SCAND1 - SCAND1

SCAND1
Identifikátory
Aliasy	SCAND1, RAZ1, SDP1, SCAN doména obsahující 1
Externí ID	OMIM: 610416 MGI: 1343132 HomoloGene: 10642 Genové karty: SCAND1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	35,959,472 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	156,312,747 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • Vazba DNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51282
	19018
	ENSG00000171222
	ENSMUSG00000046229
	P57086
	Q2M4I6
	NM_033630; NM_016558
	NM_020255
	NP_057642; NP_361012
	NP_064651
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující doménu SCAN 1 je protein že u lidí je kódován SCAND1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

SCAN doména je vysoce konzervovaný motiv bohatý na leucin přibližně 60 aminokyselin původně nalezený v podrodině proteinů se zinkovým prstem. Tento gen patří do rodiny genů, které kódují izolovanou SCAN doménu, ale žádný motiv zinkových prstů. Funkční studie prokázaly, že SCAN box je doména proteinové interakce, která zprostředkovává jak hetero-, tak homoproteinové asociace a může se podílet na regulaci transkripční aktivity. Pro tento gen byly popsány dvě varianty transkriptu s různými 5 'UTR, ale kódující stejný protein.^[8]

Interakce

SCAND1 bylo prokázáno komunikovat s MZF1.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171222 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000046229 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Sander TL, Haas AL, Peterson MJ, Morris JF (duben 2000). „Identifikace nového proteinu souvisejícího se SCAN boxem, který interaguje s MZF1B. SCAN box bohatý na leucin zprostředkovává asociace hetero- a homoproteinů“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (17): 12857–67. doi:10.1074 / jbc.275.17.12857. PMID 10777584.
^ Schumacher C, Wang H, Honer C, Ding W, Koehn J, Lawrence Q, Coulis CM, Wang LL, Ballinger D, Bowen BR, Wagner S (červen 2000). „SCAN doména zprostředkovává selektivní oligomerizaci“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (22): 17173–9. doi:10,1074 / jbc.M000119200. PMID 10747874.
^ Babb R, Bowen BR (březen 2003). „SDP1 je peroxisomový proliferátorem aktivovaný receptor gama 2 koaktivátor, který se váže přes svou SCAN doménu“. The Biochemical Journal. 370 (Pt 2): 719–27. doi:10.1042 / BJ20021378. PMC 1223195. PMID 12444922.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SCAND1 SCAN doména obsahující 1“.

Další čtení

Williams AJ, Blacklow SC, Collins T (prosinec 1999). „Pole SCAN spojené se zinkovým prstem je konzervovaná doména oligomerizace“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (12): 8526–35. doi:10.1128 / mcb.19.12.8526. PMC 84969. PMID 10567577.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Sander TL, Morris JF (srpen 2002). "Charakterizace pole SCAN kódujícího gen RAZ1: analýza transkriptů cDNA, exprese a lokalizace buněk". Gen. 296 (1–2): 53–64. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00792-8. PMID 12383503.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Carneiro FR, Silva TC, Alves AC, Haline-Vaz T, Gozzo FC, Zanchin NI (duben 2006). "Spektroskopická charakterizace nádorového antigenu NY-REN-21 a identifikace tvorby heterodimeru pomocí SCAND1". Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 343 (1): 260–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.02.140. PMID 16540086.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171222 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000046229 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10777584-5] A ^b Sander TL, Haas AL, Peterson MJ, Morris JF (duben 2000). „Identifikace nového proteinu souvisejícího se SCAN boxem, který interaguje s MZF1B. SCAN box bohatý na leucin zprostředkovává asociace hetero- a homoproteinů“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (17): 12857–67. doi:10.1074 / jbc.275.17.12857. PMID 10777584.

[pmid10747874-6] Schumacher C, Wang H, Honer C, Ding W, Koehn J, Lawrence Q, Coulis CM, Wang LL, Ballinger D, Bowen BR, Wagner S (červen 2000). „SCAN doména zprostředkovává selektivní oligomerizaci“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (22): 17173–9. doi:10,1074 / jbc.M000119200. PMID 10747874.

[pmid12444922-7] Babb R, Bowen BR (březen 2003). „SDP1 je peroxisomový proliferátorem aktivovaný receptor gama 2 koaktivátor, který se váže přes svou SCAN doménu“. The Biochemical Journal. 370 (Pt 2): 719–27. doi:10.1042 / BJ20021378. PMC 1223195. PMID 12444922.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: SCAND1 SCAN doména obsahující 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]