RSF1 - RSF1 - Wikipedia

RSF1
Identifikátory
Aliasy	RSF1, HBXAP, RSF-1, XAP8, p325, faktor přestavby a rozteče 1
Externí ID	OMIM: 608522 MGI: 2682305 HomoloGene: 41142 Genové karty: RSF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	77,821,017 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	97,692,778 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• histonová vazba; • Aktivita ATPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita histon acetyltransferázy;
Buněčná složka	• RSF komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • komplex histon-acetyltransferáza; • nukleární chromatin;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace vazby DNA; • remodelace chromatinu; • pozitivní regulace virové transkripce; • umístění nukleosomu; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • Sestava nukleosomů obsahující CENP-A; • transkripce, chráněná DNA; • Transkripce s templátem DNA, zahájení; • shromáždění nukleosomů; • organizace chromatinu; • acetylace histonů; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51773
	233532
	ENSG00000048649
	ENSMUSG00000035623
	Q96T23; Q05DG0
	n / a
	NM_016578
	NM_001081267
	NP_057662; NP_057662.3
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor přestavby a rozestupu 1 je protein že u lidí je kódován RSF1 gen.^[5]^[6]^[7]

HBXAP je zapojen do transkripce represe, transkripční koaktivace, pokud jsou spojeny s virus hepatitidy B. X protein (HBX) a chromatin předělávání a rozestupy, pokud jsou spojeny s SNF2H (MIM 603375). [dodává OMIM]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000048649 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035623 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shamay M, Barak O, Doitsh G, Ben-Dor I, Shaul Y (březen 2002). „Virus hepatitidy B pX interaguje s HBXAP, proteinem prstu PHD, který koaktivuje transkripci“. J Biol Chem. 277 (12): 9982–8. doi:10,1074 / jbc.M111354200. PMID 11788598.
^ Loyola A, Huang JY, LeRoy G, Hu S, Wang YH, Donnelly RJ, Lane WS, Lee SC, Reinberg D (září 2003). "Funkční analýza podjednotek faktoru sestavy chromatinu RSF". Mol Cell Biol. 23 (19): 6759–68. doi:10.1128 / MCB.23.19.6759-6768.2003. PMC 193931. PMID 12972596.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RSF1 remodelace and spacing factor 1“.

Další čtení

Lee TH, Elledge SJ, Butel JS (1995). „Protein X viru hepatitidy B interaguje s pravděpodobným proteinem pro opravu buněčné DNA“. J. Virol. 69 (2): 1107–14. doi:10.1128 / JVI.69.2.1107-1114.1995. PMC 188683. PMID 7815490.
LeRoy G, Orphanides G, Lane WS, Reinberg D (1998). "Požadavek RSF a FACT na transkripci templátů chromatinu in vitro". Věda. 282 (5395): 1900–4. doi:10.1126 / science.282.5395.1900. PMID 9836642.
Shamay M, Barak O, Shaul Y (2002). „HBXAP, nový protein s prstem PHD, má transkripční represivní aktivitu“. Genomika. 79 (4): 523–9. doi:10.1006 / geno.2002.6717. PMID 11944984.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Obuse C, Yang H, Nozaki N a kol. (2004). „Proteomická analýza komplexu centromér z HeLa mezifázových buněk: UV-poškozený DNA vazebný protein 1 (DDB-1) je součástí komplexu CEN, zatímco BMI-1 je přechodně ko-lokalizován s centromerickou oblastí v mezifázi.“ Geny buňky. 9 (2): 105–20. doi:10.1111 / j.1365-2443.2004.00705.x. PMID 15009096. S2CID 21813024.
Huang JY, Shen BJ, Tsai WH, Lee SC (2004). "Funkční interakce mezi HBXAP as NF-kappaB spojenou s jadernou matricí". Exp. Cell Res. 298 (1): 133–43. doi:10.1016 / j.yexcr.2004.04.019. PMID 15242768.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Shih IeM, Sheu JJ, Santillan A a kol. (2005). „Amplifikace genu pro remodelaci chromatinu, Rsf-1 / HBXAP, u karcinomu vaječníků“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (39): 14004–9. doi:10.1073 / pnas.0504195102. PMC 1236547. PMID 16172393.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000048649 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035623 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11788598-5] Shamay M, Barak O, Doitsh G, Ben-Dor I, Shaul Y (březen 2002). „Virus hepatitidy B pX interaguje s HBXAP, proteinem prstu PHD, který koaktivuje transkripci“. J Biol Chem. 277 (12): 9982–8. doi:10,1074 / jbc.M111354200. PMID 11788598.

[pmid12972596-6] Loyola A, Huang JY, LeRoy G, Hu S, Wang YH, Donnelly RJ, Lane WS, Lee SC, Reinberg D (září 2003). "Funkční analýza podjednotek faktoru sestavy chromatinu RSF". Mol Cell Biol. 23 (19): 6759–68. doi:10.1128 / MCB.23.19.6759-6768.2003. PMC 193931. PMID 12972596.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RSF1 remodelace and spacing factor 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]