PYLIS downstream sekvence - PYLIS downstream sequence - Wikipedia

Sekvence inzerce pyrrolysinu 1
	Předpovězeno sekundární struktura RNA PYLIS 1.
Identifikátory
Symbol	PYLIS 1
Rfam	RF01982
Další údaje
RNA typ	Cis-regulační prvek
Domény	Archaea
PDB struktur	PDBe

V biologii je PYLIS downstream sekvence (PYLIS: pyrrolysine ivložení sekvence) je kmenová smyčka struktura, která se na některých objevuje mRNA sekvence. Tento strukturální motiv dříve se předpokládalo, že způsobuje UAG (oranžová) stop kodon k překladu do aminokyselina pyrrolysin místo ukončení proteinového překladu.^[1]^[2]^[3] Ukázalo se však, že PYLIS nemá žádný vliv na účinnost potlačení UAG,^[4] tudíž i jeho název je ve skutečnosti nesprávný.

Viz také

Prvek SECIS

Reference

^ Namy O, Rousset JP, Napthine S, Brierley I (2004). "Přeprogramované genetické dekódování v expresi buněčných genů". Molekulární buňka. 13 (2): 157–168. doi:10.1016 / S1097-2765 (04) 00031-0. PMID 14759362.
^ Théobald-Dietrich A, Giegé R, Rudinger-Thirion J (2005). „Důkazy o existenci vlásenkového prvku odpovědného za inzerci pyrrolysinu závislou na ribosomu do proteinů v mRNA“. Biochimie. 87 (9–10): 813–817. doi:10.1016 / j.biochi.2005.03.006. PMID 16164991.
^ Zhang Y, Baranov PV, Atkins JF, Gladyshev VN (květen 2005). „Pyrrolysin a selenocystein používají odlišné dekódovací strategie“. J. Biol. Chem. 280 (21): 20740–20751. doi:10,1074 / jbc.M501458200. PMID 15788401.
^ Namy, Olivier; Zhou, Yu; Gundllapalli, Sarath; Polycarpo, Carla R .; Denise, Alain; Rousset, Jean-Pierre; Söll, Dieter; Ambrogelly, Alexandre (listopad 2007). "Přidání pyrrolysinu do Escherichia coli genetický kód". FEBS Dopisy. 581 (27): 5282–5288. doi:10.1016 / j.febslet.2007.10.022. PMID 17967457.

Další čtení

Longstaff DG, Blight SK, Zhang L, Green-Church KB, Krzycki JA (leden 2007). "In vivo kontextové požadavky na překlad UAG jako pyrrolysinu ". Mol. Microbiol. 63 (1): 229–241. doi:10.1111 / j.1365-2958.2006.05500.x. PMID 17140411.
Theil Have, C; Zambach, S; Christiansen, H (4. dubna 2013). „Účinky využití kódovacího potenciálu, zachování sekvence a zachování struktury mRNA pro predikci genů obsahujících pyrrolysin“. BMC bioinformatika. 14 (1): 118. doi:10.1186/1471-2105-14-118. PMC 3639795. PMID 23557142.

externí odkazy

Stránka pro sekvenci inzerce pyrrolysinu 1 na Rfam

Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid14759362-1] Namy O, Rousset JP, Napthine S, Brierley I (2004). "Přeprogramované genetické dekódování v expresi buněčných genů". Molekulární buňka. 13 (2): 157–168. doi:10.1016 / S1097-2765 (04) 00031-0. PMID 14759362.

[pmid16164991-2] Théobald-Dietrich A, Giegé R, Rudinger-Thirion J (2005). „Důkazy o existenci vlásenkového prvku odpovědného za inzerci pyrrolysinu závislou na ribosomu do proteinů v mRNA“. Biochimie. 87 (9–10): 813–817. doi:10.1016 / j.biochi.2005.03.006. PMID 16164991.

[pmid15788401-3] Zhang Y, Baranov PV, Atkins JF, Gladyshev VN (květen 2005). „Pyrrolysin a selenocystein používají odlišné dekódovací strategie“. J. Biol. Chem. 280 (21): 20740–20751. doi:10,1074 / jbc.M501458200. PMID 15788401.

[4] Namy, Olivier; Zhou, Yu; Gundllapalli, Sarath; Polycarpo, Carla R .; Denise, Alain; Rousset, Jean-Pierre; Söll, Dieter; Ambrogelly, Alexandre (listopad 2007). "Přidání pyrrolysinu do Escherichia coli genetický kód". FEBS Dopisy. 581 (27): 5282–5288. doi:10.1016 / j.febslet.2007.10.022. PMID 17967457.

[1]

[2]

[3]

[4]