Pseudomonas amygdali - Pseudomonas amygdali

Pseudomonas amygdali
Vědecká klasifikace Upravit
Doména:Bakterie
Kmen:Proteobakterie
Třída:Gammaproteobakterie
Objednat:Pseudomonadales
Rodina:Pseudomonadaceae
Rod:Pseudomonas
Skupina druhů:Pseudomonas syringae skupina
Druh:
P. amygdali
Binomické jméno
Pseudomonas amygdali
Psallidas a Panagopoulos 1975
Typ kmene
ATCC 33614

CCUG 32770
CFBP 3205
CIP 106734
DSM 7298
ICMP 3918
LMG 13184
NCPPB 2607

Pathovars

P. a. pv. aesculi
P. a. pv. amygdali
P. a. pv. ciccaronei
P. a. pv. dendropanacis
P. a. pv. eriobotryae
P. a. pv. glycinea
P. a. pv. hibisci
P. a. pv. lachrymans
P. a. pv. mellea
P. a. pv. mori
P. a. pv. morsprumorum
P. a. pv. myricae
P. a. pv. Phaseolicola
P. a. pv. photiniae
P. a. pv. sesami
P. a. pv. tabaci
P. a. pv. ulmi

Pseudomonas amygdali je Gramnegativní rostlinné patogenní bakterie.[1] Je pojmenován podle své schopnosti způsobit onemocnění mandle (Prunus amygdalus ) stromy. Různé analýzy, včetně 16S rRNA analýza,[2] Hybridizace DNA-DNA,[3] a MLST[4][5][6][7] jasně umístěné P. amygdali v P. syringae společně s druhem Pseudomonas ficuserectae a Pseudomonas meliae a 27 pathovarů z Pseudomonas syringae /Pseudomonas savastanoi, tvořící jedinou, dobře definovanou fylogenetickou skupinu, která by měla být považována za jediný druh. Tato fylogenetická skupina nebyla formálně pojmenována kvůli nedostatku spolehlivých prostředků, jak ji fenotipicky odlišit od blízce příbuzných druhů,[3] a je v současné době znám jako genomospecies 2[3] nebo fyloskupina 3.[4][5][8] Pokud je formálně pojmenován, měl by být správný název pro tento nový druh Pseudomonas amygdali,[3] který má přednost před všemi ostatními názvy taxonů z této skupiny, včetně Pseudomonas savastanoi, což je neadekvátní a matoucí název, jehož použití se nedoporučuje.[3][9]

Pathovars

Pseudomonas amygdali pv. aesculi infikuje stromy jírovce a kaštanu (rod Aesculus ).

Pseudomonas amygdali pv. amygdali byl izolován od Prunus amygdalus.

Pseudomonas amygdali pv. broussonetiae původce bakteriální plíseň moruše papírové (Broussonetia kazinoki X B. papyrifera).

Pseudomonas amygdali pv. castaneae, původce bakteriálního nádoru kaštanu (Castanea crenata Sieb. et Zucc.)[10]

Pseudomonas amygdali pv. cerasicola, původce bakteriální žluči třešní[11]

Pseudomonas amygdali pv. ciccaronei způsobuje onemocnění na rohovníku (Ceratonia siliqua ).

Pseudomonas amygdali pv. cunninghamiae způsobuje onemocnění Cunninghamia lanceolata

Pseudomonas amygdali pv. daphniphylli, původce bakteriální žluči himeyuzuriha (Daphniphyllum teijsmanni Z.)[12]

Pseudomonas amygdali pv. dendropanacis je patogenní pro Dendropanax trifidus.

Pseudomonas amygdali pv. eriobotryae infikuje mišpule (Eriobotrya japonica ).

Pseudomonas amygdali pv. fraxini[13]

Pseudomonas amygdali pv. glycinea způsobuje onemocnění sójových bobů (Glycin max ).

Pseudomonas amygdali pv. ibišek je patogenní pro Ibišek rostliny.

Pseudomonas amygdali pv. lachrymans způsobuje úhlovou listovou skvrnu okurka. Pouze určité kmeny tohoto pathovaru patří do této fylogenetické skupiny, zatímco ostatní jsou klasifikovány v genomoskupinách 3.[3][4]

Pseudomonas amygdali pv. mellea způsobuje onemocnění tabák rostliny.

Pseudomonas amygdali pv. mori je patogenní moruše stromy.

Pseudomonas amygdali pv. morsprunorum způsobuje onemocnění na třešně a švestky. Pouze určité kmeny tohoto pathovaru patří do této fylogenetické skupiny, zatímco ostatní jsou klasifikovány v genomoskupinách 3.[3][4]

Pseudomonas amygdali pv. myricae byl poprvé izolován na Myrica stromy.

Pseudomonas amygdali pv. nerii[13]

Pseudomonas amygdali pv. phaseolicola je patogenní pro fazole obecná.

Pseudomonas amygdali pv. photiniae způsobuje onemocnění Photinia druh.

Pseudomonas amygdali pv. retacarpa[13]

Pseudomonas amygdali pv. raphiolepidis

Pseudomonas amygdali pv. savastanoi[13]

Pseudomonas amygdali pv. infikuje sesami sezam rostliny.

Pseudomonas amygdali pv. tabaci způsobuje onemocnění tabák rostliny.

Pseudomonas amygdali pv. ulmi byl poprvé izolován na jilm stromy.

Reference

  1. ^ Smith, Dunez, Lelliot, Phillips and Archer (1988) European Handbook of Plant Disease. Blackwell Scientific Publications.
  2. ^ Anzai; et al. (Červenec 2000). "Fylogenetická příslušnost pseudomonád na základě 16S rRNA sekvence". Int J Syst Evol Microbiol. 50 (4): 1563–89. doi:10.1099/00207713-50-4-1563. PMID  10939664.
  3. ^ A b C d E F G Gardan, L .; Shafik, H .; Belouin, S .; Broch, R .; Grimont, F .; Grimont, P. A. D. (1999). „DNA příbuznost mezi pathovary Pseudomonas syringae a popis Pseudomonas tremae sp. Nov. A Pseudomonas cannabina sp. Nov. (Ex Sutic a Dowson 1959)“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 49 (2): 469–478. doi:10.1099/00207713-49-2-469. PMID  10319466.
  4. ^ A b C d Berge, Odile; Monteil, Caroline L .; Bartoli, Claudia; Chandeysson, Charlotte; Guilbaud, Caroline; Sands, David C .; Morris, Cindy E. (03.09.2014). „Uživatelská příručka k databázi rozmanitosti Pseudomonas syringae a její aplikace ke klasifikaci kmenů v tomto fylogenetickém komplexu“. PLOS ONE. 9 (9): e105547. Bibcode:2014PLoSO ... 9j5547B. doi:10.1371 / journal.pone.0105547. ISSN  1932-6203. PMC  4153583. PMID  25184292.
  5. ^ A b Hwang, Michael S. H .; Morgan, Robyn L .; Sarkar, Sara F .; Wang, Pauline W .; Guttman, David S. (01.09.2005). "Fylogenetická charakterizace virulence a fenotypy rezistence Pseudomonas syringae". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 71 (9): 5182–5191. doi:10.1128 / AEM.71.9.5182-5191.2005. ISSN  0099-2240. PMC  1214625. PMID  16151103.
  6. ^ Bull, Carolee T .; Clarke, Christopher R .; Cai, Rongman; Vinatzer, Boris A .; Jardini, Teresa M .; Koike, Steven T. (2011-02-15). „Multilocus Sequence Typing of Pseudomonas syringae Sensu Lato potvrzuje dříve popsané genomové druhy a umožňuje rychlou identifikaci P. syringae pv. Coriandricola a P. syringae pv. Apii způsobující bakteriální listovou skvrnu na petrželce“. Fytopatologie. 101 (7): 847–858. doi:10.1094 / PHYTO-11-10-0318. ISSN  0031-949X. PMID  21323469.
  7. ^ Parkinson, N .; Bryant, R .; Bew, J .; Elphinstone, J. (2010). "Rychlá fylogenetická identifikace členů komplexu druhů Pseudomonas syringae pomocí lokusu rpoD". Patologie rostlin. 60 (2): 338–344. doi:10.1111 / j.1365-3059.2010.02366.x.
  8. ^ Baltrus, David A .; McCann, Honor C .; Guttman, David S. (01.01.2017). "Evoluce, genomika a epidemiologie Pseudomonas syringae". Molekulární rostlinná patologie. 18 (1): 152–168. doi:10,1111 / mpp.12506. ISSN  1364-3703. PMID  27798954.
  9. ^ Young, J. M. (září 2010). „Taxonomy of Pseudomonas syringae“. Journal of Plant Pathology. 92 (1sup): S1.5 – S1.14.
  10. ^ 和 雄, 高 梨;寛 二, 清水 (1989). „ク リ か い よ う 病 を 起 こ す Pseudomonas syringae pv. Castaneae pv. Nov“. 日本 植物 病理学 会 報. 55 (4): 397–403. doi:10.3186 / jjphytopath.55.397.
  11. ^ Kamiunten, Hiroshi; Nakao, Takeharu; Oshida, Shiomi (2000-08-01). „Pseudomonas syringae pv. Cerasicola, pv. Nov., Původce bakteriální žluči třešní“. Journal of General Plant Pathology. 66 (3): 219–224. doi:10.1007 / PL00012949. ISSN  1345-2630.
  12. ^ Oginh, Choei; Kubo, Yoshibumi; Higuchi, Hiroshi; Takikawa, Yuichi (1990). "Bakteriální onemocnění žluči himeyuzuriha (Daphniphyllum teijsmanni Z.) způsobená Pseudomonas syringae pv. Daphniphylli pv. Nov". Journal of the Japanese Forestry Society. 72 (1): 17–22. doi:10.11519 / jjfs1953.72.1_17.
  13. ^ A b C d Caballo-Ponce, Eloy; Murillo, Jesús; Martínez-Gil, Marta; Moreno-Pérez, Alba; Pintado, Adrián; Ramos, Cayo (2017). „Knots Untie: Molecular Determinants podílí se na tvorbě uzlů vyvolaných Pseudomonas savastanoi v Woody Hosts“. Hranice ve vědě o rostlinách. 8: 1089. doi:10.3389 / fpls.2017.01089. ISSN  1664-462X. PMC  5478681. PMID  28680437.

externí odkazy