SARS koronavirová X4 podobná proteinová doména - SARS coronavirus X4 like protein domain

SARS koronavirová X4 podobná proteinová doména
PDB 1xak EBI.jpg
Struktura doplňkového proteinu SARS-koronavirus orf7a
Identifikátory
SymbolSARS_X4
PfamPF08779
InterProIPR014888

v molekulární biologie, Jako SARS coronavirus X4 proteinová doména se běžně zkracuje na SARS-X4. Tato proteinová doména se nachází pouze v doméně viry konkrétně koronaviry. X4 je proteinová doména, která je jedinečným typem I. transmembránový protein. Je pojmenován po viru, ve kterém byl poprvé objeven, SARS-CoV virus, který způsobuje vážný akutní syndrom dýchací soustavy.[1]

Funkce

Přesný protein podobný proteinu SARS X4 zbývá objasnit, nicméně se předpokládá, že ano vazba činnost do integrin Já domén.[2] Navíc se předpokládá, že indukuje apoptóza přes a kaspáza závislá cesta v různých typech tkáň; nebo jednodušeji řečeno vyvolávající buněčná smrt přes enzymatický cesta.[3] Také obsahuje a motiv u kterého bylo prokázáno, že zprostředkovává COPII závislá doprava z endoplazmatické retikulum a protein je zaměřen na Golgiho aparát. Zůstává neznámo, proč může být protein zapojen do obchodování s buňkami.[4]

Struktura

The struktura z koronavirus X4 protein (známé také jako ORF7a a U122) vykazuje podobnosti s imunoglobulin jako složit navzdory skutečnosti, že nesdílejí podobnost sekvence.[2] Jejich struktura obsahuje sedm beta řetězců, které tvoří dva beta listy, kompaktně uspořádané do imunoglobulinového beta sendvičového záhybu.[1]

Reference

  1. ^ A b Nelson CA, Pekosz A, Lee CA, Diamond MS, Fremont DH (2005). "Struktura a intracelulární cílení doplňkového proteinu SARS-koronaviru Orf7a". Struktura. 13 (1): 75–85. doi:10.1016 / j.str.2004.10.010. PMC  7125549. PMID  15642263.
  2. ^ A b Hänel K, Stangler T, Stoldt M, Willbold D (květen 2006). „Struktura roztoku proteinu X4 kódovaného koronavirem souvisejícím se SARS odhaluje záhyb podobný imunoglobulinu a naznačuje vazebnou aktivitu k doménám integrinu I“. J. Biomed. Sci. 13 (3): 281–93. doi:10.1007 / s11373-005-9043-9. PMC  7089389. PMID  16328780.
  3. ^ Satija N, Lal SK (2007). „Molekulární biologie koronaviru SARS“. Ann N Y Acad Sci. 1102: 26–38. doi:10.1196 / annals.1408.002. PMC  7168024. PMID  17470909.
  4. ^ Pekosz A, Schaecher SR, Diamond MS, Fremont DH, Sims AC, Baric RS (2006). "Struktura, exprese a intracelulární lokalizace doplňkových proteinů SARS-CoV 7a a 7b". Adv Exp Med Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 581: 115–20. doi:10.1007/978-0-387-33012-9_20. ISBN  978-0-387-26202-4. PMC  7123408. PMID  17037516.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR014888