Flebovirus - Phlebovirus
Flebovirus | |
---|---|
Prototypový flebovirus virion a organizace genomu. | |
Klasifikace virů | |
(bez hodnocení): | Virus |
Oblast: | Riboviria |
Království: | Orthornavirae |
Kmen: | Negarnaviricota |
Třída: | Ellioviricetes |
Objednat: | Bunyavirales |
Rodina: | Phenuiviridae |
Rod: | Flebovirus |
Zadejte druh | |
Flebovirus s horečkou v údolí Rift | |
Druh | |
Flebovirus je jedním ze čtyř rodů čeledi Phenuiviridae v pořadí Bunyavirales. Rod v současné době zahrnuje 60 druhů.[1] Od toho odvozuje svůj název Phlebotominae, vektory členských druhů Sandfly fever Neapolský phlebovirus, o kterém se říká, že je nakonec z řecký phlebos, což znamená „žíla“.[2] Správné slovo pro „žílu“ ve starověké řečtině však je phleps (φλέψ).[3]
Virologie
Fleboviry jsou viry s RNA negativního smyslu genom skládající se ze tří segmentů. Malý segment (S) kóduje virový N protein a nestrukturní protein, NS prostřednictvím ambisense kódovací strategie. Středně velký segment (M) kóduje prekurzor virových glykoproteinů a nestrukturálních složek. Produktem největšího segmentu (L) je virová RNA-dependentní RNA polymeráza.[4]
Klinický význam
S chorobami u lidí bylo spojeno následujících dvanáct virů: Virus Alenquer,[5] Virus Bhanja,[6] Virus Candiru,[7] Virus Chagres, Virus Neapol, Virus Punta Toro, Horečka v údolí Rift, Sicilský virus, Virus Toscana, Virus Uukuniemi, Virus srdce[8] (první flebovirus přenášený klíšťaty, o kterém je známo, že způsobuje onemocnění na západní polokouli, objeven v roce 2009) a Virus Sandfly Turkey (objeveno v Číně v roce 2011).[9] Způsobují příznaky od krátkých horeček, které se samy omezují, jako např horečka pappataci, do encefalitida a fatální hemoragická horečka.
Taxonomie
Rozeznávají se tyto druhy:[1]
- Adana phlebovirus
- Aguakujte flebovirus
- Flebovirus Alcube
- Alenquer phlebovirus
- Ambe phlebovirus
- Anhanga phlebovirus
- Arumowot phlebovirus
- Buenaventura phlebovirus
- Bujaru phlebovirus
- Kakaový flebovirus
- Campana phlebovirus
- Candiru phlebovirus
- Chagresův flebovirus
- Clebový flebovirus
- Dashli flebovirus
- Durania phlebovirus
- Nabijte flebovirus
- Frijolesův flebovirus
- Gabekův flebovirus
- Gordil phlebovirus
- Icoaraci phlebovirus
- Itaituba phlebovirus
- Itaporanga phlebovirus
- Ixcanální flebovirus
- Karimabádský flebovirus
- La Gloria phlebovirus
- Lara phlebovirus
- Leticia phlebovirus
- Maldonado phlebovirus
- Massilia phlebovirus
- Medjerda phlebovirus
- Mona Grita phlebovirus
- Mukawa phlebovirus
- Munguba phlebovirus
- Neapolský flebovirus
- Nique phlebovirus
- Ntepes phlebovirus
- Odrenisrou phlebovirus
- Oriximina phlebovirus
- Flebovirus Pena Blanca
- Punique phlebovirus
- Flebovirus Punta Toro
- Flebovirus s horečkou v údolí Rift
- Rio Grande phlebovirus
- Svatý Floris phlebovirus
- Salanga phlebovirus
- Salehabadský phlebovirus
- Salobo phlabovirus
- Sicilský flebovirus
- Tapara phlebovirus
- Teheránský flebovirus
- Tico febovirus
- Flebovirus Toros
- Flebovirus Toscana
- Tres Almendras phlebovirus
- Turuna phlebovirus
