Ruedi Aebersold - Ruedi Aebersold

Ruedi Aebersold
Ruedi Aebersold 2012.JPG
Ruedi Aebersold
narozený12. září 1954 [1]
Švýcarsko
Alma materUniversity of Basel
Vědecká kariéra
PoleProteomika
InstituceETH Curych, Ústav pro systémovou biologii
TezeVztahy mezi strukturou a funkcí hybridomových monoklonálních protilátek proti streptokokové skupině A polysacharidů. (1983)
Doktorský poradceDietmar G. Braun
Ostatní akademičtí poradciLeroy Hood

Rudolf Aebersold (známější jako Ruedi Aebersold narozen 12. září 1954 [1]) je švýcarský biolog, považovaný za průkopníka v oblasti proteomika a biologie systémů. Primárně zkoumal techniky měření bílkoviny ve složitých vzorcích, v mnoha případech prostřednictvím hmotnostní spektrometrie. Ruedi Aebersold je profesorem systémové biologie na Ústavu biologie molekulárních systémů (IMSB) v ETH Curych.[2] Byl jedním ze zakladatelů Ústav pro systémovou biologii v Seattlu ve Washingtonu, kde předtím měl výzkumnou skupinu.[3]

Ruedi Aebersold je známá vývojem a aplikací cílená proteomika techniky v oblasti biomedicínského výzkumu za účelem pochopení funkce, interakce a lokalizace každého proteinu v buňce a jeho změn v chorobných stavech.[4][5][6] Za tímto účelem Ruedi Abersold významně přispěla k vývoji a aplikaci cílených proteomických metod, včetně sledování vybraných reakcí [7][8][9] a sběr dat nezávislý.[10][11] Ruedi Aebersold je rovněž uznáván za své příspěvky při vývoji standardních formátů a softwaru s otevřeným zdrojovým kódem pro analýzu a ukládání dat hmotnostní spektrometrie a proteomiky,[12] a je jedním z vynálezců Izotopově kódovaná afinitní značka (ICAT) technika pro kvantitativní proteomiku, technika, která měří relativní množství proteinů mezi dvěma vzorky pomocí značek obsahujících stabilní izotopy různých hmot.[13][14]

Je spoluzakladatelem a vědeckým poradcem společností ProteoMediX[15] a Biognosys.[16]

Vyznamenání a ocenění

Reference

  1. ^ A b C d E „Curriculum Vitae - Ruedi Aebersold“ (PDF). Citováno 2. prosince 2012.
  2. ^ „ETH - IMSB prof. Ruedi Aebersold“. Citováno 2011-07-26.
  3. ^ „Institute for Systems Biology: Aebersold Group“. Archivovány od originál dne 2011-07-20. Citováno 2011-07-26.
  4. ^ Aebersold R, Mann M (březen 2003). "Proteomika založená na hmotnostní spektrometrii". Příroda. 422 (6928): 198–207. doi:10.1038 / nature01511. PMID  12634793. S2CID  118260.
  5. ^ Aebersold R, Mann M (září 2016). "Hmotnostní spektrometrický průzkum struktury a funkce proteomu". Příroda. 537 (7620): 347–55. doi:10.1038 / příroda1949. PMID  27629641. S2CID  4448087.
  6. ^ Bensimon A, Heck AJ, Aebersold R (2012). „Proteomika a síťová biologie založená na hmotnostní spektrometrii“. Roční přehled biochemie. 81: 379–405. doi:10,1146 / annurev-biochem-072909-100424. PMID  22439968.
  7. ^ Picotti P, Bodenmiller B, Mueller LN, Domon B, Aebersold R (srpen 2009). „Analýza proteomu S. cerevisiae v plném dynamickém rozsahu cílenou proteomikou“. Buňka. 138 (4): 795–806. doi:10.1016 / j.cell.2009.05.051. PMC  2825542. PMID  19664813.
  8. ^ Picotti P, Rinner O, Stallmach R, Dautel F, Farrah T, Domon B, Wenschuh H, Aebersold R (leden 2010). "Vysoce výkonné generování vybraných testů monitorování reakce na proteiny a proteomy". Přírodní metody. 7 (1): 43–6. doi:10.1038 / nmeth.1408. PMID  19966807. S2CID  193432.
  9. ^ Picotti P, Bodenmiller B, Aebersold R (leden 2013). "Proteomika odpovídá vědecké metodě". Přírodní metody. 10 (1): 24–7. doi:10.1038 / nmeth.2291. PMID  23269373. S2CID  1362416.
  10. ^ Gillet LC, Navarro P, Tate S, Röst H, Selevsek N, Reiter L, Bonner R, Aebersold R (červen 2012). „Cílená extrakce dat spektra MS / MS generovaná získáváním nezávislým na datech: nový koncept pro konzistentní a přesnou analýzu proteomu“. Molekulární a buněčná proteomika. 11 (6): O111.016717. doi:10,1074 / mcp.O111.016717. PMC  3433915. PMID  22261725.
  11. ^ Schubert OT, Gillet LC, Collins BC, Navarro P, Rosenberger G, Wolski WE, Lam H, Amodei D, Mallick P, MacLean B, Aebersold R (březen 2015). „Budování vysoce kvalitních knihoven testů pro cílenou analýzu dat SWATH MS“. Přírodní protokoly. 10 (3): 426–41. doi:10.1038 / nprot.2015.015. PMID  25675208. S2CID  21543665.
  12. ^ Pedrioli PG, Eng JK, Hubley R, Vogelzang M, Deutsch EW, Raught B, Pratt B, Nilsson E, Angeletti RH, Apweiler R, Cheung K, Costello CE, Hermjakob H, Huang S, Julian RK, Kapp E, McComb ME , Oliver SG, Omenn G, Paton NW, Simpson R, Smith R, Taylor CF, Zhu W, Aebersold R (listopad 2004). "Běžná otevřená reprezentace dat hmotnostní spektrometrie a jejich aplikace na proteomický výzkum". Přírodní biotechnologie. 22 (11): 1459–66. doi:10.1038 / nbt1031. PMID  15529173. S2CID  25734712.
  13. ^ Yan W, Lee H, Deutsch EW, Lazaro CA, Tang W, Chen E, Fausto N, Katze MG, Aebersold R (říjen 2004). „Soubor dat lidských jaterních proteinů identifikovaných profilováním proteinů pomocí izotopově kódované afinitní značky (ICAT) a tandemové hmotnostní spektrometrie. Molekulární a buněčná proteomika. 3 (10): 1039–41. doi:10,1074 / mcp. D400001-MCP200. PMID  15269248.
  14. ^ Gygi SP, Rist B, Gerber SA, Turecek F, Gelb MH, Aebersold R (říjen 1999). "Kvantitativní analýza komplexních proteinových směsí pomocí izotopově kódovaných afinitních značek". Přírodní biotechnologie. 17 (10): 994–9. doi:10.1038/13690. PMID  10504701. S2CID  16273431.
  15. ^ „ProteoMediX AG - poradci - Curych, Švýcarsko“. Citováno 2. prosince 2012.
  16. ^ „Náš tým | Biognosys AG“. Citováno 2. prosince 2012.
  17. ^ A b „Hlavní pocta“. Citováno 26. prosince 2017.
  18. ^ „Pionier der Eiweissforschung geehrt“. Citováno 2. prosince 2012.
  19. ^ „Cena Thomson Medal Award 2014 IMSC 2014“. Citováno 8. dubna 2014.
  20. ^ „Powerlist - analytický vědec“. Citováno 4. listopadu 2015.
  21. ^ „Bijvoetova medaile“. Bijvoet Centrum pro biomolekulární výzkum. Citováno 2018-04-24.
  22. ^ Cena Marcela Benoista 2020