RTN1 - RTN1

RTN1
Identifikátory
AliasyRTN1, NSP, retikulon 1
Externí IDOMIM: 600865 MGI: 1933947 HomoloGene: 49654 Genové karty: RTN1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 14 (lidský)
Chr.Chromozom 14 (lidský)[1]
Chromozom 14 (lidský)
Genomická poloha pro RTN1
Genomická poloha pro RTN1
Kapela14q23.1Start59,595,976 bp[1]
Konec59,870,776 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RTN1 210222 s na fs.png

PBB GE RTN1 203485 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

6252

104001

Ensembl

ENSG00000139970

ENSMUSG00000021087

UniProt

Q16799

Q8K0T0

RefSeq (mRNA)

NM_001243115
NM_021136
NM_206852
NM_206857
NM_001363702

NM_001007596
NM_001286448
NM_153457

RefSeq (protein)

NP_066959
NP_996734
NP_001350631

NP_001007597
NP_001273377
NP_703187

Místo (UCSC)Chr 14: 59,6 - 59,87 MbChr 12: 72,21 - 72,41 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Retikulon-1 také známý jako neuroendokrinně specifický protein (NSP) je a protein že u lidí je kódován RTN1 gen.[5][6]

Tento gen patří do rodiny retikulon -kódování genů. Retikulony jsou spojeny s endoplazmatické retikulum a podílejí se na sekreci neuroendokrinů nebo na transportu membrán v neuroendokrinních buňkách. Alternativně sestříhané Byly identifikovány varianty transkriptu kódující různé izoformy. Zdá se, že do této rozmanitosti je zapojeno více promotorů než alternativní sestřih interních exonů.[6]

Interakce

RTN1 bylo prokázáno komunikovat s BCL2 jako 1[7] a UGCG.[8]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139970 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021087 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Kools PF, Roebroek AJ, Van de Velde HJ, Marynen P, Bullerdiek J, Van de Ven WJ (únor 1994). "Regionální mapování lidského genu NSP do chromozomové oblasti 14q21 → q22 pomocí fluorescenční in situ hybridizační analýzy". Cytogenet Cell Genet. 66 (1): 48–50. doi:10.1159/000133662. PMID  8275708.
  6. ^ A b „Entrez Gene: RTN1 reticulon 1“.
  7. ^ Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (listopad 2000). „Nový protein, RTN-XS, interaguje s Bcl-XL i Bcl-2 na endoplazmatickém retikulu a snižuje jejich antiapoptotickou aktivitu.“. Onkogen. 19 (50): 5736–46. doi:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID  11126360.
  8. ^ Di Sano F, Fazi B, Citro G, Lovat PE, Cesareni G, Piacentini M (červenec 2003). „Glukosylceramid syntáza a její funkční interakce s RTN-1C regulují chemoterapeuticky indukovanou apoptózu v buňkách neuroepiteliomu“. Cancer Res. 63 (14): 3860–5. PMID  12873973.