- Uriurana phlebovirus
- Urucuri phlebovirus
- Viola phlebovirus
- Zerdali phlebovirus
Od roku 2015[Aktualizace]V rámci fleboviru existují tři genetické skupiny flebovirů přenášených klíšťaty: skupina SFTS, skupina Bhanja a skupina Uukuniemi.[10] Byla popsána čtvrtá skupina.[11]
Séroskupiny
Existuje několik uznávaných serokomplexů
Bhanja sérokomplex
Candiru serocomplex
Frijolesův sérokomplex
Sérokomplex Salehabad
Serokomplex s písečnou horečkou
Serocomplex sandfly je rozdělen do dvou skupin: Neapol a Sicilian
- Sandfly fever Neapolská skupina
- Písečná sicilská skupina
- Virus Belterra
- Virus Chagres
- Virus na Korfu
- Virus horečky Rift Valley
- Kyperský virus písečné horečky
- Písečná horečka sicilský virus
- Virus turecké horečky sandfly
Sérokomplex Punta Toro
Uukuniemi serocomplex
- Virus Albatross Island
- Chyťte jeskynní virus
- Virus Grand Arbaud
- Virus Henan Fever[12]
- Virus Guertu
- Virus srdce
- Khasan virus
- Virus Komandory
- Virus Malsoor
- Virus Manawa
- Virus Rukutama
- Murre virus skupina
- Virus Precarious Point
- Těžká horečka s virem syndromu trombocytopenie
- Skupina virů Uukuniemi
Komplex viru Kaisodi
Jiné viry
- Virus amerického psa
- Blacklebed tick phlebovirus
- Virus osamělé hvězdy
- Virus Mukawa
- Tichomořské pobřeží Klíště phlebovirus
- Virus Shibuyunji
- Virus South Bay
Reference
- ^ A b „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 7. května 2020.
- ^ „9. zpráva ICTV (2011) Bunyaviridae". Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 31. ledna 2019.
Phlebo: označuje flebotominové vektory virů skupiny horečky písečných; Řecké phlebos, „žíly“.
- ^ Liddell, H.G. a Scott, R. (1940). Řecko-anglický lexikon. Revidováno a rozšířeno v celém textu sirem Henrym Stuartem Jonesem. S pomocí Rodericka McKenzie. Oxford: Clarendon Press.
- ^ Modrow, Susanne; Falke, Dietrich; Truyen, Uwe; Schätzl, Hermann. Molekulární virologie. Springer. str. 460. ISBN 978-3-642-20718-1.
- ^ Travassos da Rosa AP, Tesh RB, Pinheiro FP, Travassos da Rosa JF, Peterson NE (1983). „Charakterizace osmi nových séroskupinových arbovirů s horečkou phlebotomus (Bunyaviridae: Phlebovirus) z oblasti Amazonky v Brazílii“. Dopoledne. J. Trop. Med. Hyg. 32 (5): 1164–71. doi:10.4269 / ajtmh.1983.32.1164. PMID 6312820.
- ^ Vesenjak-Hirjan J, Calisher CH, Beus I. Marton E. První přirozená klinická infekce lidským virem Bhanja, s. 297–301. 1980. In Vesenjak-Hirjan J, Porterfield JS, Arslanagí, c E (ed), Arboviry ve středomořských zemích: 6. symposium FEMS. Fischer, Stuttgart, Německo.
- ^ Palacios, Gustavo; Tesh, Robert; Travassos da Rosa, Amelia; Savji, Nazir; Sze, Wilson; Jain, Komal; Serge, Robert; Guzman, Hilda; Guevara, Carolina; Nunes, Marcio; Nunes-Neto, Joaquim; Kochel, Tadeusz; Hutchinson, Stephen; Vasconcelos, Pedro; Lipkin, Ian (2011). „Charakterizace antigenního komplexu Candiru (Bunyaviridae: Phlebovirus), velmi rozmanité a přeuspořádávající se skupiny virů působících na člověka v tropické Americe“. Journal of Virology. 85 (8): 3811–20. doi:10.1128 / JVI.02275-10. PMC 3126144. PMID 21289119.
- ^ Savage, HM; Godsey, MS; Lambert, A; Panella, NA; Burkhalter, KL; Harmon, JR; Lash, RR; Ashley, DC; Nicholson, WL (2013). „První detekce viru srdce (Bunyaviridae: Phlebovirus) u polních členovců“. Dopoledne. J. Trop. Med. Hyg. 89 (3): 445–52. doi:10.4269 / ajtmh.13-0209. PMC 3771279. PMID 23878186.
- ^ Yu, X. J .; Liang, M. F .; Zhang, S. Y .; Liu, Y .; Li, J. D .; Sun, Y. L .; Zhang, L .; Zhang, Q. F .; Popov, V. L .; Li, C .; Qu, J .; Li, Q .; Zhang, Y. P .; Hai, R .; Wu, W .; Wang, Q .; Zhan, F. X .; Wang, X. J .; Kan, B .; Wang, S. W .; Wan, K. L .; Jing, H. Q .; Lu, J. X .; Yin, W. W .; Zhou, H .; Guan, X. H .; Liu, J. F .; Bi, Z. Q .; Liu, G. H .; Ren, J. (2011). „Horečka s trombocytopenií spojená s románem Bunyavirus v Číně“. New England Journal of Medicine. 364 (16): 1523–1532. doi:10.1056 / NEJMoa1010095. PMC 3113718. PMID 21410387.
- ^ Matsuno, K; Weisend, C; Kajihara, M; Matysiak, C; Williamson, BN; Simuunza, M; Mweene, AS; Takada, A; Tesh, RB; Ebihara, H (leden 2015). „Komplexní molekulární detekce flebovirů přenášených klíšťaty vede k retrospektivní identifikaci taxonomicky nepřidělených bunyavirů a objevení nového člena rodu flebovirů“. J Virol. 89 (1): 594–604. doi:10.1128 / JVI.02704-14. PMC 4301164. PMID 25339769.
- ^ Matsuno, K; Weisend, C; Kajihara, M; Matysiak, C; Williamson, BN; Simuunza, M; Mweene, AS; Takada, A; Tesh, RB; Ebihara, H (2015). „Komplexní molekulární detekce flebovirů přenášených klíšťaty vede k retrospektivní identifikaci taxonomicky nepřidělených bunyavirů a objevení nového člena rodu flebovirů“. J Virol. 89 (1): 594–604. doi:10.1128 / JVI.02704-14.
- ^ Xu, B .; Liu, L .; Huang, X .; Ma, H .; Zhang, Y .; Du, Y .; Wang, P .; Tang, X .; Wang, H .; Kang, K .; Zhang, S .; Zhao, G .; Wu, W .; Yang, Y .; Chen, H .; Mu, F .; Chen, W. (2011). Palacios, Gustavo (ed.). „Metagenomická analýza horečky, trombocytopenie a syndromu leukopenie (FTLS) v provincii Henan v Číně: Objev nového buněčného viru“. PLOS patogeny. 7 (11): e1002369. doi:10.1371 / journal.ppat.1002369. PMC 3219706. PMID 22114553.
externí odkazy
- Garry CE, Garry RF (2004). „Proteomické výpočetní analýzy naznačují, že karboxylové koncové glykoproteiny Bunyavirů jsou virový fúzní protein třídy II (beta-penetrény)“. Theor Biol Med Model. 1: 10. doi:10.1186/1742-4682-1-10. PMC 535339. PMID 15544707.
- Kurz BS335: Virologie
- Liu DY, Tesh RB, Travassos Da Rosa AP, Peters CJ, Yang Z, Guzman H, Xiao SY (2003). „Fylogenetické vztahy mezi členy rodu Phlebovirus (Bunyaviridae) na základě částečných analýz sekvence M segmentu“. J. Gen. Virol. 84 (Pt 2): 465–73. doi:10.1099 / vir.0.18765-0. PMID 12560581.
- Viralzone: Phlebovirus