RDH13 - RDH13 - Wikipedia
Retinol dehydrogenáza 13 (all-trans / 9-cis) je protein že u lidí je kódován RDH13 gen. Tento gen kóduje mitochondriální dehydrogenázu / reduktázu s krátkým řetězcem, která katalyzuje redukci a oxidaci retinoidů. Kódovaný enzym může fungovat při produkci kyseliny retinové a může také chránit mitochondrie před oxidačním stresem. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu.[5]
Gen
Lidský gen RDH13 je na 19. chromozomu, jeho specifická lokalizace je 19q13.42. Gen obsahuje celkem 12 exonů.[5]
Struktura
Analýza submochondriální lokalizace RDH13 naznačuje jeho asociaci s vnitřní mitochondriální membránou. Primární struktura RDH13 obsahuje dva hydrofobní segmenty, 2–21 a 242–261, které jsou dostatečně dlouhé, aby sloužily jako transmembránové segmenty; jak však ukazuje tato studie, alkalická extrakce zcela odstraní protein z membrány, což naznačuje, že RDH13 je protein periferní membrány.[6] Periferní asociace RDH13 s membránou dále odlišuje tento protein od mikrozomálních retinaldehyd reduktáz, což jsou integrální membránové proteiny, které se zdají být ukotveny v membráně prostřednictvím svých N-koncových hydrofobních segmentů.[7]
Funkce
RDH13 nejvíce souvisí s NADP + -závislými mikrozomálními enzymy RDH11, RDH12 a RDH14.[8][9] Čištěný RDH13 působí na retinoidy oxidačně reduktivně a silně preferuje kofaktor NADPH před NADH. Kromě toho má RDH13 mnohem účinnější aktivitu reduktázy než aktivitu dehydrogenázy. RDH13 jako retinaldehyd reduktáza je významně méně aktivní než příbuzný protein RDH11, a to především kvůli mnohem vyšší hodnotě Km pro retinaldehyd. Hodnota kcat RDH13 pro redukci retinaldehydu. s RDH11 a hodnoty Km dvou enzymů pro NADPH jsou také velmi podobné. V souladu se sekvenční podobností s RDH11, RDH12 a RDH14 tedy RDH13 působí jako retinaldehydreduktáza závislá na NADP +.[10]
RDH13 je lokalizován v mitochondriích, které se liší od ostatních členů této rodiny, protože se lokalizují do endoplazmatického retikula. Zbývá určit přesnou sekvenci cílení RDH13 na mitochondrie.
Klinický význam
RDH13 je součástí podčeledi čtyř retinol dehydrogenáz, RDH11, RDH12, RDH13 a RDH14, které vykazují duální substrátovou specificitu, jedinečně metabolizující všechny trans- a cis-retinoly se C (15) pro-R specificitou. Metabolity účastnící se těchto reakcí jsou známé jako retinoidy, což jsou chromofory podílející se na vidění, transkripční regulaci a buněčné diferenciaci. RDH11-14 by se mohl podílet na prvním kroku produkce all-trans- a 9-cis-retinové kyseliny v mnoha tkáních. RDH11-14 vyplňuje mezeru v našem chápání 11-cis-retinálních a all-trans-retinálních transformací ve fotoreceptorových a retinálních pigmentových epiteliálních buňkách. Duální substrátová specificita této podčeledi vysvětluje menší fenotyp spojený s mutacemi v 11-cis-retinol dehydrogenáze (RDH5) způsobující fundus albipunctatus u lidí.[9]
Reference
- ^ A b C ENSG00000274418, ENSG00000276341, ENSG00000275474, ENSG00000274504, ENSG00000273944, ENSG00000276684, ENSG00000278149, ENSG00000276826, ENSG00000160439 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000278284, ENSG00000274418, ENSG00000276341, ENSG00000275474, ENSG00000274504, ENSG00000273944, ENSG00000276684, ENSG00000278149, ENSG00000276826, ENSG00000160439 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000008435 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b „Entrez Gene: Retinol dehydrogenase 13 (all-trans / 9-cis)“.
