RBBP5 - RBBP5

RBBP5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3P4F, 4X8N, 4X8P, 5F6K, 5F6L
Identifikátory
Aliasy	RBBP5, RBQ3, SWD1, retinoblastomový vazebný protein 5, RB vazebný protein 5, histon lysin methyltransferázová komplexní podjednotka
Externí ID	OMIM: 600697 MGI: 1918367 HomoloGene: 3709 Genové karty: RBBP5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	205,122,015 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	132,505,659 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba methylovaného histonu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita histonmethyltransferázy (specifická pro H3-K4); • aktivita histon-lysin N-methyltransferázy;
Buněčná složka	• MLL1 komplex; • jádro; • MLL3 / 4 komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • komplex histon-methyltransferáza; • Komplex Set1C / COMPASS;
Biologický proces	• reakce na estrogen; • methylace histonu H3-K4; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • komplexní sestava beta-katenin-TCF; • posttranslační modifikace; • regulace diferenciace megakaryocytů; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5929
	213464
	ENSG00000117222
	ENSMUSG00000026439
	Q15291
	Q8BX09
	NM_001193272; NM_001193273; NM_005057
	NM_172517; NM_001357486; NM_001357487
	NP_001180201; NP_001180202; NP_005048
	NP_766105; NP_001344415; NP_001344416
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající retinoblastom 5 je protein že u lidí je kódován RBBP5 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je všudypřítomně exprimovaný jaderný protein a patří do vysoce konzervované podrodiny proteinů WD-repeat. Nachází se mezi několika proteiny, které se vážou přímo na protein retinoblastomu, který reguluje buněčnou proliferaci. Kódovaný protein interaguje přednostně s podfosforylovaným retinoblastomovým proteinem prostřednictvím kapsy B vázající E1A.^[6]

Interakce

RBBP5 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117222 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026439 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Saijo M, Sakai Y, Kishino T, Niikawa N, Matsuura Y, Morino K, Tamai K, Taya Y (červen 1995). "Molekulární klonování lidského proteinu, který se váže na protein retinoblastomu a chromozomální mapování". Genomika. 27 (3): 511–9. doi:10.1006 / geno.1995.1084. PMID 7558034.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RBBP5 retinoblastoma binding protein 5“.
^ ^A ^b ^C Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (leden 2003). „Aktivační signální kointegrátor 2 patří do nového komplexu ustáleného stavu, který obsahuje podmnožinu proteinů skupiny trithorax“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (1): 140–9. doi:10.1128 / mcb.23.1.140-149.2003. PMC 140670. PMID 12482968.
^ Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (červenec 2004). „Leukemický protoonkoprotein MLL tvoří komplex histonmethyltransferázy podobný SET1 s meninem k regulaci exprese genu Hox“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5639–49. doi:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.

Další čtení

Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (září 1996). "Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek". Výzkum genomu. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugano J, Hata H, Ota T, Isogai T, Tanaka T, Nakamura Y, Suyama A, Sakaki Y, Morishita S, Okubo K, Sugano S (květen 2001) . „Identifikace a charakterizace potenciálních promotorových oblastí 1031 druhů lidských genů“. Výzkum genomu. 11 (5): 677–84. doi:10,1101 / gr. Gr-1640r. PMC 311086. PMID 11337467.
Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (leden 2003). „Aktivační signální kointegrátor 2 patří do nového komplexu ustáleného stavu, který obsahuje podmnožinu proteinů skupiny trithorax“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (1): 140–9. doi:10.1128 / MCB.23.1.140-149.2003. PMC 140670. PMID 12482968.
Hughes CM, Rozenblatt-Rosen O, Milne TA, Copeland TD, Levine SS, Lee JC, Hayes DN, Shanmugam KS, Bhattacharjee A, Biondi CA, Kay GF, Hayward NK, Hess JL, Meyerson M (únor 2004). "Menin se asociuje s trithoraxovým komplexem histonmethyltransferázy as lokusem hoxc8". Molekulární buňka. 13 (4): 587–97. doi:10.1016 / S1097-2765 (04) 00081-4. PMID 14992727.
Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (červenec 2004). „Leukemický protoonkoprotein MLL tvoří komplex histonmethyltransferázy podobný SET1 s meninem k regulaci exprese genu Hox“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5639–49. doi:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.
Dou Y, Milne TA, Tackett AJ, Smith ER, Fukuda A, Wysocka J, Allis CD, Chait BT, Hess JL, Roeder RG (červen 2005). "Fyzická asociace a souřadnicová funkce H3 K4 methyltransferázy MLL1 a H4 K16 acetyltransferázy MOF". Buňka. 121 (6): 873–85. doi:10.1016 / j.cell.2005.04.031. PMID 15960975.
Scacheri PC, Davis S, Odom DT, Crawford GE, Perkins S, Halawi MJ, Agarwal SK, Marx SJ, Spiegel AM, Meltzer PS, Collins FS (duben 2006). „Analýza vazby meninu v celém genomu poskytuje poznatky o tumorigenezi MEN1“. Genetika PLoS. 2 (4): e51. doi:10.1371 / journal.pgen.0020051. PMC 1428788. PMID 16604156.
Higa LA, Wu M, Ye T, Kobayashi R, Sun H, Zhang H (listopad 2006). „Ubikvitinová ligáza CUL4-DDB1 interaguje s více proteiny opakujícími se WD40 a reguluje methylaci histonu“. Přírodní buněčná biologie. 8 (11): 1277–83. doi:10.1038 / ncb1490. PMID 17041588.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117222 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026439 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7558034-5] Saijo M, Sakai Y, Kishino T, Niikawa N, Matsuura Y, Morino K, Tamai K, Taya Y (červen 1995). "Molekulární klonování lidského proteinu, který se váže na protein retinoblastomu a chromozomální mapování". Genomika. 27 (3): 511–9. doi:10.1006 / geno.1995.1084. PMID 7558034.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RBBP5 retinoblastoma binding protein 5“.

[pmid12482968-7] A ^b ^C Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (leden 2003). „Aktivační signální kointegrátor 2 patří do nového komplexu ustáleného stavu, který obsahuje podmnožinu proteinů skupiny trithorax“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (1): 140–9. doi:10.1128 / mcb.23.1.140-149.2003. PMC 140670. PMID 12482968.

[pmid15199122-8] Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (červenec 2004). „Leukemický protoonkoprotein MLL tvoří komplex histonmethyltransferázy podobný SET1 s meninem k regulaci exprese genu Hox“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5639–49. doi:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]