RyeB RNA - RyeB RNA
SdsR / RyeB RNA | |
---|---|
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence uživatele SdsR_RyeB | |
Identifikátory | |
Symbol | SdsR_RyeB |
Rfam | RF00111 |
Další údaje | |
RNA typ | Gen; sRNA |
Domény | Bakterie |
TAK | SO: 0000655 |
PDB struktur | PDBe |
The SdsR / RyeB RNA je nekódující RNA který byl identifikován na obrazovce ve velkém měřítku E-coli.[1] Přesné 5 'a 3' konce této RNA jsou nejisté. Tato RNA překrývá SraC / RyeA RNA na opačné straně, což naznačuje, že tito dva mohou jednat ve vzájemné shodě. Je přepsán obecným napěťovým faktorem σs a je vysoce vyjádřen ve stacionární fázi. SdsR / RyeB RNA interaguje s Hfq.
Homologní sRNA v S. enterica Bylo prokázáno, že reguluje syntézu hlavního porinového OmpD.[2] Studie s využitím Salmonella identifikovali 20 cílů této sRNA včetně regulátoru transkripce, CRP, globálních faktorů vázajících DNA, StpA a HupB, transportního proteinu antibiotika, TolC a dvousložkového systému RtsA / B (TCS) a ověřili jejich post-transkripční kontrolu SdsR / RyeB RNA.[3]
Viz také
Reference
- ^ Wassarman KM, Repoila F, Rosenow C, Storz G, Gottesman S (červenec 2001). „Identifikace nových malých RNA pomocí komparativní genomiky a mikročipů“. Geny a vývoj. 15 (13): 1637–1651. doi:10,1101 / gad.901001. PMC 312727. PMID 11445539.
- ^ Fröhlich KS, Papenfort K, Berger AA, Vogel J (duben 2012). „Konzervovaná malá RNA závislá na RpoS řídí syntézu hlavního porinového OmpD“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (8): 3623–3640. doi:10.1093 / nar / gkr1156. PMC 3333887. PMID 22180532.
- ^ Fröhlich KS, Haneke K, Papenfort K, Vogel J (prosinec 2016). „Cílové spektrum malé RNA SdsR u Salmonella“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (21): 10406–10422. doi:10.1093 / nar / gkw632. PMC 5137417. PMID 27407104.
externí odkazy
Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |