RRN3 - RRN3

RRN3

Identifikátory

RRN3, A-270G1.2, TIFIA, homolog RRN3, transkripční faktor RNA polymerázy I.

Externí ID

OMIM: 605121 MGI: 1925255 HomoloGene: 39531 Genové karty: RRN3

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 16 (lidský)^[1]

Kapela	16p13.11	Start	15,060,022 bp^[1]
Kapela	16p13.11	Konec	15,094,317 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 16 (myš)^[2]

Kapela	16 \| 16 A1	Start	13,780,708 bp^[2]
Kapela	16 \| 16 A1	Konec	13,814,839 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba RNA polymerázy • GO: 0001187 RNA polymeráza I vázající se na jádro promotoru specifické pro DNA • Vazba na jádro RNA polymerázy I. • aktivita transkripčního faktoru, vazba jádrové RNA polymerázy I.
Buněčná složka	• jádro • nukleoplazma • buněčné jádro
Biologický proces	• v embryonálním vývoji dělohy • organizace jádra • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů • regulace transkripce, DNA-šablony • buněčná proliferace • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy mediátorem třídy p53 • Transkripce s templátem DNA, iniciace • regulace transkripce templátované DNA, iniciace • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA • organizace cytoplazmy • transkripce, chráněná DNA • homeostáza počtu buněk • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy I. • ribozomální biogeneze • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy I. • Sestava transkripčního preiniciačního komplexu RNA polymeráza I
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


54700


106298


ENSG00000085721 ENSG00000278494


ENSMUSG00000022682


Q9NYV6


B2RS91

RefSeq (mRNA)


NM_001301064 NM_018427


NM_001039521

RefSeq (protein)


NP_001287993 NP_060897


NP_001034610

Místo (UCSC)

Chr 16: 15,06 - 15,09 Mb

Chr 16: 13,78 - 13,81 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Faktor iniciace transkripce specifický pro RNA polymerázu RRN3 je enzym že u lidí je kódován RRN3 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

RRN3 bylo prokázáno komunikovat s TAF1B.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000278494 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000085721, ENSG00000278494 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022682 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Moorefield B, Greene EA, Reeder RH (květen 2000). „Transkripční faktor RNA polymerázy I Rrn3 je funkčně konzervovaný mezi kvasinkami a člověkem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (9): 4724–9. doi:10.1073 / pnas.080063997. PMC 18300. PMID 10758157.
^ ^A ^b Miller G, Panov KI, Friedrich JK, Trinkle-Mulcahy L, Lamond AI, Zomerdijk JC (březen 2001). „hRRN3 je nezbytný pro nábor RNA polymerázy I zprostředkovaný SL1 na promotory genu rRNA“. EMBO J.. 20 (6): 1373–82. doi:10.1093 / emboj / 20.6.1373. PMC 145519. PMID 11250903.
^ "Entrezův gen: homolog transkripčního faktoru RRN3 RRN3 RNA polymerázy I (S. cerevisiae)".

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Bodem J, Dobreva G, Hoffmann-Rohrer U, Iben S, Zentgraf H, Delius H, Vingron M, Grummt I (2000). „TIF-IA, faktor zprostředkující růstově závislou kontrolu syntézy ribozomální RNA, je savčí homolog kvasinky Rrn3p“. EMBO Rep. 1 (2): 171–5. doi:10.1093 / embo-reports / kvd032. PMC 1084264. PMID 11265758.
Yuan X, Zhao J, Zentgraf H, Hoffmann-Rohrer U, Grummt I (2002). „Vícenásobné interakce mezi podjednotkami RNA polymerázy I, TIF-IA a TAF (I) regulují sestavování preiniciačního komplexu na promotoru ribozomálního genu“. EMBO Rep. 3 (11): 1082–7. doi:10.1093 / embo-reports / kvf212. PMC 1307603. PMID 12393749.
Zhao J, Yuan X, Frödin M, Grummt I (2003). „Fosforylace závislá na ERK transkripčního iniciačního faktoru TIF-IA je vyžadována pro transkripci RNA polymerázy I a růst buněk“. Mol. Buňka. 11 (2): 405–13. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00036-4. PMID 12620228.
Mayer C, Zhao J, Yuan X, Grummt I (2004). „Aktivace transkripčního faktoru TIF-IA závislá na mTOR spojuje syntézu rRNA s dostupností živin“. Genes Dev. 18 (4): 423–34. doi:10,1101 / gad.285504. PMC 359396. PMID 15004009.
Philimonenko VV, Zhao J, Iben S, Dingová H, Kyselá K, Kahle M, Zentgraf H, Hofmann WA, de Lanerolle P, Hozák P, Grummt I (2004). „Jaderný aktin a myosin I jsou vyžadovány pro transkripci RNA polymerázy I“. Nat. Cell Biol. 6 (12): 1165–72. doi:10.1038 / ncb1190. PMID 15558034. S2CID 6633625.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.