S100P - S100P

S100P
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1J55, 1OZO, 2 MJW
Identifikátory
Aliasy	S100P, MIG9, S100 protein vázající vápník P
Externí ID	OMIM: 600614 HomoloGene: 81743 Genové karty: S100P
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	6,697,170 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na RAGE receptor; • vazba kovových iontů; • vazba na bílkoviny závislá na vápníku; • vazba iontů hořčíku; • kadherinová vazba; • vazba iontů přechodného kovu; • aktivita homodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• buněčná membrána; • buněčná projekce; • extracelulární exosom; • membrána; • buněčné jádro; • microvillus membrána; • cytoplazma; • extracelulární oblast; • jaderné těleso; • lumen sekreční granule;
Biologický proces	• reakce na organickou látku; • migrace endotelových buněk; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6286
	n / a
	ENSG00000163993
	n / a
	P25815
	n / a
	NM_005980
	n / a
	NP_005971
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

S100 protein vázající vápník P (S100P) je protein že u lidí je kódován S100P gen.^[3]^[4]^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem Rodina proteinů S100 obsahující 2 motivy EF vázající vápník. Proteiny S100 jsou lokalizovány v cytoplazmě a / nebo jádru široké škály buněk a podílejí se na regulaci řady buněčných procesů, jako je progrese a diferenciace buněčného cyklu. Geny S100 zahrnují alespoň 13 členů, které jsou umístěny jako shluk na chromozomu 1q21; tento gen je však lokalizován na 4p16. Tento protein kromě vazby Ca²⁺, také váže Zn²⁺ a Mg²⁺. Tento protein může hrát roli v etiologii rakoviny prostaty.^[5]

Interakce

S100P bylo prokázáno komunikovat s EZR ^[6] a RAGE.^[7] Interakce mezi S100P a RAGE jsou narušeny cromolynem^[8] a pentamidin.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163993 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Engelkamp D, Schäfer BW, Mattei MG, Erne P, Heizmann CW (srpen 1993). „Šest genů S100 je seskupeno na lidském chromozomu 1q21: identifikace dvou genů kódujících dva dříve nehlášené proteiny vázající vápník S100D a S100E“. Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (14): 6547–51. doi:10.1073 / pnas.90.14.6547. PMC 46969. PMID 8341667.
^ Schäfer BW, Wicki R, Engelkamp D, Mattei MG, Heizmann CW (červen 1995). „Izolace klonu YAC pokrývající shluk devíti genů S100 na lidském chromozomu 1q21: zdůvodnění nové nomenklatury rodiny proteinů vázajících vápník S100“. Genomika. 25 (3): 638–43. doi:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.
^ ^A ^b „Entrez Gene: S100P S100 protein vázající vápník P“.
^ Koltzscher M, Neumann C, König S, Gerke V (červen 2003). "Vazba závislá na Ca2 + a aktivace spícího ezrinu dimerním S100P". Molekulární biologie buňky. 14 (6): 2372–84. doi:10,1091 / mbc.E02-09-0553. PMC 194886. PMID 12808036.
^ ^A ^b Penumutchu SR, Chou RH, Yu C (2014-08-01). „Strukturální pohledy na vápník vázaný S100P a V doménu komplexu RAGE“. PLOS ONE. 9 (8): e103947. doi:10.1371 / journal.pone.0103947. PMC 4118983. PMID 25084534.
^ Penumutchu SR, Chou RH, Yu C (říjen 2014). "Interakce mezi S100P a antialergickým lékem cromolyn". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 454 (3): 404–409. doi:10.1016 / j.bbrc.2014.10.048. PMID 25450399.

