RAB11FIP5 - RAB11FIP5
Rodina proteinu Rab11 interagující 5 je protein že u lidí je kódován RAB11FIP5 gen.[5][6][7]
Interakce
RAB11FIP5 bylo prokázáno komunikovat s RAB11A[6][8][9] a RAB25.[8][9]
Obchodování s vezikuly
Rab11FIP5 je jedním z mnoha proteinů, u nichž bylo prokázáno, že interagují s proteinem Rab11.[8] Rab GTPázy, jako je Rab11, jsou enzymy, které se účastní vezikulárního obchodování. Rab11 konkrétně hraje klíčovou roli v obchodování s endocytem a recyklaci prostřednictvím vedení časných endosomů k komplexům recyklace endosomů.[10] Rab11FIP5, stejně jako většina ostatních proteinů Rab11FIP, interaguje s Rab11 tím, že slouží jako adaptační protein. To vede k následným změnám, pokud jde o interakce proteinů. To je výsledkem různých proteinů Rab11FIP, z nichž každý má odlišné vazebné partnery. Tento proces umožňuje koordinaci a organizaci endosomálního transportu a nakonec dává Rab11 jeho univerzální funkci v buňce.[10] Předpokládá se, že Rab11 rekrutuje specifické proteiny Rab11FIP na povrch vezikul, aby určil, jak se vezikul bude chovat.[11]
Studie ukázaly, že Rab11FIP5 se lokalizuje do perinukleárních endosomů, kde pomáhá při třídění vezikul do pomalé recyklační cesty.[11] Tento proces zahrnuje transport proteinů nákladu, jako jsou endocytované receptory, do komplexů recyklace endosomů a následně do plazmatické membrány. To je v rozporu s cestou rychlé konstitutivní recyklace, která umožňuje přímý transport nákladu z endosomu na plazmatickou membránu.[11] Rab11FIP5 pomáhá v tomto procesu třídění vazbou na kinesin II a tvorbou proteinového komplexu pro regulaci vezikulárního obchodování. Některé z proteinů, které jsou regulovány přenosem vezikul zprostředkovaným Rab11FIP5, jsou mikrotubulární proteiny a receptor TfR. To spojuje funkčnost Rab11FIP5 s buněčným cytoskeletem a absorpcí železa buňkou.[11]
Další funkce
Ukázalo se, že Rab11FIP5 hraje roli v nervovém systému, protože funguje v neuronech. Studie naznačují, že Rab11FIP5 se podílí na regulaci lokalizace postsynaptického glutamátového receptoru typu AMPA. AMPA receptor je excitační receptor, který se nachází na plazmatických membránách neuronů. Studie prokázaly, že myši s vyřazeným genem Rab11FIP5 mají těžkou dlouhodobou neuronální depresi. Bez přítomnosti Rab11FIP5 se předpokládá, že internalizované receptory AMPA nelze recyklovat zpět na plazmatickou membránu, protože receptory nemohou být správně přeneseny do intracelulárních organel odpovědných za recyklaci.[12]
Rab11FIP5 byl také implikován jako protein podílející se na tvorbě polarity tkáně během vývoje. Ukázalo se, že Rab11FIP5 se účastní přenosu vezikul a degradace proteinů používaných ke koordinaci embryonálního vývoje. To se provádí způsobem, který pomáhá udržovat ektoderm polarita v embryonální Drosophila.[13]
Rab11FIP5 se také navrhuje zapojit se do napomáhání slinným epiteliálním buňkám přizpůsobit se extracelulárnímu pH. Ukázalo se, že V-ATPáza, protein protonové pumpy, závisí na přenosu vezikul zprostředkovaného Rab11FIP5. Když je Rab11FIP5 sražen, slinné buňky nemohou správně translokovat V-ATPázu na plazmatickou membránu v reakci na extracelulární acidózu. I když tato cesta zůstává do značné míry neznámá, tyto výsledky naznačují souvislost mezi funkcí Rab11FIP5 a udržováním pufrační kapacity slin.[14]
Rab11FIP5 je také vyžadován pro regulovanou exocytózu v neuroendokrinních buňkách. Vyřazení Rab11FIP5 inhibovalo vápníkem stimulovanou exocytózu vezikul hustého jádra (DCV) v BON buňkách neuroendokrinní buněčné linie. DCV membránové proteiny se během exocytózy ztrácejí na plazmatické membráně a recyklují se do Golgiho retrográdní přenosovou cestou. Požadavek Rab11FIP5 na regulovanou DCV exocytózu lze přičíst jeho roli v retrográdním obchodování zprostředkovaném endozomy.[15]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135631 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051343 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (6): 355–64. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.
- ^ A b Prekeris R, Klumperman J, Scheller RH (prosinec 2000). „Proteinový komplex Rab11 / Rip11 reguluje apikální transport membrány prostřednictvím recyklace endosomů“. Molekulární buňka. 6 (6): 1437–48. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00140-4. PMID 11163216.
- ^ "Entrez Gene: RAB11FIP5 RAB11 rodina interagující protein 5 (třída I)".
- ^ A b C Hales CM, Griner R, Hobdy-Henderson KC, Dorn MC, Hardy D, Kumar R, Navarre J, Chan EK, Lapierre LA, Goldenring JR (říjen 2001). "Identifikace a charakterizace rodiny proteinů interagujících s Rab11". The Journal of Biological Chemistry. 276 (42): 39067–75. doi:10,1074 / jbc.M104831200. PMID 11495908.
- ^ A b Prekeris R, Davies JM, Scheller RH (říjen 2001). "Identifikace nové vazebné domény Rab11 / 25 přítomné v proteinech Eferin a Rip". The Journal of Biological Chemistry. 276 (42): 38966–70. doi:10,1074 / jbc.M106133200. PMID 11481332.
- ^ A b Grant BD, Donaldson JG (2009). "Cesty a mechanismy endocytické recyklace". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 10 (9): 597–608. doi:10.1038 / nrm2755. PMC 3038567. PMID 19696797.
- ^ A b C d Schonteich E, Wilson GM, Burden J, Hopkins CR, Anderson K, Goldenring JR, Prekeris R (listopad 2008). „Komplex Rip11 / Rab11-FIP5 a kinesin II reguluje recyklaci endocytového proteinu“. Journal of Cell Science. 121 (Pt 22): 3824–33. doi:10.1242 / jcs.032441. PMC 4365997. PMID 18957512.
- ^ Bacaj T, Ahmad M, Jurado S, Malenka RC, Südhof TC (květen 2015). "Synaptická funkce Rab11Fip5: Selektivní požadavek na dlouhodobou depresi hipokampu". The Journal of Neuroscience. 35 (19): 7460–74. doi:10.1523 / JNEUROSCI.1581-14.2015. PMC 4429152. PMID 25972173.
- ^ Calero-Cuenca FJ, Sotillos S (září 2016). „Požadavek Nuf a Rip11 na recyklaci determinantu polarity během vývoje Drosophila“. Malé GTPasy. 9 (4): 352–359. doi:10.1080/21541248.2016.1235386. PMC 5997155. PMID 27687567.
- ^ Oehlke O, Martin HW, Osterberg N, Roussa E (březen 2011). „Rab11b a jeho efektor Rip11 regulují přenos V-ATPázy ve slinných kanálech vyvolaný acidózou.“ Journal of Cellular Physiology. 226 (3): 638–51. doi:10,1002 / jcp.22388. PMID 20717956. S2CID 10428914.
- ^ Zhang X, Jiang S, Mitok KA, Li L, Attie AD, Martin TFJ (červenec 2017). „BAIAP3, protein Munc13 obsahující doménu C2, řídí osud vezikul s hustým jádrem v neuroendokrinních buňkách“. The Journal of Cell Biology. 216 (7): 2151–2166. doi:10.1083 / jcb.201702099. PMC 5496627. PMID 28626000.
Další čtení
- Wang D, Buyon JP, Zhu W, Chan EK (listopad 1999). "Definování nového 75-kDa fosfoproteinu spojeného s SS-A / Ro a identifikace odlišných lidských autoprotilátek". The Journal of Clinical Investigation. 104 (9): 1265–75. doi:10.1172 / JCI8003. PMC 409828. PMID 10545525.
- Chen D, Xu W, He P, Medrano EE, Whiteheart SW (duben 2001). „Gaf-1, gama -SNAP-vazebný protein spojený s mitochondriemi“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (16): 13127–35. doi:10,1074 / jbc.M009424200. PMID 11278501.
- Prekeris R, Davies JM, Scheller RH (říjen 2001). "Identifikace nové vazebné domény Rab11 / 25 přítomné v proteinech Eferin a Rip". The Journal of Biological Chemistry. 276 (42): 38966–70. doi:10,1074 / jbc.M106133200. PMID 11481332.
- Hales CM, Griner R, Hobdy-Henderson KC, Dorn MC, Hardy D, Kumar R, Navarre J, Chan EK, Lapierre LA, Goldenring JR (říjen 2001). "Identifikace a charakterizace rodiny proteinů interagujících s Rab11". The Journal of Biological Chemistry. 276 (42): 39067–75. doi:10,1074 / jbc.M104831200. PMID 11495908.
- Wallace DM, Lindsay AJ, Hendrick AG, McCaffrey MW (prosinec 2002). „Rab11-FIP4 interaguje s Rab11 způsobem závislým na GTP a jeho nadměrná exprese kondenzuje Rab11 pozitivní kompartment v HeLa buňkách“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 299 (5): 770–9. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02720-1. PMID 12470645.
- Tani K, Shibata M, Kawase K, Kawashima H, Hatsuzawa K, Nagahama M, Tagaya M (duben 2003). "Mapování funkčních domén gamma-SNAP". The Journal of Biological Chemistry. 278 (15): 13531–8. doi:10,1074 / jbc.M213205200. PMID 12554740.
- Kawase K, Shibata M, Kawashima H, Hatsuzawa K, Nagahama M, Tagaya M, Tani K (duben 2003). „Gaf-1b je alternativní sestřihová varianta Gaf-1 / Rip11“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 303 (4): 1042–6. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00486-8. PMID 12684040.
- Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (květen 2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Analytická chemie. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
- Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (srpen 2004) . "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Aktuální biologie. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Schwenk RW, Luiken JJ, Eckel J (listopad 2007). „FIP2 a Rip11 specifikují buněčnou distribuci GLUT4 a FAT / CD36 v buňkách H9c2-hIR zprostředkovanou Rab11a“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 363 (1): 119–25. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.08.111. PMID 17854769.