RNF40 - RNF40

RNF40
Identifikátory
Aliasy	RNF40, BRE1B, RBP95, STARING, protein z prstového prstu 40
Externí ID	OMIM: 607700 MGI: 2142048 HomoloGene: 8856 Genové karty: RNF40
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	30,776,307 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	127,604,799 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • vazba enzymu konjugujícího ubikvitin; • vazba syntaxin-1; • aktivita homodimerizace proteinu; • mRNA 3'-UTR vazba; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• axonový konec; • cytosol; • membrána; • Komplex HULC; • vnější složka membrány; • komplex ubikvitin ligázy; • buněčné jádro; • neuronová projekce; • nukleoplazma; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• negativní regulace polyadenylace mRNA; • ubikvitinace histonu H2B; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinu proteinu; • reakce na peptidový hormon; • regulace mitotického buněčného cyklu; • pozitivní regulace polyubikvitinace bílkovin; • histon monoubiquitination; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • kovalentní modifikace chromatinu; • pozitivní regulace ubikvitinace histonu H2B; • ubikvitinace bílkovin; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9810
	233900
	ENSG00000103549
	ENSMUSG00000030816
	O75150
	Q3U319
	NM_001207033; NM_001207034; NM_001286572; NM_014771
	NM_172281; NM_001360883
	NP_001193962; NP_001193963; NP_001273501; NP_055586
	NP_758485; NP_001347812
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza BRE1B je enzym že u lidí je kódován RNF40 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem obsahuje prsten RING, o kterém je známo, že se účastní interakcí protein-protein a protein-DNA. Uvádí se, že tento protein interaguje s tumor supresorovým proteinem RB1. Studie krysího protějšku naznačují, že tento protein může fungovat jako ligáza E3 ubikvitin-protein a usnadňovat ubikvitinaci a degradaci syntaxinu 1, který je podstatnou součástí mechanismu uvolňování neurotransmiterů.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že RNF40 komunikovat s STX1A.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103549 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030816 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.
^ Wen H, Ao S (září 2000). „RBP95, nový protein leucinového zipu, se váže na protein retinoblastomu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275 (1): 141–8. doi:10,1006 / bbrc.2000.3242. PMID 10944455.
^ ^A ^b Chin LS, Vavalle JP, Li L (září 2002). „Staring, nová E3 ubikvitin-protein ligáza, která se zaměřuje na degradaci syntaxinu 1“. J. Biol. Chem. 277 (38): 35071–9. doi:10,1074 / jbc.M203300200. PMID 12121982.
^ ^A ^b "Entrez Gene: RNF40 protein z prstového prstu 40".

Další čtení

Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2005). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Zhu B, Zheng Y, Pham AD, Mandal SS, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2005). „Monoubikvitinace lidského histonu H2B: zúčastněné faktory a jejich role v regulaci genu HOX“. Mol. Buňka. 20 (4): 601–11. doi:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID 16307923.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103549 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030816 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9734811-5] Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.

[pmid10944455-6] Wen H, Ao S (září 2000). „RBP95, nový protein leucinového zipu, se váže na protein retinoblastomu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275 (1): 141–8. doi:10,1006 / bbrc.2000.3242. PMID 10944455.

[pmid12121982-7] A ^b Chin LS, Vavalle JP, Li L (září 2002). „Staring, nová E3 ubikvitin-protein ligáza, která se zaměřuje na degradaci syntaxinu 1“. J. Biol. Chem. 277 (38): 35071–9. doi:10,1074 / jbc.M203300200. PMID 12121982.

[entrez-8] A ^b "Entrez Gene: RNF40 protein z prstového prstu 40".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]