Vedoucí Ribosomal S15 - Ribosomal S15 leader - Wikipedia

Vedoucí Ribosomal S15
RF00114-rscape.svg
Identifikátory
SymbolS15
RfamRF00114
Další údaje
RNA typCis-reg; vůdce
DoményBakterie
TAKSO: 0005836
PDB strukturPDBe

S15 Vedoucí ribozomálních proteinů jsou součástí ribozomální biogeneze. Byly použity jako autoregulační mechanismus pro kontrolu koncentrace ribozomální proteiny S15. Struktura se nachází v 5 'nepřeložených oblastech mRNA kódování ribozomální proteiny S15 (rpsO). V různých organismech je známo několik odlišných strukturních typů vedoucích ribozomálních proteinů S15.

The E-coli vůdce ribozomálního S15 je RNA element které mohou tvořit dvě alternativy struktur nachází se v ribozomálním proteinu S15. Jedna ze dvou alternativních struktur je řada tří vlásenky, druhý zahrnuje a pseudoknot.[1] Tato struktura způsobuje translační regulaci S15 protein. U posledních druhů jsou zachovány pouze poslední dvě vlásenky.

Další příklad pro Bakterie bylo předpovězeno v Flavobakterie.[2] Sekundární struktura jeho domnělého ribozomálního vůdce se u většiny druhů skládá z vlásenky. Některým druhům však tato vlásenka chybí. Takový nedostatek zjevné sekundární struktury by byl neobvyklý pro ribozomální vůdce, což činí z tohoto kandidáta ribozomálního vůdce méně jistou předpověď.[2]

Dva příklady v Archaea (jeden v Halobakterie a jeden dovnitř Methanomikrobie ) byly předpovězeny.[2] V této struktuře jsou podobnosti mezi rRNA vazebné místo S15 ribozomální protein a S15 vůdce ribozomálního proteinu vazebné místo.[2] To naznačuje, že vůdci ribozomů v těchto organismech fungují napodobováním vazebného místa S15 v rRNA.

Předpokládaná sekundární struktura a zachování sekvence vedoucího ribozomálního proteinu S15 v Archaea. Tento obrázek byl převzat z předchozí publikace. [2]


Viz také

Reference

  1. ^ Bénard L, Philippe C, Ehresmann B, Ehresmann C, Portier C (1996). "Pseudoknot a translační kontrola v expresi ribozomálního proteinu S15". Biochimie. 78 (7): 568–576. doi:10.1016 / S0300-9084 (96) 80003-4. PMC  7131963. PMID  8955900.
  2. ^ A b C d E Eckert, I; Weinberg, Z (24. května 2020). „Objev 20 nových kandidátů na vůdce ribozomů v bakteriích a archaeách“. Mikrobiologie BMC. 20 (130): 130. doi:10.1186 / s12866-020-01823-6. PMC  7247131. PMID  32448158.

externí odkazy