Další čtení

  • Senden NH, van de Velde HJ, Broers JL, Timmer ED, Roebroek AJ, van de Ven WJ, Ramaekers FC (1994). „Protilátky proti rakovině plic Cluster-10 rozpoznávají NSP, nové neuroendokrinní proteiny spojené s membránami endoplazmatického retikula“. Int. J. Cancer Suppl. 8: 84–8. doi:10.1002 / ijc.2910570718. PMID  7515034.
  • Roebroek AJ, van de Velde HJ, Van Bokhoven A, Broers JL, Ramaekers FC, Van de Ven WJ (1993). "Klonování a exprese alternativních transkriptů nového neuroendokrinně specifického genu a identifikace jeho 135kDa translačního produktu". J. Biol. Chem. 268 (18): 13439–47. PMID  7685762.
  • van de Velde HJ, Roebroek AJ, Senden NH, Ramaekers FC, Van de Ven WJ (1995). „NSP-kódované retikulony, neuroendokrinní proteiny nové genové rodiny spojené s membránami endoplazmatického retikula“. J. Cell Sci. 107 (9): 2403–16. PMID  7844160.
  • van de Velde HJ, Senden NH, Roskams TA, Broers JL, Ramaekers FC, Roebroek AJ, Van de Ven WJ (1994). „NSP-kódované retikulony jsou neuroendokrinní markery nové kategorie v diagnostice rakoviny plic u lidí“. Cancer Res. 54 (17): 4769–76. PMID  8062278.
  • Roebroek AJ, Ayoubi TA, Van de Velde HJ, Schoenmakers EF, Pauli IG, Van de Ven WJ (1997). „Genomická organizace lidského genu NSP, prototyp nové genové rodiny kódující retikulony“. Genomika. 32 (2): 191–9. doi:10.1006 / geno.1996.0105. PMID  8833145.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID  8889548.
  • Senden NH, Timmer ED, Boers JE, van de Velde HJ, Roebroek AJ, Van de Ven WJ, Broers JL, Ramaekers FC (1996). „Neuroendokrinně specifický protein C (NSP-C): subcelulární lokalizace a diferenciální exprese ve vztahu k NSP-A“. Eur. J. Cell Biol. 69 (3): 197–213. PMID  8900485.
  • Hens J, Nuydens R, Geerts H, Senden NH, Van de Ven WJ, Roebroek AJ, van de Velde HJ, Ramaekers FC, Broers JL (1998). "Neuronální diferenciace je doprovázena expresí NSP-C". Cell Tissue Res. 292 (2): 229–37. doi:10.1007 / s004410051054. PMID  9560466.
  • Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (2001). „Nový protein, RTN-XS, interaguje s Bcl-XL i Bcl-2 na endoplazmatickém retikulu a snižuje jejich antiapoptotickou aktivitu.“. Onkogen. 19 (50): 5736–46. doi:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID  11126360.
  • Oertle T, Klinger M, Stuermer CA, Schwab ME (2003). „Retikulární rapsodie: fylogenetický vývoj a nomenklatura genové rodiny RTN / Nogo“. FASEB J.. 17 (10): 1238–47. CiteSeerX  10.1.1.124.969. doi:10.1096 / fj.02-1166hyp. PMID  12832288.
  • Di Sano F, Fazi B, Citro G, Lovat PE, Cesareni G, Piacentini M (2003). „Glukosylceramid syntáza a její funkční interakce s RTN-1C regulují chemoterapeuticky indukovanou apoptózu v buňkách neuroepiteliomu“. Cancer Res. 63 (14): 3860–5. PMID  12873973.
  • Iwahashi J, Hamada N (2004). „Lidský retikulon 1-A a 1-B interaguje se středním řetězcem komplexu adaptéru AP-2“. Buňka. Mol. Biol. (Noisy-le-grand). 49 Online Pub: OL467–71. PMID  14995077.
  • Hu Y, Fang X, Dunham SM, Prada C, Stachowiak EK, Stachowiak MK (2004). „90-kDa ribozomální kináza S6 je přímým cílem receptoru 1 pro růstový faktor jaderných fibroblastů (FGFR1): role v signalizaci FGFR1“. J. Biol. Chem. 279 (28): 29325–35. doi:10,1074 / jbc.M311144200. PMID  15117958.
  • He W, Lu Y, Qahwash I, Hu XY, Chang A, Yan R (2004). „Členové rodiny Reticulon modulují aktivitu BACE1 a generaci peptidů amyloid-beta“. Nat. Med. 10 (9): 959–65. doi:10,1038 / nm1088. PMID  15286784.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID  16189514.
  • Mannan AU, Boehm J, Sauter SM, Rauber A, Byrne PC, Neesen J, Engel W (2007). „Spastin, nejčastěji mutovaný protein v dědičné spastické paraplegii, interaguje s retikulonem 1 endoplazmatickým retikulárním proteinem“. Neurogenetika. 7 (2): 93–103. doi:10.1007 / s10048-006-0034-4. PMID  16602018.