RyeE RNA - RyeE RNA
| CyaR / Rye RNA | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence uživatele CyaR_RyeE | |
| Identifikátory | |
| Symbol | CyaR_RyeE |
| Alt. Symboly | Žito |
| Rfam | RF00112 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen; sRNA |
| Domény | Bakterie |
| TAK | SO: 0000655 |
| PDB struktur | PDBe |
The CyaR RNA (dříve známá jako RyeE RNA) nekódující RNA byl identifikován na obrazovce ve velkém měřítku Escherichia coli a byl nazýván kandidátem 14.[1] Přesné 5 'a 3' konce této RNA jsou nejisté. Tento gen leží mezi yegQ a orgK E-coli. Ukázalo se, že tato malá RNA je vázána Hfq protein. Tato RNA byla přejmenována na CyaR pro (cyklická AMP-aktivovaná RNA). Bylo prokázáno, že CyaR RNA působí jako represor porin OmpX.[2] Bylo také prokázáno, že cyaR exprese je přísně kontrolována cyklickým proteinem receptoru AMP, CRP.[2]
Přístup srovnávací genomiky dokázal detekovat a ověřit další cíle ptsI, sdhA a yobF.[3]
Viz také
Reference
- ^ Wassarman, KM; Repoila F; Rosenow C; Storz G; Gottesman S (2001). „Identifikace nových malých RNA pomocí komparativní genomiky a mikročipů“. Genes Dev. 15 (13): 1637–1651. doi:10,1101 / gad.901001. PMC 312727. PMID 11445539.
- ^ A b Papenfort K, Pfeiffer V, Lucchini S, Sonawane A, Hinton JC, Vogel J (květen 2008). „Systematická delece malých genů RNA pro Salmonella identifikuje CyaR, konzervovaný CRP-dependentní riboregulátor syntézy OmpX.“ Mol. Microbiol. 68 (4): 890–906. doi:10.1111 / j.1365-2958.2008.06189.x. PMID 18399940.
- ^ Wright PR, Richter AS, Papenfort K, Mann M, Vogel J, Hess WR, Backofen R, Georg J (2013). „Srovnávací genomika zvyšuje predikci cíle pro malé bakteriální RNA“. Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (37): E3487 – E3496. doi:10.1073 / pnas.1303248110. PMC 3773804. PMID 23980183.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |