Robin Allshire - Robin Allshire

Robin Allshire

FRS FRSE
narozený
Robin Campbell Allshire

1960 (věk 59–60)
Alma materUniversity of Dublin (BSc)
University of Edinburgh (PhD)
Vědecká kariéra
PoleEpigenetika
Heterochromatin
Chromatin
Centroméra
Kinetochore[1]
InstituceUniversity of Edinburgh
Cold Spring Harbor Laboratory
TezeKonstrukce a analýza vektorů založených na bovinním papilomaviru  (1985)
Doktorský poradceChris Bostock
Edwin Southern[2]
Ostatní akademičtí poradciNicholas Hastie
webová stránkaallshirelab.com

Robin Campbell Allshire (narozen 19. května 1960) FRS FRSE FMedSci[3][4][5] je profesorem Chromozóm Biologie[6] na University of Edinburgh a Wellcome Trust Principal Research Fellow.[7][1] Jeho výzkumná skupina v Wellcome Trust Centrum pro buněčnou biologii[8] se zaměřuje na epigenetické mechanismy, které řídí sestavování specializovaných domén chromatinu a jejich přenos prostřednictvím buněčného dělení.[9]

raný život a vzdělávání

Allshire vyrostl v rybářské vesnici Howth, Co Dublin 1960-1978.[Citace je zapotřebí ] Jeho rodiče byli Arthur Gordon Allshire (1925-2012), který byl farmaceutem, a Freda Margaret (rozená Schmutz; 1933-2014).[10][11] Byl oceněn jeho Bakalář umění vzdělání v oboru Genetika podle Trinity College v Dublinu, v roce 1981[Citace je zapotřebí ] kde byl motivován inspirativním učením Davida McConnella a jeho kolegů z Oddělení genetiky k postgraduálnímu studiu.[12] Následně se připojil k Rada pro lékařský výzkum (MRC) Jednotka genomu savců na University of Edinburgh kde získal své PhD v roce 1985[2] pod vedením Chrisa Bostocka a Edwin Southern vyšetřování použití hovězí papilomavirus jako podvozek pro konstrukci umělých chromozomů savců.[2]

Kariéra a výzkum

V roce 1985 se připojil Allshire Nicholas Hasties výzkumná skupina na oddělení lidské genetiky MRC v Edinburghu (dříve jednotka klinické a populační cytogentiky MRC) jako postdoktorský výzkumník kde zjistil, že savčí telomery se skládají z jednoduchých opakujících se sekvencí podobných sekvencím jednobuněčných eukaryot[13] a že délka telomer v krevních buňkách se s věkem zkracuje a dále se rozrušují v rakovinných buňkách.[14] Tato práce byla výsledkem sledování osudu štěpných kvasinek (Schizosaccharomyces pombe ) telomery po introdukci štěpných kvasinkových chromozomů do myší buňky v koloraci s Peterem Fantesem.[15] V roce 1989 nastoupil na pozici nezávislého hostujícího vědce v Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) po dobu 18 měsíců před nástupem do oddělení lidské genetiky MRC jako vedoucí juniorské skupiny. Během pobytu v CSHL se rozhodl změnit zaměření na vyšetřování chromozomálních prvků v geneticky odbouratelných štěpných kvasinkách.[16] Na MRC HGU v Edinburghu (1990 - 2002) a následně ve Wellome Trust Center for Cell Biology, University of Edinburgh (2002 - dosud) zjistil, že geny jsou umlčeny, když jsou umístěny do centromerů štěpných kvasinek[17][18] a telomery,[19] a poté využil tohoto umlčení genu k získání zásadního vhledu do procesů segregace chromozomů,[20][21][22] a heterochromatin[23][24][25][26] a kinetochore CENP-A chromatin[27][28][29][30][31][32] zřízení[33][34] a údržba.[35][36][37] Zvláště se zajímá o epigenetické mechanismy, které umožňují perzistenci specializovaných domén chromatinu prostřednictvím vícenásobného dělení buněk a meiózy.[38] Zkoumal, jak interference RNA (RNAi) zprostředkovává tvorbu heterochromatinu[39][40][41] a ukázalo se, že sestřih fatorů přispívá k integritě heterochromatinu prostřednictvím generování siRNA a RNAi.[42][43] Poskytl vhled do toho, jak může transkripce a výsledná nekódující RNA ovlivnit sestavení specializovaného chromatinu CENP-A[44][45][46][47] a prokázali, že některé transkripce lncRNA reagují na podněty prostředí a regulují sousední geny transkripční interferencí[48][49]. Nedávno pomocí štěpných kvasinek jeho tým objevil epigenetický mechanismus, který umožňuje houbám vyvinout rezistenci na antifungální léky bez změn jejich DNA.[50] Toto zjištění je důležité pro pochopení toho, jak se patogenní houby stávají rezistentními vůči omezenému počtu dostupných antifungálních látek v klinické i zemědělské oblasti.

Ocenění a vyznamenání

Allshire byl zvolen Člen Královské společnosti v Edinburghu v roce 2005 [51], a Člen královské společnosti (FRS) v roce 2011 [4] a a Člen Akademie lékařských věd (FMedSci) v roce 2020 [52].

Reference

  1. ^ A b Robin Allshire publikace indexované podle Google Scholar Upravte to na Wikidata
  2. ^ A b C Allshire, Robin Campbell (1985). Konstrukce a analýza vektorů založených na bovinním papilomaviru (Disertační práce). University of Edinburgh. hdl:1842/11176. OCLC  606010479. EThOS  uk.bl.ethos.355979. Zdarma ke čtení
  3. ^ „Profesor Robin Campbell Allshire FRS, FRSE“. rse.org.uk.
  4. ^ A b Anon (2011). „Profesor Robin Allshire FRS“. royalsociety.org. Jedna nebo více z předchozích vět obsahuje text z webu royalsociety.org, kde:

    „Veškerý text publikovaný pod nadpisem„ Životopis “na stránkách profilu Fellow je k dispozici pod Mezinárodní licence Creative Commons Attribution 4.0.” --Podmínky a zásady společnosti Royal Society na Wayback Machine (archivováno 11. 11. 2016)

  5. ^ Akademie lékařských věd https://acmedsci.ac.uk/fellows/fellows-directory/ordinary-fellows/fellow/Professor-Robin-Allshire-0028315. Chybějící nebo prázdný | název = (Pomoc)
  6. ^ „Členové laboratoře Allshire“.
  7. ^ „Hlavní výzkumná stipendia: lidé, které jsme financovali“. wellcome.ac.uk. Wellcome Trust.
  8. ^ „Wellcome Center for Cell Biology - Wellcome Center for Cell Biology“. University of Edinburgh.
  9. ^ „Wellcome Trust lab“.
  10. ^ Irish Times https://notices.irishtimes.com/death/allshire-arthur/21440606. Chybějící nebo prázdný | název = (Pomoc)
  11. ^ Irish Times https://notices.irishtimes.com/death/allshire-freda-margaret/39263256. Chybějící nebo prázdný | název = (Pomoc)
  12. ^ „EPIGENETIKA A SPECIALIZOVANÝ CHROMATIN“.
  13. ^ Allshire, Robin C; Gosden, John R; Cross, Sally H; Cranston, Gwen; Rout, Derek; Sugawara, Neal; Szostak, Jack W; Fantes, Peter A; Hastie, Nicholas D (1988). "Telomerická repetice z T. Thermophila kříž hybridizuje s lidskými telomery". Příroda. 332 (6165): 656–9. doi:10.1038 / 332656a0. PMID  2833706.
  14. ^ Hastie, Nicholas D; Dempster, Maureen; Dunlop, Malcolm G; Thompson, Alastair M; Zelená, Daryll K; Allshire, Robin C (1990). "Snížení telomer u lidského kolorektálního karcinomu a se stárnutím". Příroda. 346 (6287): 866–8. doi:10.1038 / 346866a0. PMID  2392154.
  15. ^ Allshire, R. C; Cranston, G; Gosden, J. R; Maule, J. C; Hastie, N. D; Fantes, P. A (1987). "Štěpný kvasinkový chromozom se může replikovat autonomně v myších buňkách". Buňka. 50 (3): 391–403. doi:10.1016/0092-8674(87)90493-4. PMID  3475186.
  16. ^ Allshire, R. C (1990). „Zavedení velkých lineárních minichromozomů do Schizosaccharomyces pombe vylepšeným transformačním postupem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (11): 4043–7. doi:10.1073 / pnas.87.11.4043. PMC  54043. PMID  2349217.
  17. ^ Allshire, R. C; Javerzat, J. P; Redhead, N.J; Cranston, G (1994). "Rozmístění efektu polohy v centromerech štěpných kvasinek". Buňka. 76 (1): 157–69. doi:10.1016/0092-8674(94)90180-5. PMID  8287474.
  18. ^ Allshire, R. C; Nimmo, E. R; Ekwall, K; Javerzat, J. P; Cranston, G (1995). „Mutace derepresivní tiché centromerické domény ve štěpných kvasinkách narušují segregaci chromozomů“. Geny a vývoj. 9 (2): 218–33. doi:10,1101 / gad. 9.2.218. PMID  7851795.
  19. ^ Nimmo, E. R; Cranston, G; Allshire, R. C (1994). „Rozbití chromozomu spojené s telomerem ve štěpných kvasinkách má za následek pestrou expresi sousedních genů“. Časopis EMBO. 13 (16): 3801–11. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06691.x. PMC  395293. PMID  8070408.
  20. ^ Nimmo, Elaine R; Pidoux, Alison L; Perry, Paul E; Allshire, Robin C (1998). "Vadná meióza u mutantů umlčujících telomery Schizosaccharomyces pombe". Příroda. 392 (6678): 825–8. doi:10.1038/33941. PMID  9572142.
  21. ^ Pidoux, A. L; Uzawa, S; Perry, P.E .; Cande, W. Z; Allshire, R. C (2000). "Živá analýza zaostávajících chromozomů během anafáze a jejich vliv na rychlost prodloužení vřetene u štěpných kvasinek". Journal of Cell Science. 113 Pt 23: 4177–91. PMID  11069763.
  22. ^ Bernard, P; Maure, J. F; Partridge, J. F; Genier, S; Javerzat, J. P; Allshire, R. C (2001). „Požadavek heterochromatinu na soudržnost v Centromere“. Věda. 294 (5551): 2539–42. doi:10.1126 / science.1064027. PMID  11598266.
  23. ^ Ekwall, K; Javerzat, J. P; Lorentz, A; Schmidt, H; Cranston, G; Allshire, R (1995). „Protein chromodomény Swi6: klíčová složka v centromerech štěpných kvasinek“. Věda. 269 (5229): 1429–31. doi:10.1126 / science.7660126. PMID  7660126.
  24. ^ Ekwall, K; Olsson, T; Turner, B. M; Cranston, G; Allshire, R. C (1997). "Přechodná inhibice histonové deacetylace mění strukturní a funkční otisk v centromerech štěpných kvasinek". Buňka. 91 (7): 1021–32. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80492-4. PMID  9428524.
  25. ^ Bannister, Andrew J; Zegerman, Philip; Partridge, Janet F; Miska, Eric A; Thomas, Jean O; Allshire, Robin C; Kouzarides, Tony (2001). „Selektivní rozpoznávání methylovaného lysinu 9 na histonu H3 chromo doménou HP1“. Příroda. 410 (6824): 120–4. doi:10.1038/35065138. PMID  11242054.
  26. ^ Partridge, J. F; Scott, K. S; Bannister, A. J; Kouzarides, T; Allshire, R. C (2002). „Cis působící DNA z centromer štěpných kvasinek zprostředkovává methylaci histonu H3 a nábor tlumících faktorů a kohezinu na ektopické místo“. Aktuální biologie. 12 (19): 1652–60. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 01177-6. PMID  12361567.
  27. ^ Pidoux, Alison L; Richardson, William; Allshire, Robin C (2003). „Sim4“. The Journal of Cell Biology. 161 (2): 295–307. doi:10.1083 / jcb.200212110. PMC  2172903. PMID  12719471.
  28. ^ Castillo, A. G; Mellone, B.G; Partridge, J. F; Richardson, W; Hamilton, G. L; Allshire, R. C; Pidoux, A. L (2007). „Plasticita štěpných kvasinek CENP-A chromatin řízená relativními hladinami histonu H3 a H4“. Genetika PLOS. 3 (7): e121. doi:10.1371 / journal.pgen.0030121. PMC  1934396. PMID  17677001.
  29. ^ Dunleavy, Elaine M; Pidoux, Alison L; Monet, Marie; Bonilla, Carolina; Richardson, William; Hamilton, Georgina L; Ekwall, Karl; McLaughlin, Paul J; Allshire, Robin C (2007). „Protein související s NASP (N1 / N2), Sim3, váže CENP-A a je vyžadován pro jeho ukládání v centromerech štěpných kvasinek.“. Molekulární buňka. 28 (6): 1029–44. doi:10.1016 / j.molcel.2007.10.010. PMC  2193228. PMID  18158900.
  30. ^ Pidoux, Alison L; Choi, Eun Shik; Abbott, Johanna K.R; Liu, Xingkun; Kagansky, Alexander; Castillo, Araceli G; Hamilton, Georgina L; Richardson, William; Rappsilber, Juri; On, Xiangwei; Allshire, Robin C (2009). „Štěpné kvasinky Scm3: Pro integritu subkinetochorového chromatinu je vyžadován receptor CENP-A“. Molekulární buňka. 33 (3): 299–311. doi:10.1016 / j.molcel.2009.01.019. PMC  2697330. PMID  19217404.
  31. ^ Sanchez-Pulido, Luis; Pidoux, Alison L; Ponting, Chris P; Allshire, Robin C (2009). „Společný původ chaperonů CENP-A Scm3 a HJURP“. Buňka. 137 (7): 1173–4. doi:10.1016 / j.cell.2009.06.010. PMC  4397584. PMID  19563746.
  32. ^ Subramanian, L; Toda, N. R. T; Rappsilber, J; Allshire, R. C (2014). „Eic1 spojuje Mis18 s komplexem CCAN / Mis6 / Ctf19 na podporu montáže CENP-A“. Otevřená biologie. 4 (4): 140043. doi:10.1098 / rsob.140043. PMC  4043117. PMID  24789708.
  33. ^ Folco, H. D; Pidoux, A. L; Urano, T; Allshire, R. C (2008). „K zavedení CENP-A chromatinu v centromerech je nutný heterochromatin a RNAi“. Věda. 319 (5859): 94–7. doi:10.1126 / science.1150944. PMC  2586718. PMID  18174443.
  34. ^ Kagansky, A; Folco, H. D; Almeida, R; Pidoux, A. L; Boukaba, A; Simmer, F; Urano, T; Hamilton, G. L; Allshire, R. C (2009). „Syntetický heterochromatin obchází RNAi a centromerní repetice, aby vytvořil funkční centromery“. Věda. 324 (5935): 1716–9. doi:10.1126 / science.1172026. PMC  2949999. PMID  19556509.
  35. ^ Partridge, J. F; Borgstrøm, B; Allshire, R. C (2000). „Výrazné domény interakce proteinů a šíření proteinů v komplexním centromeru“. Geny a vývoj. 14 (7): 783–91. PMC  316498. PMID  10766735.
  36. ^ Trewick, Sarah C; Minc, Elsa; Antonelli, Richard; Urano, Takeshi; Allshire, Robin C (2007). „Protein domény JmjC Epe1 zabraňuje neregulovanému sestavení a rozložení heterochromatinu“. Časopis EMBO. 26 (22): 4670–82. doi:10.1038 / sj.emboj.7601892. PMC  2048757. PMID  17948055.
  37. ^ Buscaino, Alessia; Lejeune, Erwan; Audergon, Pauline; Hamilton, Georgina; Pidoux, Alison; Allshire, Robin C (2013). „Zřetelné role pro Sir2 a RNAi v centromerické heterochromatinové nukleaci, šíření a údržbě“. Časopis EMBO. 32 (9): 1250–64. doi:10.1038 / emboj.2013.72. PMC  3642681. PMID  23572080.
  38. ^ Audergon, P. N. C. B; Catania, S; Kagansky, A; Tong, P; Shukla, M; Pidoux, A. L; Allshire, R. C (2015). „Omezená epigenetická dědičnost methylace H3K9“. Věda. 348 (6230): 132–5. doi:10.1126 / science.1260638. PMC  4397586. PMID  25838386.
  39. ^ Simmer, Femke; Buscaino, Alessia; Kos-Braun, Isabelle C; Kagansky, Alexander; Boukaba, Abdelhalim; Urano, Takeshi; Kerr, Alastair R W; Allshire, Robin C (2010). „Hairpin RNA indukuje sekundární malou interferující syntézu RNA a umlčování trans v štěpných kvasinkách“. Zprávy EMBO. 11 (2): 112–8. doi:10.1038 / embor.2009.273. PMC  2828748. PMID  20062003.
  40. ^ Bayne, Elizabeth H; Bílá, Sharon A; Kagansky, Alexander; Bijos, Dominika A; Sanchez-Pulido, Luis; Motyka, Kwang-Lae; Kim, Dong-Uk; Park, Han-Oh; Ponting, Chris P; Rappsilber, Juri; Allshire, Robin C (2010). "Stc1: Kritická vazba mezi RNAi a chromatinem je vyžadována pro integritu heterochromatinu". Buňka. 140 (5): 666–77. doi:10.1016 / j.cell.2010.01.038. PMC  2875855. PMID  20211136.
  41. ^ Buscaino, Alessia; Bílá, Sharon A; Houston, Douglas R; Lejeune, Erwan; Simmer, Femke; De Lima Alves, Flavia; Diyora, Piyush T; Urano, Takeshi; Bayne, Elizabeth H; Rappsilber, Juri; Allshire, Robin C (2012). „Raf1 je DCAF pro protein podobný Rik1 DDB1 a má oddělitelné role při generování siRNA a úpravě chromatinu“. Genetika PLOS. 8 (2): e1002499. doi:10.1371 / journal.pgen.1002499. PMC  3271066. PMID  22319459.
  42. ^ Bayne, E. H; Portoso, M; Kagansky, A; Kos-Braun, I. C; Urano, T; Ekwall, K; Alves, F; Rappsilber, J; Allshire, R. C (2008). „Faktory sestřihu usnadňují umlčování zaměřené na RNAi u štěpných kvasinek“. Věda. 322 (5901): 602–6. doi:10.1126 / science.1164029. PMC  2585287. PMID  18948543.
  43. ^ Bayne, Elizabeth H; Bijos, Dominika A; Bílá, Sharon A; Alves, Flavia de Lima; Rappsilber, Juri; Allshire, Robin C (2014). „Systematický genetický screening identifikuje nové faktory ovlivňující integritu centromerické heterochromatiny ve štěpných kvasinkách“. Genome Biology. 15 (10): 481. doi:10.1186 / s13059-014-0481-4. PMC  4210515. PMID  25274039.
  44. ^ Choi, Eun Shik; Strålfors, Annelie; Castillo, Araceli G; Durand-Dubief, Mickaël; Ekwall, Karl; Allshire, Robin C (2011). "Identifikace nekódujících transkriptů z CENP-A chromatinu v centromerech štěpných kvasinek". Journal of Biological Chemistry. 286 (26): 23600–7. doi:10.1074 / jbc.M111.228510. PMC  3123123. PMID  21531710.
  45. ^ Choi, Eun Shik; Strålfors, Annelie; Catania, Sandra; Castillo, Araceli G; Svensson, J. Peter; Pidoux, Alison L; Ekwall, Karl; Allshire, Robin C (2012). „Faktory, které podporují integritu chromatinu H3 během transkripce, zabraňují promiskuitnímu ukládání CENP-ACnp1 do štěpných kvasinek“. Genetika PLOS. 8 (9): e1002985. doi:10.1371 / journal.pgen.1002985. PMC  3447972. PMID  23028377.
  46. ^ Catania, Sandra; Pidoux, Alison L; Allshire, Robin C (2015). „Funkce sekvence a zastavení transkripce v DNA Centromere podporují vznik chromatinu CENP-A“. Genetika PLOS. 11 (3): e1004986. doi:10.1371 / journal.pgen.1004986. PMC  4349457. PMID  25738810.
  47. ^ Shukla M, Manu; Allshire, Robin C (2018). „DNA Centromere destabilizuje nukleosomy H3, aby podporovala depozici CENP-A během buněčného cyklu“. Aktuální biologie. 28 (24): 3924–3936. doi:10.1016 / j.cub.2018.10.049. PMC  6303189. PMID  30503616.
  48. ^ Ard, Ryan; Tong, Pin; Allshire, Robin C (2014). „Dlouhá nekódující RNA zprostředkovaná transkripční interference genu pro permeázy propůjčuje ve štěpných kvasinkách toleranci vůči léčivu“. Příroda komunikace. 5: 5576. doi:10.1038 / ncomms6576. PMC  4255232. PMID  25428589.
  49. ^ Ard, Ryan; Allshire, Robin C (2016). „Změny vázané na transkripci ke ztlumení genu podporující chromatin transkripční interferencí“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (22): 10619–10630. doi:10.1093 / nar / gkw801. PMC  5159543. PMID  27613421.
  50. ^ Torres-Garcia, Sito (2020). "Ztlumení epigenetického genu heterochromatinem připravuje fungální rezistenci". Příroda. 585 (7825): 453–458. doi:10.1038 / s41586-020-2706-x. PMID  32908306.
  51. ^ "životopis". ICG. Citováno 4. prosince 2018.
  52. ^ Akademie lékařských věd https://acmedsci.ac.uk/fellows/fellows-directory/ordinary-fellows/fellow/Professor-Robin-Allshire-0028315. Chybějící nebo prázdný | název = (Pomoc)
  53. ^ „Medaile společnosti pro genetiku 2013“. Genetická společnost. Citováno 4. prosince 2018.

Tento článek zahrnuje text k dispozici pod CC BY 4.0 licence.