Další čtení

Schäfer BW, Heizmann CW (1996). "Rodina S100 EF-ručních proteinů vázajících vápník: funkce a patologie". Trends Biochem. Sci. 21 (4): 134–40. doi:10.1016 / S0968-0004 (96) 80167-8. PMID 8701470.
Emoto Y, Kobayashi R, Akatsuka H, Hidaka H (1992). "Čištění a charakterizace nového člena rodiny proteinů S-100 z lidské placenty". Biochem. Biophys. Res. Commun. 182 (3): 1246–53. doi:10.1016 / 0006-291X (92) 91865-N. PMID 1540168.
Becker T, Gerke V, Kube E, Weber K (1992). "S100P, nový protein vázající Ca (2 +) z lidské placenty. Klonování cDNA, exprese rekombinantního proteinu a vlastnosti vázání Ca2 +". Eur. J. Biochem. 207 (2): 541–7. doi:10.1111 / j.1432-1033.1992.tb17080.x. PMID 1633809.
Gribenko AV, Makhatadze GI (1998). "Oligomerizace a vazba dvojmocných iontů na protein S100P: model přepínače Ca2 + / Mg2 +". J. Mol. Biol. 283 (3): 679–94. doi:10.1006 / jmbi.1998.2116. PMID 9784376.
Koltzscher M, Gerke V (2000). "Identifikace hydrofobních aminokyselinových zbytků podílejících se na tvorbě S100P homodimerů in vivo". Biochemie. 39 (31): 9533–9. doi:10.1021 / bi000257 +. PMID 10924150.
Harvell JD, Fulton R, Jones CD, Terris DJ, Warnke RA (2001). "Složený novotvar dendritických buněk (NOS) a malý lymfocytární lymfom". Appl. Imunohistochem. Mol. Morfol. 8 (4): 322–8. doi:10.1097/00022744-200012000-00010. PMID 11127925.
Gribenko AV, Hopper JE, Makhatadze GI (2002). "Molekulární charakterizace a tkáňová distribuce nového člena rodiny S100 proteinů EF-hand". Biochemie. 40 (51): 15538–48. doi:10.1021 / bi0114731. PMID 11747429.
Gribenko AV, Guzmán-Casado M, Lopez MM, Makhatadze GI (2003). "Konformační a termodynamické vlastnosti peptidu vázajícího se na lidský protein S100P". Protein Sci. 11 (6): 1367–75. doi:10.1110 / ps.0202202. PMC 2373636. PMID 12021435.
Filipek A, Jastrzebska B, Nowotny M, Kuznicki J (2002). „CacyBP / SIP, kalcyklin a protein interagující se Siah-1, váže proteiny EF-hand z rodiny S100“. J. Biol. Chem. 277 (32): 28848–52. doi:10,1074 / jbc.M203602200. PMID 12042313.
Zhang H, Wang G, Ding Y, Wang Z, Barraclough R, Rudland PS, Fernig DG, Rao Z (2003). "Krystalová struktura při rozlišení 2A proteinu S100P vázajícího Ca2 +". J. Mol. Biol. 325 (4): 785–94. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 01278-0. PMID 12507480.
Nowotny M, Spiechowicz M, Jastrzebska B, Filipek A, Kitagawa K, Kuznicki J (2003). "Vápníkem regulovaná interakce Sgt1 s S100A6 (kalcyklin) a dalšími proteiny S100". J. Biol. Chem. 278 (29): 26923–8. doi:10,1074 / jbc.M211518200. PMID 12746458.
Koltzscher M, Neumann C, König S, Gerke V (2004). "Vazba závislá na Ca2 + a aktivace spícího ezrinu dimerním S100P". Mol. Biol. Buňka. 14 (6): 2372–84. doi:10,1091 / mbc.E02-09-0553. PMC 194886. PMID 12808036.
Arumugam T, Simeone DM, Schmidt AM, Logsdon CD (2004). „S100P stimuluje buněčnou proliferaci a přežití prostřednictvím receptoru pro aktivované konečné produkty glykace (RAGE)“. J. Biol. Chem. 279 (7): 5059–65. doi:10,1074 / jbc.M310124200. PMID 14617629.
Jin G, Wang S, Hu X, Jing Z, Chen J, Ying K, Xie Y, Mao Y (2004). "Charakterizace tkáňově specifické exprese genu s100P, který kóduje EF-ruka vázající protein Ca2 +". Mol. Biol. Rep. 30 (4): 243–8. doi:10.1023 / A: 1026311423326. PMID 14672411. S2CID 2276667.
Sato N, Fukushima N, Matsubayashi H, Goggins M (2004). „Identifikace maspinu a S100P jako nových cílů hypomethylace u rakoviny pankreatu pomocí globálního profilování genové exprese“. Onkogen. 23 (8): 1531–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207269. PMID 14716296.
Lee YC, Volk DE, Thiviyanathan V, Kleerekoper Q, Gribenko AV, Zhang S, Gorenstein DG, Makhatadze GI, Luxon BA (2005). "NMR struktura proteinu Apo-S100P". J. Biomol. NMR. 29 (3): 399–402. doi:10.1023 / B: JNMR.0000032617.88899.4b. PMID 15213440. S2CID 86444278.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163993 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8341667-3] Engelkamp D, Schäfer BW, Mattei MG, Erne P, Heizmann CW (srpen 1993). „Šest genů S100 je seskupeno na lidském chromozomu 1q21: identifikace dvou genů kódujících dva dříve nehlášené proteiny vázající vápník S100D a S100E“. Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (14): 6547–51. doi:10.1073 / pnas.90.14.6547. PMC 46969. PMID 8341667.

[pmid7759097-4] Schäfer BW, Wicki R, Engelkamp D, Mattei MG, Heizmann CW (červen 1995). „Izolace klonu YAC pokrývající shluk devíti genů S100 na lidském chromozomu 1q21: zdůvodnění nové nomenklatury rodiny proteinů vázajících vápník S100“. Genomika. 25 (3): 638–43. doi:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: S100P S100 protein vázající vápník P“.

[pmid12808036-6] Koltzscher M, Neumann C, König S, Gerke V (červen 2003). "Vazba závislá na Ca2 + a aktivace spícího ezrinu dimerním S100P". Molekulární biologie buňky. 14 (6): 2372–84. doi:10,1091 / mbc.E02-09-0553. PMC 194886. PMID 12808036.

[pmid25084534-7] A ^b Penumutchu SR, Chou RH, Yu C (2014-08-01). „Strukturální pohledy na vápník vázaný S100P a V doménu komplexu RAGE“. PLOS ONE. 9 (8): e103947. doi:10.1371 / journal.pone.0103947. PMC 4118983. PMID 25084534.

[8] Penumutchu SR, Chou RH, Yu C (říjen 2014). "Interakce mezi S100P a antialergickým lékem cromolyn". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 454 (3): 404–409. doi:10.1016 / j.bbrc.2014.10.048. PMID 25450399.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]