PUM1 - PUM1

PUM1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1IB2, 1M8W, 1M8X, 1M8Y, 1M8Z, 2YJY, 3BSB, 3BSX, 3Q0L, 3Q0M, 3Q0N, 3Q0O, 3Q0P
Identifikátory
Aliasy	PUM1, HSPUM, PUMH, PUMH1, PUML1, pumilio RNA vazebný člen rodiny 1, SCA47
Externí ID	OMIM: 607204 MGI: 1931749 HomoloGene: 22830 Genové karty: PUM1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	31,065,991 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• mRNA 3'-UTR vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • miRNA vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • P-tělo; • Stresová granule; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• regulace umlčování genů miRNA; • diferenciace buněk; • regulace stability mRNA; • pohybové chování dospělých; • pozitivní regulace umlčování genů miRNA; • diferenciace kmenových buněk; • regulace buněčného cyklu; • umlčení posttranskripčního genu; • regulace segregace chromozomů; • pozitivní regulace signální dráhy RIG-I; • Destabilizace mRNA; • spermatogeneze; • regulace překladu; • posttranskripční regulace genové exprese; • produkce miRNA zapojených do umlčování genů miRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9698
	80912
	ENSG00000134644
	ENSMUSG00000028580
	Q14671
	Q80U78
	NM_014676; NM_001020658
	NM_001159603; NM_001159604; NM_001159605; NM_001159606; NM_030722
	NP_001018494; NP_055491
NP_001153075; NP_001153076; NP_001153077; NP_001153078; NP_109647;
	NP_001343493; NP_001343494; NP_001343495
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homolog Pumilio 1 je protein že u lidí je kódován PUM1 gen.^[4]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny PUF, evolučně konzervované Proteiny vázající RNA související s proteiny Pumilio z Drosophila a proteiny vazebného faktoru mRNA fem-3 z C. elegans. Kódovaný protein obsahuje sekvenčně specifickou vazebnou doménu RNA složenou z osmi repetící a N- a C-koncových ohraničujících oblastí a slouží jako překladový regulátor specifických mRNA vazbou na jejich 3 'nepřekládané oblasti. Evolučně konzervovaná funkce kódovaného proteinu u bezobratlých a nižších obratlovců naznačuje, že lidský protein může být zapojen do translační regulace embryogeneze a vývoj a diferenciace buněk. Alternativně sestřih byly popsány varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[4]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134644 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PUM1 pumilio homolog 1 (Drosophila)“.

Další čtení

Spassov DS, Jurecic R (2004). „Rodina PUF proteinů vázajících RNA: rovná se evolučně konzervovaná struktura konzervativní funkci?“. IUBMB Life. 55 (7): 359–66. doi:10.1080/15216540310001603093. PMID 14584586.
Nagase T, Miyajima N, Tanaka A a kol. (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. III. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0081-KIAA0120) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (1): 37–43. doi:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Wang X, Zamore PD, Hall TM (2001). "Krystalová struktura homologie domény Pumilio". Mol. Buňka. 7 (4): 855–65. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00229-5. PMID 11336708.
Wang X, McLachlan J, Zamore PD, Hall TM (2002). "Modulární rozpoznávání RNA lidskou pumilio-homologickou doménou". Buňka. 110 (4): 501–12. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00873-5. PMID 12202039.
Spassov DS, Jurecic R (2003). „Klonování a komparativní sekvenční analýza genů PUM1 a PUM2, lidských členů rodiny Pumilio proteinů vázajících RNA“. Gen. 299 (1–2): 195–204. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 01060-0. PMID 12459267.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Dazard JE, Gal H, Amariglio N a kol. (2003). „Srovnání reakcí lidského keratinocytů a spinocelulárních buněk na ozařování UVB v celém genomu: důsledky pro rakovinu kůže a epitelu“. Onkogen. 22 (19): 2993–3006. doi:10.1038 / sj.onc.1206537. PMID 12771951.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Jordanova A, Irobi J, Thomas FP a kol. (2006). "Narušená funkce a axonální distribuce mutantní tyrosyl-tRNA syntetázy v dominantní intermediární neuropatii Charcot-Marie-Tooth". Nat. Genet. 38 (2): 197–202. doi:10.1038 / ng1727. PMID 16429158.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134644 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: PUM1 pumilio homolog 1 (Drosophila)“.

[1]

[2]

[3]

[4]