QFAB Bioinformatika - QFAB Bioinformatics - Wikipedia

Queensland Facility for Advanced Bioinformatics
ZkratkaQFAB Bioinformatika
Formace2007 (2007)
Typakademický ne pro zisk
Hlavní sídloÚstav pro molekulární biologii
University of Queensland
Brisbane
Kraj
Austrálie
Ředitel
Dr. Dominique Gorse
webová stránkaqfab.org

QFAB Bioinformatika je Queensland organizace založená na poskytování zdrojů v bioinformatika, biostatistika a specializované výpočetní platformy. QFAB funguje Austrálie v celém rozsahu a je klíčovým přispěvatelem do EMBL Australia Bioinformatics Resource.[1]

Dějiny

QFAB byla založena v roce 2007[2], s financováním z programu Queensland Government National and International Research Alliance Program,[3] jako společný podnik mezi University of Queensland, Queensland University of Technology, Griffith University, CSIRO Australské centrum pro výzkum elektronického zdravotnictví a Queenslandská vláda Ministerstvo zemědělství, rybolovu a lesnictví.

Profesor Mark Ragan z Ústav molekulární biologie (IMB) a Dr. Anthony Maeder z Australské centrum pro výzkum elektronického zdravotnictví vedl založení QFAB a jmenoval Jeremyho Barkera generálním ředitelem (2007–2014), který se bude zabývat třemi zásadními problémy, kterým bioinformatika v současnosti čelí Queensland:[4]

  1. integrovaná data a vysoce výkonné výpočty v zabezpečeném prostředí
  2. dostupná šířka pásma sítě
  3. přístup k odbornému personálu

V roce 2015 se Dr. Dominique Gorse stal generálním ředitelem QFAB a vedl strategickou alianci s QCIF, Queensland Cyber ​​Infrastructure Foundation, která vyústila v fúzi obou organizací v dubnu 2016. QCIF provozuje významné vysoce výkonné výpočty, cloud computing a prostředky pro ukládání dat, je součástí národní infrastruktura elektronického výzkumu.

Queensland Cyber ​​Infrastructure Foundation

QFAB Bioinformatics je jednotka Queensland Cyber ​​Infrastructure Foundation (QCIF), a ne pro zisk členské organizace.

Členové

Přidružený člen

Galaxy Austrálie

QFAB a QCIF společně s University of Melbourne je Melbourne Bioinformatika a University of Queensland je Výzkumné výpočetní středisko společně postavené a provozované Galaxy Austrálie, což je hlavní rys virtuální laboratoře genomiky[5]založeno na Galaxy (výpočetní biologie) systém vědeckých pracovních postupů.

Reference

  1. ^ Schneider, Maria Victoria; Griffin, Philippa C; Tyagi, Sonika; Flannery, Madison; Dayalan, Saravanan; Gladman, Simon; Watson-Haigh, Nathan; Bayer, Philipp E; Charleston, Michael; Cooke, Ira; Cook, Rob; Edwards, Richard J; Edwards, David; Keř, dominique; McConville, Malcolm; Powell, David; Wilkins, Marc R; Lonie, Andrew (2008). „Zřízení distribuované národní výzkumné infrastruktury poskytující bioinformatickou podporu vědcům v biologických vědách v Austrálii“. Briefings in Bioinformatics. 20 (2): 384–389. doi:10.1093 / bib / bbx071. PMC  6433737. PMID  29106479.
  2. ^ Ragan, M. A .; Littlejohn, T .; Ross, Bruce (2008). „Výpočetní biologie a bioinformatika v genomu v Austrálii“. PLoS výpočetní biologie. 4 (8): e1000068. doi:10.1371 / journal.pcbi.1000068. PMC  2440818. PMID  18769502.
  3. ^ „Vláda Qld poskytla IMB více než 2,5 milionu dolarů na financování“. Novinky UQ. 2006. Citováno 30. května 2019.
  4. ^ „Queensland Facility for Advanced Bioinformatics (QFAB) (2006–2010)“. Výzkumníci UQ. 2006. Citováno 30. května 2019.
  5. ^ Afgan, Enis; Sloggett, Clare; Goonasekera, Nuwan; Makunin, Igor; Benson, Derek; Crowe, Mark; Gladman, Simon; Kowsar, Yousef; Bažant, Michael; Horst, Ron; Lonie, Andrew (2015). „Virtuální laboratoř Genomics: Praktický bioinformatický pracovní stůl pro cloud“. PLOS ONE. 10 (10): e0140829. doi:10.1371 / journal.pone.0140829. PMC  4621043. PMID  26501966.