- ^ Fujiki Y, Hubbard AL, Fowler S, Lazarow PB (duben 1982). "Izolace intracelulárních membrán pomocí ošetření uhličitanem sodným: aplikace na endoplazmatické retikulum". The Journal of Cell Biology. 93 (1): 97–102. doi:10.1083 / jcb.93.1.97. PMC 2112113. PMID 7068762.
- ^ Belyaeva OV, Korkina OV, Stetsenko AV, Kedishvili NY (leden 2008). „Lidská retinoldehydrogenáza 13 (RDH13) je mitochondriální dehydrogenáza / reduktáza s krátkým řetězcem s aktivitou retinaldehyd-reduktázy“. FEBS Journal. 275 (1): 138–47. doi:10.1111 / j.1742-4658.2007.06184.x. PMC 2573044. PMID 18039331.
- ^ Kedishvili NY, Chumakova OV, Chetyrkin SV, Belyaeva OV, Lapshina EA, Lin DW, Matsumura M, Nelson PS (srpen 2002). „Důkaz, že lidský gen pro prostatickou dehydrogenázu / reduktázu s krátkým řetězcem (PSDR1) kóduje novou retinální reduktázu (RalR1)“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (32): 28909–15. doi:10,1074 / jbc.M202588200. PMID 12036956.
- ^ A b Haeseleer F, Jang GF, Imanishi Y, Driessen CA, Matsumura M, Nelson PS, Palczewski K (listopad 2002). „Dual-substrátová specificita retinol dehydrogenáz s krátkým řetězcem z sítnice obratlovců“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (47): 45537–46. doi:10,1074 / jbc.M208882200. PMC 1435693. PMID 12226107.
- ^ Belyaeva OV, Stetsenko AV, Nelson P, Kedishvili NY (prosinec 2003). "Vlastnosti dehydrogenázy / reduktázy s krátkým řetězcem RalR1: charakterizace čištěného enzymu, jeho orientace v mikrozomální membráně a distribuce v lidských tkáních a buněčných liniích". Biochemie. 42 (50): 14838–45. doi:10.1021 / bi035288u. PMID 14674758.
Další čtení
- Persson B, Kallberg Y, Bray JE, Bruford E, Dellaporta SL, Favia AD, Duarte RG, Jörnvall H, Kavanagh KL, Kedishvili N, Kisiela M, Maser E, Mindnich R, Orchard S, Penning TM, Thornton JM, Adamski J , Oppermann U (březen 2009). „Iniciativa názvosloví SDR (dehydrogenáza / reduktáza s krátkým řetězcem a příbuzné enzymy)“. Chemicko-biologické interakce. 178 (1–3): 94–8. doi:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. PMC 2896744. PMID 19027726.
- Belyaeva OV, Korkina OV, Stetsenko AV, Kedishvili NY (leden 2008). „Lidská retinoldehydrogenáza 13 (RDH13) je mitochondriální dehydrogenáza / reduktáza s krátkým řetězcem s aktivitou retinaldehyd-reduktázy“. FEBS Journal. 275 (1): 138–47. doi:10.1111 / j.1742-4658.2007.06184.x. PMC 2573044. PMID 18039331.
- Alkhaja AK, Jans DC, Nikolov M, Vukotic M, Lytovchenko O, Ludewig F, Schliebs W, Riedel D, Urlaub H, Jakobs S, Deckers M (leden 2012). „MINOS1 je konzervovaná součást mitofilinových komplexů a je vyžadována pro mitochondriální funkci a organizaci cristae“. Molekulární biologie buňky. 23 (2): 247–57. doi:10,1091 / mbc.E11-09-0774. PMC 3258170. PMID 22114354.
- Haeseleer F, Jang GF, Imanishi Y, Driessen CA, Matsumura M, Nelson PS, Palczewski K (listopad 2002). „Dual-substrátová specificita retinol dehydrogenáz s krátkým řetězcem z sítnice obratlovců“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (47): 45537–46. doi:10,1074 / jbc.M208882200. PMC 1435693. PMID 12226107.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |