexinová signální dráha zapojená do vedení axonů; • axonové vedení; • vedení projekce sympatického neuronu; • migrace buněk neurální lišty podílející se na vývoji autonomního nervového systému; • pobočkový neuron navádění axonů; • strukturální organizace lícního nervu; • vývoj nervů; • rozšíření projekce sympatických neuronů; • strukturální organizace trigeminálního nervu; • prodloužení axonu zapojené do vedení axonu; • migrace buněk neurální lišty; • negativní regulace prodloužení axonu podílející se na vedení axonu; • regulace organizace postsynapse; • pozitivní regulace buněčné migrace; • semaforin-plexinová signální dráha;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6405
	20350
	ENSG00000001617
	ENSMUSG00000034684
	Q13275
	O88632
	NM_004186; NM_001318798; NM_001318800
	NM_011349; NM_001311151; NM_001379496
	NP_001305727; NP_001305729; NP_004177
	NP_001298080; NP_035479; NP_001366425
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Semaforin-3F je protein že u lidí je kódován SEMA3F gen.^[5]^[6]^[7]

The semafory jsou rodina proteinů, které se účastní signalizace. Všichni členové rodiny mají sekreční signál, seminární doménu 500 aminokyselin a 16 konzervovaných cysteinových zbytků (Kolodkin et al., 1993). Porovnání sekvencí seskupilo vylučované semaforiny do 3 obecných tříd (třídy 2, 3 a V), které všechny mají také imunoglobulinovou doménu. Rodina semaforinů 3, skládající se z lidských semaforinů 3A-G (SEMA3A; MIM 603961), kuřecího kolapsinu a myších semaforinů 3A-G, všechny mají základní doménu na C konci. Kuřecí kolapsin přispívá k hledání dráhy axony během vývoje inhibicí prodloužení růstových kuželů (Luo et al., 1993) prostřednictvím interakce s proteinem zprostředkujícím odezvu na kolapsin s relativní molekulovou hmotností 62K (CRMP62) (Goshima et al., 1995), domnělý homolog produktu genu UNC33 spojeného s axonálním vedením (MIM 601168). SEMA3F je vylučovaný člen rodiny semaforin III. [Dodáno společností OMIM]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000001617 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034684 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Xiang RH, Hensel CH, Garcia DK, Carlson HC, Kok K, Daly MC, Kerbacher K, van den Berg A, Veldhuis P, Buys CH, Naylor SL (září 1996). „Izolace genu pro lidský semaforin III / F (SEMA3F) na chromozomu 3p21, oblasti odstraněné u rakoviny plic“. Genomika. 32 (1): 39–48. doi:10.1006 / geno.1996.0074. PMID 8786119.
^ Roche J, Boldog F, Robinson M, Robinson L, Varella-Garcia M, Swanton M, Wagoner B, Fishel R, Franklin W, Gemmill R, Drabkin H (červenec 1996). „Výrazné delece 3p21.3 u rakoviny plic a identifikace nového lidského semaforinu“. Onkogen. 12 (6): 1289–97. PMID 8649831.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SEMA3F sema doména, imunoglobulinová doména (Ig), krátká základní doména, vylučovaná, (semaforin) 3F“.

Další čtení

Goshima Y, Nakamura F, Strittmatter P, Strittmatter SM (1995). „Kolapsinem indukovaný kolaps růstového kuželu zprostředkovaný intracelulárním proteinem souvisejícím s UNC-33“. Příroda. 376 (6540): 509–14. doi:10.1038 / 376509a0. PMID 7637782. S2CID 4309140.
Kolodkin AL, Matthes DJ, Goodman CS (1994). „Semaforinové geny kódují rodinu transmembránových a vylučovaných naváděcích molekul růstového kuželu“. Buňka. 75 (7): 1389–99. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90625-Z. PMID 8269517. S2CID 21047504.
Luo Y, Raible D, Raper JA (1993). „Kolapsin: bílkovina v mozku, která vyvolává kolaps a paralýzu neuronových růstových kuželů“. Buňka. 75 (2): 217–27. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 80064-L. PMID 8402908. S2CID 46120825.
Sekido Y, Bader S, Latif F a kol. (1996). „Lidské semaforiny A (V) a IV se nacházejí v deleční oblasti malobuněčného karcinomu plic 3p21.3 a vykazují odlišné vzorce exprese.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (9): 4120–5. doi:10.1073 / pnas.93.9.4120. PMC 39497. PMID 8633026.
Chen H, He Z, Bagri A, Tessier-Lavigne M (1999). „Interakce semaforinu a neuropilinu, které jsou základem odpovědí sympatických axonů na semaforiny třídy III“. Neuron. 21 (6): 1283–90. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80648-0. PMID 9883722.
Hirsch E, Hu LJ, Prigent A a kol. (1999). "Distribuce semaforinu IV v mozku dospělého člověka". Brain Res. 823 (1–2): 67–79. doi:10.1016 / S0006-8993 (99) 01103-8. PMID 10095013. S2CID 46511802.
Brambilla E, Constantin B, Drabkin H, Roche J (2000). „Lokalizace semaforinu SEMA3F v maligních lidských plicích a buněčných liniích: Navrhovaná role v buněčné adhezi a migraci buněk“. Dopoledne. J. Pathol. 156 (3): 939–50. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 64962-0. PMC 1876858. PMID 10702410.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nasarre P, Constantin B, Rouhaud L a kol. (2003). „Semaforin SEMA3F a VEGF mají protichůdné účinky na připojení a šíření buněk“. Neoplazie. 5 (1): 83–92. doi:10.1016 / s1476-5586 (03) 80020-9. PMC 1502125. PMID 12659673.
Lantuéjoul S, Constantin B, Drabkin H a kol. (2003). "Exprese VEGF, semaforinu SEMA3F a jejich společných receptorů neuropilinů NP1 a NP2 v preinvazivních bronchiálních lézích, plicních nádorech a buněčných liniích". J. Pathol. 200 (3): 336–47. doi:10,1002 / cesta.1367. PMID 12845630. S2CID 1283756.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Bielenberg DR, Hida Y, Shimizu A a kol. (2004). „Semaforin 3F, chemorepulsant pro endotelové buňky, indukuje špatně vaskularizovaný, zapouzdřený, nemetastatický fenotyp nádoru“. J. Clin. Investovat. 114 (9): 1260–71. doi:10,1172 / JCI21378. PMC 524226. PMID 15520858.
Gu C, Yoshida Y, Livet J a kol. (2005). "Semaforin 3E a plexin-D1 kontrolují vaskulární vzorec nezávisle na neuropilinech". Věda. 307 (5707): 265–8. doi:10.1126 / science.1105416. PMID 15550623. S2CID 36470855.
Papež SN, Lee IR (2005). „Kvasinková dvouhybridní identifikace prostatických proteinů interagujících s globulinem vázajícím lidské pohlavní hormony“. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 94 (1–3): 203–8. doi:10.1016 / j.jsbmb.2005.01.007. PMID 15862967. S2CID 9746088.
Kusy S, Nasarre P, Chan D a kol. (2005). "Selektivní potlačení in vivo tumorigenicity semaforinem SEMA3F v buňkách rakoviny plic". Neoplazie. 7 (5): 457–65. doi:10.1593 / neo.04721. PMC 1501157. PMID 15967098.
Futamura M, Kamino H, Miyamoto Y a kol. (2007). „Možná role semaforinu 3F, kandidátního tumor supresorového genu na 3p21.3, při potlačení angiogeneze tumoru regulované p53“. Cancer Res. 67 (4): 1451–60. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2485. PMID 17308083.
Guttmann-Raviv N, Shraga-Heled N, Varshavsky A, et al. (2007). „Semaforin-3A a semaforin-3F spolupracují na odpuzování endoteliálních buněk a na inhibici jejich přežití indukcí apoptózy“. J. Biol. Chem. 282 (36): 26294–305. doi:10,1074 / jbc.M609711200. PMID 17569671.
Menon L, Mihailescu MR (2007). „Interakce G kvarteta tvořícího semaforinovou 3F RNA s RGG box doménou rodiny křehkých X proteinů“. Nucleic Acids Res. 35 (16): 5379–92. doi:10.1093 / nar / gkm 581. PMC 2018618. PMID 17693432.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000001617 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034684 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8786119-5] Xiang RH, Hensel CH, Garcia DK, Carlson HC, Kok K, Daly MC, Kerbacher K, van den Berg A, Veldhuis P, Buys CH, Naylor SL (září 1996). „Izolace genu pro lidský semaforin III / F (SEMA3F) na chromozomu 3p21, oblasti odstraněné u rakoviny plic“. Genomika. 32 (1): 39–48. doi:10.1006 / geno.1996.0074. PMID 8786119.

[pmid8649831-6] Roche J, Boldog F, Robinson M, Robinson L, Varella-Garcia M, Swanton M, Wagoner B, Fishel R, Franklin W, Gemmill R, Drabkin H (červenec 1996). „Výrazné delece 3p21.3 u rakoviny plic a identifikace nového lidského semaforinu“. Onkogen. 12 (6): 1289–97. PMID 8649831.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SEMA3F sema doména, imunoglobulinová doména (Ig), krátká základní doména, vylučovaná, (semaforin) 3F“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]