Rostlinná ontologie - Plant ontology
![]() | |
---|---|
Obsah | |
Popis | Rostlinná ontologie |
Typy dat zajat | Anatomie a vývoj rostlin |
Organismy | Viridiplantae |
Kontakt | |
Primární citace | Walls a kol. (2012)[1] |
Datum vydání | 2002[2] |
Přístup | |
Datový formát | OBO a SOVA |
webová stránka | http://plantontology.org |
Stáhnout URL | http://purl.obolibrary.org/obo/po.owl |
Sparql koncový bod | http://sparql.hegroup.org/sparql |
Smíšený | |
Licence | CC BY 4.0 |
Rostlinná ontologie (PO) je sbírka ontologie vyvinuté konsorciem Plant Ontology Consortium. Tyto ontologie popisují anatomické struktury a růstové a vývojové fáze napříč Viridiplantae.[2][3][4][5][6][7] Objednávka je určena pro více aplikací, včetně genetika, genomika, fenomény, a rozvoj, taxonomie a systematičnost, sémantické aplikace a vzdělání.[1][8]
Členové projektu
- Oregonská státní univerzita
- Newyorská botanická zahrada
- L. H. Bailey Hortorium na Cornell University
- Ensembl
- SoyBase
- SSWAP
- SGN
- Gramen
- Informační zdroj Arabidopsis (TAIR)
- KukuřiceGDB
- University of Missouri v St. Louis
- Botanická zahrada v Missouri
Viz také
Reference
- ^ A b Walls, R.L .; Athreya, B .; Cooper, L .; Elser, J .; Gandolfo, M. A .; Jaiswal, P .; Mungall, C. J .; Preece, J .; Rensing, S .; Smith, B .; Stevenson, D. W. (2012). „Ontologie jako integrační nástroje pro vědu o rostlinách“. American Journal of Botany. 99 (8): 1263–1275. doi:10.3732 / ajb.1200222. PMC 3492881. PMID 22847540.
- ^ A b The Plant Ontology Consortium, C. (2002). „The Plant Ontology ™ Consortium and Plant Ontologies“. Srovnávací a funkční genomika. 3 (2): 137–142. doi:10,1002 / srov.154. PMC 2447263. PMID 18628842.
- ^ Ilic, Katica (2008). Albert, Burger (ed.). Plant Structure Ontology (PSO) - morfologická a anatomická ontologie kvetoucích rostlin. Springer. 27–42. Citováno 22. srpna 2012.
- ^ Avraham, S .; Tung, C.-W .; Lížu.; Jaiswal, P .; Kellogg, E. A .; McCouch, S.; Pujar, A .; Reiser, L .; Rhee, S. Y .; Sachs, M. M .; Schaeffer, M .; Stein, L .; Stevens, P .; Vincent, L .; Zapata, F .; Ware, D. (2007). „Databáze rostlinné ontologie: Komunitní zdroj pro řízenou slovní zásobu a anotace o struktuře rostlin a vývojových fázích“. Výzkum nukleových kyselin. 36 (Problém s databází): D449 – D454. doi:10.1093 / nar / gkm908. PMC 2238838. PMID 18194960.
- ^ Lížu.; Kellogg, E. A .; Jaiswal, P .; Zapata, F .; Stevens, P. F .; Vincent, L. P .; Avraham, S .; Reiser, L .; Pujar, A .; Sachs, M. M .; Whitman, N. T .; McCouch, S. R .; Schaeffer, M.L .; Ware, D. H .; Stein, L. D .; Rhee, S. Y. (2006). „Ontologie struktury rostlin, jednotný slovník anatomie a morfologie kvetoucích rostlin“. Fyziologie rostlin. 143 (2): 587–599. doi:10.1104 / str. 106.092825. PMC 1803752. PMID 17142475.
- ^ Pujar, A .; Jaiswal, P .; Kellogg, E. A .; Lížu.; Vincent, L .; Avraham, S .; Stevens, P .; Zapata, F .; Reiser, L .; Rhee, S. Y .; Sachs, M. M .; Schaeffer, M .; Stein, L .; Ware, D .; McCouch, S. (2006). „Celostátová růstová ontologie pro krytosemenné rostliny a její aplikace v biologii rostlin“. Fyziologie rostlin. 142 (2): 414–428. doi:10.1104 / str. 106.085720. PMC 1586063. PMID 16905665.
- ^ Jaiswal, P .; Avraham, S .; Lížu.; Kellogg, E. A .; McCouch, S .; Pujar, A .; Reiser, L .; Rhee, S. Y .; Sachs, M. M .; Schaeffer, M .; Stein, L .; Stevens, P .; Vincent, L .; Ware, D .; Zapata, F. (2005). „Plant Ontology (PO): A Controlled Vocabulary of Plant Structures and Growth Stages“. Srovnávací a funkční genomika. 6 (7–8): 388–397. doi:10,1002 / srov.496. PMC 2447502. PMID 18629207.
- ^ "Informační přetížení v době" velkých dat "'". Věda denně. Citováno 23. srpna 2012.
externí odkazy
![]() | Tento botanika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |